Синтез, структура полипептидов регулярного строения, содержащих лизин, орнитин, цитруллин, и их взаимодействие с ДНК тема автореферата и диссертации по химии, 02.00.10 ВАК РФ

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

- структурные особенности полипептидов и полипептидных цепей белковых молекул.(С использованием КД,

ДОВ и ЭПР спектроскопии

- полипептиды регулярного строения как модели белков и их взаимодействие с ДНК.

ГЛАВА II. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

1. Синтез 2,4,5 - трихлорфениловых эфиров трипепти -дов с последовательностью аминокислот А1а-0гп--X, где X - глицин, аланин, глутаминовая кис лота, лизин, орнитин.

2. Синтез 2,4,5 - трихлорфениловых эфиров трипеп -тидов с последовательностью аминокислот ЙУ - X где X - лизин, орнитин, цитруллин.

3. Полжконденсация 2,4,5 - трихлорфениловых эфи ров трипептидов

4. Изучение бактерицидных свойств полипептидов

5. Структурные особенности полипептидов , модели -рующие основные свойства концевых участков различных гистонов

6. Изучение конформационной подвижности полипеп -тидов,(01у-Огп-01у)п,(А1а-Огг1--А1а)п и методом спиновых меток

7. Исследование взаимодействия полипептидов (Сг1у

Огп - и (А1а-0т-А1а)и с ДНК.

ГЛАВА III. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ.III

1. Синтез метиловых эфиров N -ацилпептидов

2. Синтез N -ацилпептидов

3. 2,4,5 - Трихлофениловые эфиры N -ацилпептидов. 1ГБ

4. Галоидгидраты и трифторацетаты 2,4,5 - три -хлорфениловых эфиров пептидов.

5. Синтез регулярных N -Z - полипептидов ме тодом активированных эфиров.

6. Полипептиды.

7. Определение оптической частоты полипептида.

А1а-0гп-А1а)п

8. Синтез спин-меченых полипептидов и исследование их методом ЭПР.

ВЫВОДЫ .Щ

Фундаментальной проблемой современной молекулярной биологии является изучение специфики взаимодействия нуклеиновых кислот с белками и полипептидами. Этот процесс сложен и во многом определяется структурной организацией белка или полипептида. Поэтому одним из подходов для изучения этого процесса является использование модельных соединений, в частности, регулярных полипептидов, имеющих заданное чередование аминокислотных остатков.

Такие полипептиды, содержащие основные аминокислоты, могут моделировать, в частности N - и С-концевые участки ядерных белков-гистонов,взаимодействующих с ДНК.Исследование ДНК-гистоновых взаимодействий с помощью полипептидов имеет отношение к решению некоторых проблем,связанных со структурной организацией хроматина и его функционирования на молекулярном уровне.

Регулярные полипептиды широко и эффективно используют при изучении структуры и функции ряда белков и полипептидов. Достаточно указать на успехи в установлении структуры таких фибриллярных белков как коллаген, фиброин шелка и другие.

В последние годы особый интерес представляют гистоновые белки,особенностью которых является высокое содержание основных аминокислотных остатков таких как лизин,аргинин.Своеобразие распределения этих аминокислот по полипептидной цепи гистонов, с одной стороны, и важнейшая структуро-организующая роль этих белков в комплексообразовании с ДНК,с другой стороны,привлекло внимание исследователей как удобный объект для использования полипептидных моделей при изучении белок-нуклеиновых взаимодействий.

Рассматривая в целом задачу взаимодействия полипептидов с ДНК,, мы концентрировали также свое внимание на следующих моментах. Первое - каковы структурные особенности регулярных полипептидов, содержащих такие аминокислоты как орнитин и цит-руллин, являющиеся ближайшими аналогами лизина и второе - как такие соединения будут участвовать в образовании комплексов с ДНК.

Таким образом, перед нами стояла задача синтезировать полипептиды регулярного строения, содержащие основные аминокислоты: лизин, орнитин, цитруллин, изучить их свойства, структурные особенности и исследовать их взаимодействие с ДНК. Наличие в полипептидах основных аминокислот с различными боковыми радикалами позволило бы оценить их вклад во взаимодействие с ДНК.

Нами синтезированы восемь (из них шесть ранее не описанных в литературе) полипептидов регулярного строения(методом активированных эфиров)с молекулярными массами 5000-10000 дальтон, с последовательностью аминокислотСг1у-Х-0-1у , где Х-лизин, орнитин и цитруллин, моделирующие основные свойства

-концевых фрагментов гистонов Н2А [I] и Н4 [2,3] и полипептиды (АЬа-Огп-Х)^ , где Х-глицин, аланин, глутаминовая кислота, лизин и орнитин, моделирующие С-концевую половину гистона НХ [4] , ответственные за взаимодействие с ДНК.

Как сказано выше, наряду с остатками лизина, мы использовали такие аминокислоты как орнитин и цитруллин. Дело в том, что являясь билжайшими аналогами лизина, они отсутствуют в природных гистонах. В этом отношении было интересно исследовать их структурно-функциональное поведение в составе полипептидов и попытаться найти в чем выражается их специфика. Все это представляет интерес с точки зрения выявления общих б зезакономерностей белок-нуклеиновых взаимодействий.

Исследования структурных особенностей этих полипептидов меметодами КД-, Д0В-, ЭПР- спектроскопии позволили показать, что в в условиях близких к физиологическим, полипептиды способны принанимать в основном, конформацию вытянутой левой спирали.

Впервые показано, что в отличие от лизиновых остатков, ор-нинитиновый остаток приводит к образованию менее выраженной лево-спспиральной конформации, а остаток цитруллина более того стимули-рурует образование $ - структуры.

Обнаружены и различия конформационных возможностей двух ГРгрупп полипептидов ( глицин- и аланин-содержащих).

Проведено изучение комплексов ДНК с полипептидами двух гргрупп с использованием методов КД, гидродинамического, светорас-сесеяния и термального плавления. Показано, что с изменением их сособственной структуры в составе комплекса и локальных параметров втвторичной структуры ДНК, по разному проявляется тенденция комп-лелексов к агрегации.

Показано, что синтезированные нами лизин- и орнитин-содержа-ЩИщие полипептиды проявляют бактерицидные свойства по отношению к итштамму бактерий ошг^м^.

Считаю своим долгом выразить сердечную благодарность своим ненаучным руководителям В.К.Буриченко и В.А.Шибневу за руководство и ¡и постоянное внимание к моей работе.

Выражаю благодарность сотруднику института цитологии АН ЭД'СССР, кандидату физико-математических наук Е.И.Рамм за проведение со]совместных работ по исследованию структуры полипептидов.

Глубоко признательна академику АН Тадж.ССР, доктору техни-заческих наук П.М.Соложенкину и Ю.Д.Ахмедову за постоянную консуль^ Ротацию и помощь в проведении совместных работ по ЭПР-спектро-скопии.

От всей души благодарю коллектив лаборатории химии природных соединений им. К.Т.Порошина за постоянное внимание и помощь при выполнении данной работы.

Диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, обсуждения результатов, главы "экспериментальная часть" , выводов и приложения.

выводы

I. Синтезированы полипептиды регулярного строения, содержащие основные аминокислоты - лизин, орнитин, цитруллин, с последовательностью аминокислот двух типов. Первая группа

2. Исследованы структурные особенности синтезированных полипептидов в широком диапазоне условий и показано, что в условиях близких к физиологическим они принимают в основном конформацию вытянутой левой спирали, стабилизация которой осуществляется молекулами воды. Нейтрализация зарядов или их экранировка ионами соли увеличивает дефектность левоспи-ральной конформации, но не приводит к ее разрушению или переходу в другую упорядоченную структуру.

3. Впервые изучены структурно-функциональные поведения полипептидов, содержащих орнитин и цитруллин.

Показано, что в отличие от лизиновых остатков, орнитино-вый остаток приводит к образованию менее стабильной левоспи-ральной конформации. А остаток цитруллина стимулирует обра

4. Обнаружены различия конформационных возможностей двух групп полипептидов. Показано, что аланин-содержащие полипептиды могут частично принимать оС -спиральную конформацию, которая стабилизируется при понижении температуры, а для гли-цин-содержащих полипептидов понижение температуры в тех же условиях приводит к стабилизации вытянутой левой спирали. Конформация полипептидов зависит от характера и свойств, входящих в него аминокислотных остатков.

5. Показано, что различия в конформационных потенциях полипептидов проявляются и при взаимодействии с ДНК.

Глицин-содержащие полипептиды мало меняют структуру в составе комплекса и не меняют локальных параметров вторичной структуры ДНК лучше защищая ее двойную спираль от температурного воздействия.

Аланин-содержащие полипептиды с их частичной о£-спирали-зацией приводят к внутримолекулярной компактизации ДНК с искажением локальных параметров ее двойной спирали. Увеличение содержания полипептидов в комплексах приводит к агрегации с большей тенденцией у аланин-содержащих полипептидов.

6. Показано, что лизин и орнитин содержащие полипептиды обладают бактерицидными свойствами по отношению к штамму бакте~ рий Staphylococcus aureus

1. Sautiere P., Tyron В., Laine В., Mizon J., Lambelin-Breyna-ert M.D., Huff in P., Biserte G. Structure primaire de 1 his-tone riche en arginine et en lysine du thymus de veau. C.R. Acad.Sci., 1972, 274, 1422.

2. Delange R.J., Pambrough D.M., Smith E.L., Bonner J. Calf and pea hist one IY. II. The complete amino acid sequence of calf thymus histone IV; presence of £ -N-acetyllysine. J.Biol. Chem., 1969, 244, 319.

3. DeLange E.G., Fambrough D.M., Smith E.L., Bonner J., Calf and pea histone 17. III. Complete amino aoid sequence of pea seedlig histone IV; comparison with the homologous oulf thymus histone. J.Biol. Chem.,1969, ¿44,5669.

4. Jones G.M., The 1wall, Rail S.C., Cole R.D. Extension of the amino acid sequence of a lysine-rich histone. J. Biol. Chem., 1974, ¿45,2548.5* Митин Ю.В., Запевалова Н.П., Методы синтеза пептидов. Успехи химии, 1977, 46, 5, 852-877.

5. The peptides analysis, synthesis, biology. Edited by Gross and J .Me inhoffer, Academic Press, 1979, V.I, 421.

6. The Chemistry of Polypeptides. Edited by P.G.Katsoyannis. Plenum Press Hew York London 1973, 462 .

7. DeLange R.J., Smith E.L. Histones: structure and function. Ann. Rev. Biochem., 1971, 4o, 279.

8. Sperling R., Wachtel E.J. The Histones. In "Advances in protein chemistry", Edited by Anfinsen C.B., Edsall J.Т., Ri -chards P.M., Academic Press, 1981, V.34, pp 1-60.

9. Поносян Г.А. Структура и функции гистонов. Ереван, 1978,,1. Нт1)ф

10. Веллюз Л., Легран М.,Грожан М. Оптический круговой дих -роизм. Изд. "Мир", М., 1967, 318,

11. Leach S.J., He me thy G., Scheraga H.A. Computation of the Sterically Allowed Conformations of Peptides. Biopolymers, 1966, 4, 369. f

12. Sarkar P., Doty P. The optical rotatory properties of the tß-configuration in polypeptides and proteins. Proc. Nat. Acad. Sei. USA,1966, 55, 4, 981-989.

13. Tovmend R.,Kumosinski T.F., Timashegf S.N., Pasman G.D., Davidson B. The Circular Dichroism of the JB Structure of Poly-L-Iysine. Biochem.Biophys. Res. Comm. 1966, 23, 163.

14. Blout E,R., Carver I.P., Gross J. Intrinsic Cotton Effects in Collagen and Poly-L-proline. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 644.

15. Tiffany M.L., Krimm S. Effect of Temperature on the Circular Dichroism Spectra of Polypeptides in the Extended State. Biopolymers, 1972, JEI, 2309.

16. Krimm S., Mark J.E., Tiffany M.L. Influence of Counterious on the Helical Conformations of Charged Polypeptide Chains. Biopolymers,1969, 8, 695-697.

17. Tiffany M.L. Krimm S. Circular Dichroism of the "Random" Polypeptide Chain. Biopolymers, 1969, 8, 3, 347.

18. Tiffany M.L., Krimm S. Circular Dichroism of Poly-L-proline in an Unordered Conformation. Biopolymers, 1968, 6, 1767.

19. Лазарев Ю. А.,Лобачев В.М.,Есипова Н.Г.»Гречишко В.С.,Шиб-нев В.А. В сб.¡Материалы III Всесоюзного симпозиума по химии пептидов и белков. Киев, 1974, 81.

20. Krimm S., Tiffany M.L., The Circular dichroism spectrum.and Struoture of Unordered Polypeptides and Proteins. Israel. J. of Chem.,1974, 71, 189.

21. Tiffany M.L., Krimm S. Circular Dichroism of the "Random" Polypeptide. Biopolymers, 1969, 8, 347-359.

22. Rippon W.B., Walton A.G. Optical Properties of the Poly -glycine II Helix. Biopolymers, 1971, lb, 1207.

23. Макаров А.А., Есипова H.Г.,Панков Ю.А.»Гришковский Б.A.,JIo-бачев JI.B.»Сухомудренко А.Г.,Конформационные особенности липотропного гормона и его фрагментов. Молек. биол.1976,10,704.

24. Krimm S., Mark J.E. Conformations of Polypeptides with Ionized Side Chains of Equal Length. Proc. Nat. Acad. Sci., USA, 1968, 60, 1122.

25. Aebersold D., Pysh E.S. Optical Properties of Amorphous Polypeptides. I. One State Solutions. J.Chem. Phys., 1970, 53, 2156.

26. Zubkov V.A., Birshtein T.M., Milevskaya I.S.,Volkenshtein . H.V. Circular Dichroism Calculation for Random-Coil Poly -peptide Chains. Biopolymers, 1971, 10, 2051.

27. Rozenkranz Н. Circular Dichroism of Globular Proteins., Z. Klin.Chem.Klin.Biochem, , (1974), 12!, 412 415.

28. Srinivasan R., Ralasubramanian R., Rajan S.S. Extended Helical Conformation Newly Observed in Protein Folding., Science, 1976, 4266, 720,

29. Ramachandran G.N., Kenkatachalam G.M., Krimm S. Stereochemical Criteria for Polypeptide and Protein Chain Conformations. III. Helical and Hydrogen Bonded Polypeptide Cha -ins. Biophys. J., 1966, 849-872.

30. Рамм E.И.,Божков B.M., "Клубковая конформация полипептидной цепи в гистонах и протаминах".В сб. Функциональная морфология,, генетика и биохимия клетки. Л., 1974, 114.

31. Божков В.М.»Воробьев В.М.,Есипова Н.Г.»Зинченко Л.М.Добачев В.М.,Рамм Е.И. В материалах III Всесоюзной конференции по35 конформационным изменениям биополимеров в растворах. Тби -лиси, 1975, 117.

32. Есипова Н.Г.,Рамм Е.И.,Лобачев В.М.»Воробьев В.И. Об осо -бенностях конформационного состояния гистонов. Биофизика, I97J^, 21

33. Рамм Е.И. ,Бирштейн Т.М. »Болотина И.А. ,Волькенштейн М.В. »Воробьев В.И.»Дмитриенко Л.В.»Некрасова Т.Н. Исследование Структуры гистонов. Молекулярная биология , 1970» 4,118-127.

34. Tumanyan V.G. Investigation of Fibrous Structures. I. Computations for Collagen. Biopolymers, 1970, 9, 955.

35. Kanaya S., Fujimoto Б. Fragments of Polyproline Like Structure from a Structure Froteins,Cuticlin. J. Mol. Biol., 1973, 81, 415.

36. Рамм Е.И.,Есипова Н.Г. »Воробьев В.И. Материалы III Всесоюзной конференции по спектроскопии биополимеров . Харьков,1977.

37. Заленский А.0.,Рамм Е.И.»Осипова Т.Н.»Воробьев В.И. Исследование самоассоциации гистонов Н4 и Н2а гидродинамически ми и оптическим методами.Биоорганическая химия,1978»4,817

38. Глотов Б.0.»Николаев Л.Г. Структура, химическая модификация и взаимодействие гистона HI с компонентами хроматина.Молек. биол. 1983, 17,5, 891-915.1

39. Лихтенштейн Г.И.Метод спиновых метот в молекулярной биологии, "Наука",М.,1974,255.

40. Кузнецов А. H. Метод спинового зонда. "Наука",М. ,1976, 220.

41. Метод спиновых меток. Под редакцией Берлинера Л.И., "Мир",1979, 639.

42. Дудич И.В.»Тимофеев В.П.,Волькенштейн М.В.,Мишарин А.Ю. Измерение времени вращательной корреляции макромолекул методом ЭПР в случае ковалентно связанной спин-метки.Мол.биол.1977,2.68!

43. Кяйвяряйнен А.И. Динамическое поведение белков в водной среде и их функции. Л. "Наука",1980, 246.

44. Тураев О.Д.,Салитра И.С.,Буриченко В.К., Шибнев В.А.Специфическая модификация гистона HI спиновыми ^F метками.Химия природн. соед.,1980, 4, 576-577.

45. Тимофеев В.П.,Тураев О.Д.,Салитра И.С.,Буриченко В.К.,Шибнев В.А. 0 поведении спин-меченых гистонов HI и Н2В в растворе и при комплексообразовании с ДНК. Докл. АН Тадж. ССР,1980, 23, 653-656.

46. Тураев О.Д.,Салитра И.С.,Буриченко В.К.,Шибнев В.А. Изучение поведения гистона HI и его комплекса с ДНК методом спиновых меток. Химия природн.соед. 1982, 6, 738-740.

47. Padros Е., Palau J., Lawrence J. Electron Spin Resonance Stüdes on the Conformation and Interactions of Histones, Containing Cysteine. J. Aroh. Biochem. Biophys.,1977, 183, 408 415.

48. Корякина H.И.,Бободжанов П.X.,Куликов A.B.,Буриченко В.К. Исследование структуры фрагментов гистонов и их моделей.!!.

49. Конформационные переходы фрагментов /^-концевой части гисто-на Н4,изученные методом спиновых меток.Биофизика,1979,24,943

50. Порошин К.Т.,Шибнев В.А. Синтез полиаминокислот и регулярных полипептидов. Изд. Дониш,Душанбе, 1968, 257.

51. Trubb W. Polypeptides as structural models for proteins. Proceeding of the first Cleveland symposium on macromolecu-les.Structure and Propertis of Biopolymers. Ed. Walton A.G., 1977, p.p. 23 37.

52. Eraser R.B.B., MacRae T.P., Stewart F.H.C., Suzuki E. Poly-L-alanylglycine. J. Mol. Biol., 1965, II, 706.

53. Lucas P., Shaw J.T.B., Smith S.G. The Amino Acid Sequence in a Fraction of the Fibroin of Bombyx mori. Biochem. J., 1957, 66, 468.

54. Fraser R.D.B., MacRae T.P., Stewart F.H.C. Poly-l-alanylgly-cyl-L-alanylglycyl-L-serylglycine:A Model for the Crystalline Regions of Silk Fibroin. J. Mol. Biol., 1966, 19, 580.

55. Rioh A., Crick F.H.C., J. Mol. Biol. 1964, 9, 296.

56. Шибнев B.A.,Чуваева Т.П. Синтез полипептида регулярного строения с молекулярным весом,приближающимся к тропокол-лагену.Изв. АН СССР,сер.хим.,1968, I, 225.

57. Шибнев В.А.»Лазарева А.В. Применение тетраэтилпирофосфита для синтеза полипептидов,моделирующих неполярные области молекулы коллагена.Изв.АН СССР,сер.хим.,1969, 2, 338-405.

58. Andreeva U.S., Esipova F.G., Millionova M.I., Rogylenkova V.N., Shibnev V.A. In "Conformation of Biopolymers" Rama-chandran,Academic Press, New York, 1967, p 469.

59. Gray W.R., Sandberg L.B., Poster J.A. Nature , 1973, 246, 461.

60. Urry D.W., Mitchell L.W., Ohnish T. Carbon-I3 Magnetic Re -sonance Evalution of Polypeptide Secondaru Structure and Correlation with Proton Magnetic Resonance Studies. Proo. Hat. Acad. Sci., USA, 1974, 71, 3265.

61. Stone D.,Sodek J., Johnson P., Smillie L.B. Proc. 9-th PEBS Meeting, Proteins of Contraotill Systems, E.N.A. Biro (Editor), North Holland, Amsterdam, 1975, 31, 125.

62. Pierre S. St., Ingwall R.T., Varlander M.S., Goodman M. Conformation Studies of sequential Polypeptides containing Lysine and Tyrosine. Biopolymers, 1978, 17,1837.

63. Huber R.H., Kukla D, Ruhlmann A., Steigmann 1. Cold. Spring Harbot Symp. of Quant. Biol. 1971, ¿6, 141.

64. Ramaohandran G.N., Sasisekhara V. Adv. Protein. Chem. 1968 , 23, 283.

65. Chothia C. Conformation of Twisted ^-pleated Sheets in Proteins. J. Mol. Biol.,1973, 75, 295.71. 01ins D.E., 01ins A.L., von Hippel P.H. On the Structure and Stability of DM Protamine and DNA - Polypeptide Complexes. J. Mol. Biol.,1968, 33, 265 -281.

66. Inoue S., Ando T. Optical Rotatory Dispersion of Nucleo -clupeine and other Model Nucleoproteins., Bioohem. Biophys. Res. Commun., 1968, 32, 501.

67. Shapiro J.T., Leng M., Pelsenfeld G. Deoxyribonucleic Acid- Polylysine Complexes.Structure and Nucleotide Specificity. Biochemistry, 1969, 8, 3219.

68. Inoue S., Ando T. Interaction of Clupeine with Deoxyribo -nucleic Acid. II. Optical Rotatory Dispersion Studies. Bio -chemistry, 1970, 9, 395.

69. Haynes M., Garrett R. A., Gratzer W.B. Structure of Nucleic Acid Poly Base Complexes. Biochemistry, 1970, 9, 4410.

70. Zama M.,Ichimura S. The Study of the DNA Structure in DNA -Polylysine and DNA Polyarginine Complexes : Induced optical Activity. Biochem. Biophys. Acta.,1971, 294, 214.

71. Chang C., Weiskopf M., Li H.L. Conformational Studies of Nuc-leoprotein. Circular Dichroism of Deoxyribonucleic Acid Base Paire Bound of Polylysine. Biochemistry, 1973, 12, 3028.

72. Stocrova S., Sponar J., Havranek M., Sedlacek B., Blaha K. Basic polypeptides of histone models. Synthesis, conformation and interaction with DNA of statistical copolymers (Lys ,Ala ) . Biopolymers, 1975, 14, 123I -1244.1. JL y xi —

73. PiedmanE., Gill Th. J.III.,Doty P. Studies on Synthetio Polypeptide Antigens.VI. The Synthesis and Physical Chemical Properties of a New Group of Linear chain Antigens. J. Amer. Chem. Soc., 1962, 04, 3485.

74. Stokrova S.,Sponar J., Havranek M., SedlacekB., Blaha K. Basic Polypeptides as Histone Models. Synthesis, Conformation and Interaction with DNA of Stutistical Copolymers (Lysx,Alay)n. Biopolymers , 1975, 14, 6, 1231.

75. Sugiyama H., Nöda H. Stability of the Helical Conformation of Random L-Alanine-L-Lysine Copolymers in Aqueous Solution Biopolymers, 1970, 2, 459.

76. Lerner D.A., Schleih T. The Solution Behavioz of Poly-L-Pro-line. II.Fluorecenoe Behavior of Labeled Polyproline in Water and Concentration Aqueous Neutral Salt Solutions. Biopolymers, 1973, 12, IOII.

77. Cassim J.Y., Yang J.Tsi., Critical Comparison of the Experi mental Optical Activity of Helioal Polypeptides and the Predictions of the Molecular Exciton Model. Biopolymers,1970 , 9, 1475.

78. Applequist J., Doty P. In Polyamino Acids, Polypeptides and Proteins.(Stahmann M.A.,Ed.), Univ. of Wisconsin Press,Ma -dison, 1962, 161.

79. Epand R.P., Scheraga H.A. The Helix Coil Transition of Poly-L-Iysine in Methanol-Water Solvent Mixtures. Biopolymers, 1968, %, 1383.

80. Ingwall R.T., Scheraga H.A., lotan BT., Berger A., Katchals-ky.E. Conformational Studies of Poly-L-Alanine in Water. Biopolymers, 1968, 6, 331.

81. Yung D., Irving M. A Cross-Linked Copolypeptide with Increased Affinity for Cations. Biopolymers, 1972, II, 431.

82. Shin T.Y., Fasman G.D. Circular Dichroism Studies of Deoxyribonucleic Acid Complexes with Arginine-Rich Histone IVf2al). Bioohemistry, 1971, I0, 1675.

83. Adler A.J., Ross D.G., Chen K., Stafford P.A., Woiswillo M.J. Pasman G.D. Interaction of Deoxyribonucleic Acid with His -tone f2b and its Half-Molecules. Circular Dichroism Studies. Biochemistry, 1974, 13, 616.

84. Wickett R.R., Li H.J., Isenberg I. Salt Effects on Histone IV Conformation. Biochemistry, 1972, II, 2952.

85. D Anna J.A., Isenberg I. Pluorecenoe Anisotropy and Circular Dichroism Study of Conformational Changes in Histone H2b. Biochemistry, 1972, II, 4017.

86. Daoust A., St-Pierre S, Synthesis and Conformation of Sequential Polypeptides Containing £ -Benzyloxycarbonyl-ly-sine and Benzyl Esters of Aspartic and Glutamic Acids. J. Chem. Soc. Perkin I. 1976, 1453 1457.

87. Daoust H., Prud homme J., Ho-Duo N. Stude de la stabitite de la conformation de oopolypeptides alternes. Eur. Polymer J. 1976, 12, 147 150.

88. Ho-Duc N., Daoust H., St-Pierre S. Synthesis and Study of the conformational stability of sequential polypeptides containing -benzyloxycarbonyl-L-ornithine and benzyl esters of I-aspartic and L-glutamic acids. Canad. J. Chem., 1978, j>6, 5, 622 627.

89. Pasman G.D., In : Poly- oC-amino acids. Edited by Pasman Marcel Dekker, New York, 1967, vol. I, N.Y. Chapt. II.

90. Hatano M., Yoneyama M., Ito I., Nozawa T., Nakai M., Side Chain Effect on the Helix Stability of Poly- o£ -amino Acids. J. Amer. Chem. Soc., 1969, "9I, 2165.

91. Gaskin P. Yang I.T. Helix-Coil Transition of Poly- )f N -Carbobenzoxy-L-o£, -diaminobutyrate and Poly-S'- N-Carbo-benzoxy-L-ornithine . Biopolymers, 1971, I0, 631.

92. Eraser R.D.B., Harrap B.S., MacRae T.P., Stewart P.H.C., Zuzuki E. Effect of Glycyl Residues on the Stability of the C^-Helix. Biopolymers. 1967, 5, 251 -257.

93. Sponar J., Stokrova S., Koruna I., Blaha K. Basic polypeptides as models of histones: Synthesis, conformation and interaction with DNA of sequence polypeptides containing Lysine, Alanine and Proline. Collect. "Czech. Chem. Commun. 1974, 39, 1625-1645.

94. Yang J.T. In the book : Poly -Oi- Amino Acids. Edited by Pasman G.D. Dekker, New York, 1967, 239.

95. Mandelkern I. In the book: Poly-c6- Amino Acids. Edited by Pasman G.D. Dekker, New York, 1967, 675.

96. Broun P.R., Carver J.P., Blout E.R. low temperature circular dichroism of poly-(glycyl-L-prolyl-L-alanine). J.Mol. Biol. 1969, 39, 307.

97. Applequist J., Doty P., In the book : Polyamino Acids, Polypeptides and Proteins (Stahmann M.A.), University of Wisconsin Press, Madison, 1962, 161.

98. Spach G., Brack A., Heitz P, Compt. Rend. Hebd. Acad. Sci. Ser. C . 1967, 265, 19.

99. Stokrova S, Sponar J., Havranek M., Sedlacek B., Blaha K. Basic polypeptides as histone models.Synthesis,conformation and interaction with DNA of statistical copolymers. Biopolymers, 1975, JA, I23I-I244.

100. Sponar J.,Sormova Z., Complexes of Histone PI with DNA in 0,15 M NaCI. Selectivity of Interaction with Respect to DNA Composition. Eur. J. Biochem. 1972, 29, 99.

101. Privat J.P., Spach G., Deng M. Etude des interactions enter I'acide deoxyribonucleique et le polypeptide alterne (L-Ly-sy 1-L-alanyle) n .E ur. J. Biochem. 1972, .26, 90.

102. Sponar J., Pric J. Complexes of Histone PI with DNA in 0,15 M NaCI.Circular Dichroism and Structure of the Complexes. Biopolymers, 1972, jCl, 2317.

103. Sponar J.,Blaha K., Stokrova S. Conformational Transition of DNA in DNA-Polypeptide Complexes. Studia Biophys., 1973, 40, 126 133.

104. Horiuchik, Puimoto D., Seto Y., Sakakibara S. (Lysyl-Gly-cyl—Glycyl)^ and (Lysyl-Glycyl-Glycyl)I0 as histone models. J. Biochem. 1978, Ю, 261 267.

105. Stokrova S., Zimmermann К., Sponar J., Blaha K. Sequential hasic polypeptides. Synthesis and conformation of polymers (Lysyl-Amino Acyl-Glycyl)n and circular dichroism of their complexes with DM. Collect, Czech. Chem. Commun. 1978, 43, 2341 2357.

106. Blaha K. Stokrova S., Sedlacek В., Sponar J. Basic Poly -peptides as Histone Models. Synthesis and Conformation of Sequential Polymers Poly(Lysyl-Amino Acyl-Glycyl)n and their Complexes with DM. Collect. Czech. Chem. Commun. 1967, 41, 2273.

107. Буриченко B.K., Порошин К.Т., Касымова Г.Ф., Шибнев В.А. Синтез регулярных полипептидов, включающих остатки аргинина. Изв. АН СССР, сер.хим. ,1972, И, 2596.:

108. Буриченко В.К., Порошин К.Т., Касымова Г.Ф., Мирзоев А.К., Шибнев В.А. Синтез политрипептидов с последовательностью аминокислот l^ys-Agr- А La- и -Ljs-Agr-ftly-, Изв. АН СССР, сер.хим., 1972, И, 2597.

109. Касымова Г.Ф., Буриченко В.К., Мейтус Э.Е., Порошин К.Т. Лизин- и аргининсодержащие полипептиды регулярного строения и их бактерицидные свойства. Химия природн. соед., 1973 , I, 88 90.

110. Буриченко В.К., Касымова Г.Ф., Марупов P.M., Исабаев М.И. Изучение конформационных состояний полипептидов регулярного строения, содержащие аргинин. Химия, природн. соед., 1975, 2, 232.

111. Буриченко В.К., Касымова Г.Ф. Синтез и исследования аргинин-содержащих полипептидов. II1-й Всесоюзный симпозиум по химии пептидов и белков. 1974г., Киев, 38.

112. Kasimova Q.F., Burichenko V.К.,Synthesis and Investigation of Arginine-containing polypeptides. Syrap. on Peptide and Protein Chemistry, USSR-PEG, 1976, 60.

113. Буриченко B.K., Корякина Н.И., Ященкова Л.В., Шибнев В.А. Синтез защищенных пептидов фрагментов 9-14, 4-9, 8-14

114. N -концевой части гистона фракции F2al тимуса телёнка. Химия природн. соед., 1972, 3, 370.

115. Корякина Н.И., Буриченко В.К. Синтез защищенного ундека -пептида фрагмента 6-16 /V -концевой части гистона фракции F2al тимуса телёнка. Химия природн. соед.,1973, 5,653.

116. Корякина Н.И., Буриченко В.К. Синтез защищенного гексаде-капептида, соответствующего последовательности I—16 М -концевой части гистона фракции F2al тимуса телёнка. Химия природн. соед.,1975, 6, 788.

117. Корякина Н.И., Буриченко В.К. Синтез двух защищенных гекеа-декапептидов, соответствующих Gly ианалогам фрагментам I-I6 N -концевой части гистона F2al тимуса телёнка. Химия природн. соед., 1975, 6, 794.

118. Касымова Г.Ф., Буриченко В.К. Синтез фрагмента гистона Н4 последовательности 14-21. Химия природа, соед., 1979, 1,48.

119. Марьяш Л.Й., Шибнев В.А. Буриченко В.К.Синтез фрагмента гистона Н2В с аминокислотной последовательностью 30-39 иего LyS 31 »33 аналога.Химия природа.соед., 1978,4,499.

120. Марьяш Л.И.,0.Д.Т^раев, Шибнев В.А. Синтез защищенных оли-гопептидов фрагментов гистоновой фракции HI. Химия природа, соед., 1977, I, 87 - 93.

121. Sponar J., Votavova Н., Hausenblasova Z., Blaha К. Aspects of protein DNA interactions revealed by model polype ptide-DNA complexes. Studia biophysioa, Band 76, 1979, Heft,3 , 159 - 160.

122. Крылов А.С., Гурский Г.В., Кондратьева И.О., Марьяш Л.И., Полетаев А.И., Шибнев В.А. Структура комплексов ДНК с регулярными полипептидами. Молек. биол.,1978, 12,2,297-307.

123. Марьяш Л.И., Абатуров Л.В., Шибнев В.А. Структурные особенности регулярных полипептидов,включающих остатки лизина и аланина. Stadia BLophysica: ,i974, 43, I, 41 56.

124. Марьяш Л.Ил, Лобачев В.М., Шибнев В.А. Круговой дихроизмрегулярных полипептидов, моделирующих первичную структуру гистоновой фракции FI. Изв. АН СССР, сер. хим.,1975 ,3, 654 557.

125. Марьяш Л.И., Лобачев В.М., Шибнев В.А. Структурные особенности регулярных полипептидов, включающих остатки лизина, орнитина и пролина. Биофизика, 1974, 19, I, 176-178.

126. Shin T.Y., Pasman G.D. Circular Dichroism Studies of Histone Deoxyribonucleic Acid Complexes. A Comparison of Complexes with Histone I (f-l), Histone IV (f2al), and Their Mixtures. Biochemistry, 1972, II, 3, 398 - 404.

127. Raukas E., Kooli K. Interaction of DM with Poly(L-lysine) as Studied by Thermal Denaturation Dispersion. Biochim. Biophys. Acta, 1977, b87, 286.

128. Higuchi S. Tsuboi M. Interaction of Poly-L-Lysine with Huo'~ leic Acids.II. Poly(A+U), Poly(A+2U), and Rice Dwarf Vi- rus RM. Biopolymers, 1966, b, 837.

129. Раукас Э. Температура плавления комплексов ДНК с протами -ном, основными полипептидами и полиэтилен-полиамином. Биохимия, 1965, 30, 1162.

130. Дебабов В.Г., Астауров О.Б., Давыдов В.Д. Подавление синтеза РНК 4/7 полипептидами ( основного характера. Биохимия, 31,1966,1253.

131. Шредер Э., Любке К. .Полипептиды,"Мир",М, 1-2 т.,1967.

132. Гринштейн Дж., Виниц. М., Химия аминокислот и пептидов. "Мир", M, 1965, 221.

133. Waleу S. G. The Structure Of Bacterial Polyglutamic Acid. J. Chem. Soc., 1955, 517.

134. Blout E.K.,Des Roches M.E., Preparation of High Molecular Weight Polypeptides. J. Am. Chem. Soc., 1959, 81, 370.

135. Schramm G., Wissman H. Polypeptidsynthe sen mit hilce von polyphosphorsuraestern. Chem. Ber.,1958, 91, 5, 1073.

136. Шибнев В.A. О применении этоксиацетилена для полимеризации и циклизации трипептидов, содержащих иминокиелоты. Изв. АН СССР, сер. хим., 1964, 1545.

137. Шибнев В.А., Гречишко B.C., Порошин К.Т. Синтез активироgванных эфиров трипептидов, включающих N -тозил-L-лизин, и их полимеризация.Изв.АН СССР,сер.хим., 1967, 2327.

138. Be Tar D.P., Honsberg W., Honsberg U. et. at. Synthesis of Peptide Polymers with Repeating Sequences. J. Am. Chem. Soc., 1963, 85, 2873

139. Шибнев В.А. Синтез регулярных полипептидов и применение их для изучения структуры коллагена. Дисс. док. хим. наук, Москва, 1972.

140. Sakakibara S., et. at., Bull. Chem. Soc. Japan., 1968, 42, 1273 1274.

141. Ariely S. lilvhek M., Patchornik A. Synthesis of Poly-L-Ar-ginine. Biopolymers, 1966, 4, I, 91.

142. Brenner M., Huber W. Herstellung von L-aminosauraestern du durch alkoholyse der methylester. Helw. Chim Acta, „1953 j 36, 1109 III5.

143. Jakubke H. Die Verwendung Aktivierter Ester zur Peptidsyn-these. Z. Chem. 1966, 52, 6.

144. Hanby W.E., Waleу S.G.,Watson J. Synthetic Polypeptides. Part II. Polyglutamic Acid. J. Chem Soc. 1950, 3239.

145. Kubilus J. Waitkus R.W., Baden H.P. The presence of citrul-line in epidermal proteins. Biochem. et. Biophysic. Acta, 1979, 581, 114 121.

146. Буриченко B.K., Корякина Н.И., Порошин К.Т. Получение полипептидов регулярного строения последовательности Gly-U/saosj--Myln . Докл. АН Тадж. ССР, 1971, 14, 5, 16.

147. Закиров A.B. Синтез регулярных полипептидов,включающих L -орнитин и глицин. Докл. АН Тадж. ССР, 1974, 17,2, 31.

148. Закиров A.B., Дебабов В.Г. Синтез регулярных полипептидов включающих L -лизин и глицин. Химия природн. соед. 1970, 4, 459.

149. Bodanszky М., Birkhimer С.А. 8-L-Citrulline Vasopressin and 8-Ii-Citrulline Oxytocin. J.Arner. Chem. Soc. 1962, 84,4243.

150. Буриченко B.K. Камилова P.P., Мейтус E.E. Синтез и исследование регулярных полипептидов, включающих орнитин, лизин, цитруллин и глицин. Докл. АН Тадж. ССР, 1977,20,6,35-39.

151. Губен-Вейль, Методы органической химии. Москва,1963,708-712.

152. Буриченко В.К., Полипептиды регулярного строения, содержащие основные аминокислоты. Докл. АН Тадж. ССР,1978,21^5,25.

153. Fridkin M., Prenke1 A., Ariely S. Poly-(L-Leucyl-L-Ornithyl-L-Leuoine) and its G-uanidizat ion Product : Synthesis and Antibacterial Activity. Biopolymers, 8, 5, 661-668.mm ' '

154. Шибнев B.A., Марьяш Л.И., Мейтуе Э.Е. О некоторых бактерицид^ ных свойствах олиго- и регулярных полипептидов, включающих остатки лизина и орнитина. Химия природа, соед.,1978, 2, 130.

155. B'Anna I.A., Isenberg I. Interactions of Histone LAK (f2a2) with Histones KAS (f2b) and GRK (f2al). Biochemistry, 1974, 13, 2098.

156. D'Anna I.A., Isenberg I. A Histone Cross Complexing Pattern. Biochemistry, 1974, 13, 4992.

157. Рамм Е.И.,Воробьев В.И., Камилова P.P., Буриченко B.K., Еси-пова Н.Г. Особенности конформационного состояния гистонови их полипептидных моделей. 1У Всесоюзн. симпоз. по химии белков и пептидов., Минск, 1977, 58.

158. Рамм Е.И., Камилова P.P., Полозова О.Л., Воробьев В.И., Буриченко В.К. Сравнение конформационных возможностей полипептидов, моделирующих концевые участки различных гистонов. Биофизика, 1979, 24, 5, 815 820.

159. Hausenblasova Z., Votavova Н., Blaha К., Sponar J. Thermal Denaturation of Complexes of DM with Sequential and Random Lysine Containing Polypeptides. Collec. Czech. Chem. Commun. 1983, 48, 679 689.

160. Рамм Е.И., Божков В.M. Клубковая конформация полипептидной цепи в гистонах и протаминах. В сб. "Функциональная морфология, генетика и биохимия клетки" Л.,1974, 114.

161. Ovchinnikov Ju.A., Ivanov V.T., Bystrov V.P., Miroshnikov A.I. She ре1 Е.Ж.,Ahdullaev N.D., Efremov E.S., Senyavina L.B.

162. The Conformation of Gramicidin S and its Biacetyl Deri-a vative in Solutions.Biochem.Biophys.Re s.Communs. 1970,39,217.

163. Бободжанов П.Х., Лихтенштейн Г.И., Получение спин-меченых препаратов хлопка, шелка и шерсти с помощью новых иминок -сильных радикалов на основе трихлортриазина. Докл. АН Тадж. ССР, 1974, 17, 10, 34.

164. Лихтенштейн Г.И., Пивоваров А.П., Смолина Н.Б. Изучение струк-г турных переходов в сывороточных альбуминах методом люминес-центноактивных меток. Молек. биол., 1968, 2, 291.

165. Лихтенштейн Г.И. Многоядерные окислительно-восстановительные металлоферменты. Изд. Наука, M., 1979, 52-73.

166. Johnston И". ,Krimm S. An Infrared Study of Unordered Poly-L-Proline in CaCIg Solution.Biopolymers,1971,10, 2597-2605.

167. Камилова P.P., Ахмедов Ю.Д., Буриченко В.К., Соложенкин П.М. Изучение конформационной подвижности регулярного полипеп -тида (Otij- Ly$-GLy)n методом спиновой метки. Докл. АН Тадж. ССР, XX, 12, 24-27.

168. Timofeev V.P. Dudich I.V., Sykulev Yu.K., Uezlin e.S. Rotational correlation times of LgC its fragments spin-labeled at carbohydrate or protein moietie s.FEBS Lett.,1978,89,2,191-195.

169. Weiskopf M., Li H.J. Poly(L-Lysine)-DNA Interactions in HaCI Solutions : B-C and B- Y Transitions. Biopolymers, 1977, 16, 669 684.48

170. Santella R.H., Li H.J. Interaction between Poly(L-Lysine , L-Histidine52) and DM. Biopolymers, 1977, 16, 1879 1894.

171. Broun J., Langloise J.R. Water-Soluble Lysine-containing Polypeptide s.I. The synthesis and characterization of several sequential lysine-glycine polypeptides including a study of their interaction with DM. Canad. J. Chem. 1974, 52,3140-3148

172. Tsuboi M., Matsuo K. Interaction of Poly-L-Lysine and Nuo-leic Acids. J. Mol• Biol., 1966, 15, 256 -257.

173. Pinkston M.F., Hitter A.H., Li H.J. Interactions between Model Proteins and Deoxyribonucleic Acids. Biochemistry,1976,15, 1676 1685.

174. Shin A., Eichhorn G.L. Biopolymers, 1977, 16, 225 -230.

175. Pasman G.D., Yalenzula M.S., Adler A.J. Complexes of Deoxyribonucleic Acid with Fragments of Lysine-Rich Histone (f-l). Circular Dichroism Studies. Biochemistry,1971,10,20,3795-3801.

176. Иванов В.И. Круговой дихроизм и структура комплементарных нуклеиновых кислот. Молек. биол.» сер. "Итоги науки и техники" под ред. Волькенштейна М.В., 1973, т.1, I05-I37.

177. Watanabe K.,Iso К. Quantitative Analysis of Chromatin Structure by Circular Dichroism. J.Mol.Biol.,1981, 151, 143 149.

178. Полетаев А.И. Круговой дихроизм комплексов ДНК. Молек. биол., сер. "Итоги науки и техники", под ред. Волькенштейна М.В. 198I, т.8, ч II, 180 241.

179. Рамм Е.И., Заленская И.А., Заленский А.О., Воробьев В.И. Исследование процессов реконструкции и ассоциации нуклео-сом с различным составом гистонов. Биофизика, 1983, 28, 698 699.

180. Морошкин В.А., Заленский А.О., Фрисман Э.В., Воробьев В.И. В сб.: Конформационные изменения биополимеров в растворах. 1975, Тбилиси, 91 92.

181. Спирин А.С. Спектрофотометрическое определение суммарного количества нуклеиновых кислот. Биохимия, 1958, 2, 5, 656-662.

182. Асатиани B.C. Биохимический анализ , ИОДНА,Тбилиси,1960,28.

183. Чуваева Т.П. Изучение активированных эфиров пептидов и применение их для получения белковых структур. Дисс.канд. хим. наук,Москва, 1968.

184. Марьяш Л.И.Синтез регулярных полипептидов,включающих остатки лизина и изучение их структурных и функциональных свойств. Дисс.канд. хим. наук, Душанбе, 1973.