Исследование влияния γ- и УФ-облучения на конформацию молекулы ДНК в водно-органических растворителях тема автореферата и диссертации по физике, 01.04.14 ВАК РФ

Пастон, Софья Владимировна АВТОР
кандидата физико-математических наук УЧЕНАЯ СТЕПЕНЬ
Санкт-Петербург МЕСТО ЗАЩИТЫ
2000 ГОД ЗАЩИТЫ
   
01.04.14 КОД ВАК РФ
Диссертация по физике на тему «Исследование влияния γ- и УФ-облучения на конформацию молекулы ДНК в водно-органических растворителях»
 
 
Содержание диссертации автор исследовательской работы: кандидата физико-математических наук, Пастон, Софья Владимировна

Введение.

Глава I Влияние радиации на структуру и свойства молекулы ДНК.

1. Действие ионизирующего излучения на конформацию молекулы ДНК.

2. Влияние УФ-излучения на структуру молекулы ДНК.

3. Конформация молекулы ДНК в растворе в присутствии неэлектролитов.

Глава II Материалы и методы.

1. Элементы статистической теории полимерных цепей.

2. Основы теории вязкости и ее измерение.

3. Основы теории двойного лучепреломления в потоке и установка для измерений.

4. Исследование спектров УФ-поглощения и кругового дихроизма ДНК.

5. Материалы.

6. Условия облучения.

Глава III Результаты и обсуждение.

1. Исследование конформационных изменений в молекуле ДНК, вызванных 7-облучением в водно-этанольных растворах.

2. Влияние мочевины на процесс радиационного поражения молекулы ДНК в растворе.

3. Исследование гидродинамических и оптических параметров УФ-облученной молекулы ДНК в растворе.

Выводы.

 
Введение диссертация по физике, на тему "Исследование влияния γ- и УФ-облучения на конформацию молекулы ДНК в водно-органических растворителях"

Предлагаемая диссертационная работа посвящена изучению влияния 7- и УФ- облучения на гидродинамические, оптические и спектральные свойства молекулы ДНК в водных и водно-органических растворителях.

Актуальность темы.

К настоящему времени установлено, что при облучении организма именно повреждения молекулы ДНК играют решающую роль в процессах, приводящих клетки к мутациям и гибели. Изучая действие излучений на ДНК в модельных системах (водно-солевых растворах), можно получить важную информацию о механизме повреждения макромолекулы в биологических структурах. Интерес к действию излучений различной природы на биологические объекты разного уровня организации обусловлен все возрастающим вниманием к экологическим проблемам. Такие исследования чрезвычайно актуальны в настоящее время в связи с развитием атомной промышленности, а также с изменением ряда геофизических факторов.

В диссертационной работе исследуется влияние 7-облу-чения на конформацию молекулы ДНК в водно-органических растворителях. Хорошо известно, что алифатические спирты способны защищать биологические макромолекулы от косвенного действия ионизирующего излучения путем перехвата активных радикалов, образующихся в результате радиолиза воды. Согласно современным представлениям, именно косвенное действие радиации вносит основной вклад в поражение биологических макромолекул 7-излучением как в клетке, так и в растворе. Помимо радиопротекторного действия, известно стабилизирующее влияние спирта на структуру воды при определенных его концентрациях. Напротив, мочевина, молекулы которой обладают большим дипольным моментом, даже при крайне малых концентрациях в растворе дестабилизирует структуру растворителя. Поэтому сравнение влияния этилового спирта и мочевины на радиационное поражение ДНК полезно для понимания роли некоторых свойств растворителя в изучаемом процессе.

В диссертационной работе проводится сравнение действия УФ- и 7-облучения на структуру и свойства молекулы ДНК. Эти излучения значительно отличаются по энергии. Кроме того, для УФ-света с длиной волны вблизи максимума поглощения ДНК характерно прямое действие радиации, в отличие от косвенного действия, преобладающего в случае 7-излучения. Несмотря на достаточно большое количество литературных данных о влиянии УФ- и 7-облучения на молекулу ДНК в растворе, к настоящему времени нет единого мнения о причинах наблюдаемых кон-формационных изменений. Предлагаемая работа посвящена определению молекулярных параметров ДНК в растворе после действия 7- и УФ-излучения при вариации дозы облучения, ионной силы и состава растворителя.

Целью работы является исследование конформацион-ных изменений ДНК в водно-органических растворителях, вызванных действием 7-радиации. В качестве сораствори-телей используются хорошо известный радиопротектор -этиловый спирт, оказывающий стабилизирующее влияние на структуру воды, и мочевина, проявляющая дестабилизирующее действие на структуру растворителя. Для решения поставленной задачи исследования проводятся в широкой области концентраций неэлектролитов. В работе используются разные дозы облучения.

Целью диссертационной работы является также сопоставление влияния 7- и УФ-облучения на структуру и свойства молекулы ДНК в растворе в широкой области ионных сил.

Структура диссертации. Диссертация состоит из введения, трех глав, выводов и списка цитируемой литературы. Она содержит 47 рисунков и 4 таблицы. Объем диссертации составляет 121 страницу. Список цитируемой литературы содержит 159 наименований.

 
Заключение диссертации по теме "Теплофизика и теоретическая теплотехника"

Выводы

1. Исследовано влияние 7-06лучения дозами 10, 20 и 30 Гр на конформацию молекулы ДНК в водно-этанольном растворе при концентрации этанола до 25% вес. Показано, что вторичная структура и равновесная жесткость на-тивной и облученной разными дозами ДНК в присутствии этанола не претерпевают заметных изменений [152].

2. Показано, что гидродинамические свойства макромолекулы при ее облучении в присутствии спирта меняются сложным образом, хотя характер зависимости [77] ДНК, облученной разными дозами, от Сэт не зависит от ее молекулярной массы [152-156].

3. Показано, что при концентрации этанола меньше критической (16.5%вес.) спирт защищает молекулу ДНК от радиационного поражения при всех используемых дозах. Защитное действие спирта увеличивается с ростом его концентрации, а при дозе 10 Гр и Сэт > 7%вес. наблюдается полная защита макромолекулы [152-156].

4. При концентрациях этанола в облучаемом растворе больших критической наблюдается инверсия дозовой зависимости характеристической вязкости ДНК [152].

5. Присутствие мочевины в облучаемом растворе малой ионной силы оказывает влияние на гидродинамическое поведение 7-облученной ДНК, которое не связано с защитным или сенсибилизирующим действием этого сорастворителя [157].

6. Показано, что при облучении растворов ДНК УФ-светом длиной волны 254 нм дозой 1,3 • 10~18Дж/нукл поражение молекулы ДНК увеличивается с уменьшением ионной силы раствора. Наблюдаемое падение удельного объема в области умеренных ионных сил не связано с изменением термодинамической жесткости и вторичной структуры макромолекулы, а обусловлено изменением дальних электростатических взаимодействий [158, 159].

 
Список источников диссертации и автореферата по физике, кандидата физико-математических наук, Пастон, Софья Владимировна, Санкт-Петербург

1. Terzi М. Comparative analysis of inactivating efficiency of radiation of different organism. Nature, 1961, v. 191, N 4787, p. 461-463.

2. Kaplan N. S., Moses N. E. Biological complexity and radiosensitivity. Science, 1964, v. 145, p. 21-25.

3. Olive P. L. The Role of DNA Single- and DoubleStrand Breaks in Cell Killing by Ionizing Radiation. Rad. Res., 1998, v. 150, p. S42-S51.

4. Зенгер В. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот. М. Мир, 1987.

5. Watson J. D., Crick F. H. C., Nature, 1953, v. 171, N 4356, p. 737.

6. Эйдус JI. X. Физико-химические основы радиобиологических процессов и защиты от излучений. М. Атом-издат, 1979.

7. P. A. Riley. Free radicals in biology: oxidative stress and the effects of ionizing radiation. Int. J. Radiat. Biol., 1994, v. 65, no 1, p. 27-33.

8. Nikjoo H., O'Neill P., Terrissol M. and Goodhead D. T. Modelling of radiation-induced DNA damage: the early physical and chemical event. Int. J. Radiat. Biol., 1994, v. 66, no 5, p. 453-457.

9. Milano M. Т., Bernhard W. A. The Effect of Packing and Conformation on Free Radical Yields in Films of Variably Hydrated DNA. Rad. Res., 1999, v. 151, p. 39-49.

10. Swarts S. G., Sevilla M. D., Becker D., Tokar C. J., Wheeler К. T. Radiation-Induced DNA Damage as a Function of Hydration. Rad. Res., 1992, v. 129, p. 333-344.

11. Huttermann J., Rohrig M., Kohnlein W. Free radicals from irradiated lyophilized DNA: influence of water of hydration. Int. J. Radiat. Biol., 1992, v. 61, no. 3, p. 299-313.

12. Goodhead D. T. The initial physical damage produced by ionizing radiations. Int. J. Radiat. Biol., 1989, v. 56, no 5, p. 623-634.

13. Michaels H. В., Hunt J. W. A model for radiation damage in cells by direct effect and by indirect effect: a radiation chemistry approach. Rad. Res., 1978, v. 74, p. 23-24.

14. Тимофеев-Ресовский H. В., Савич А. В. Шаль-нов M. И. Введение в молекулярную радиобиологию. М., Медицина, 1981.

15. Дертингер Е., Юнг X. Молекулярная радиобиология. М., Атомиздат, 1973.

16. Бугаенко JI. Т., Бяков В. М., Кабакчи С. А. Механизм радиолиза воды. ХВЭ, 1985, т. 9, с. 291-302

17. Шарпатый В. А. Радиационная химия биополимеров. М. Энергоиздат, 1981.

18. Swallow A. J., Int. J. Rad. Biol., 1983, v. 44, no. 1, p. 97.

19. Billen D. Rad. Res., 1984, v. 97, p. 626-629.

20. Skow K. A., Rad. Res., 1984, v. 99, p. 502-510.21. von Sonntag C. and Schuchmann H.-P. The radiolysis of pirimidines in aqueous solutions: an updating review. Int. J. Radiat. Biol., 1986, v. 49, no 1, p. 1-34.

21. Teoule R. Radiation-induced DNA damage and its repair. Int. J. Radiat. Biol., 1987, v. 51, no 4, p. 573-589.

22. Шарпатый В. А. Радиационная модификация сахарного фрагмента в ДНК: образование разрывов, изменение конформации полимера, передача повреждения на основание. Радиобиология, 1992, т. 32, вып. 2, с. 180193.

23. Teebor G. W., Boorstein R. J. and Cadet J. The repairability of oxidative free radical mediated damage to DNA: a review. Int. J. Radiat. Biol., 1988, v. 54, no 2, p. 131-150.

24. Scholes G., Ward J. F., Weiss J. Mechanism of the radiation-induced degradation of nucleic acids. J. Mol. Biol., 1960, v. 2, p. 379-391.

25. Effect of ionizing radiation on DNA. Physical, chemical and biological aspects. Editt. by Huttermann J., Springer-Verlag, Berlin, Heidelberg, New-York, 1978.

26. Ward J., Urist M. M. 7-irradiation of aqueous solutions of polynucleotides. Int. J. Radiat. Biol., 1967, v. 12, no. 3, p. 209-218.

27. Крушинская H. П. Радиационно-химические превращения нуклеиновых кислот и их компонентов. В кн.: Первичные радиобиологические процессы. Под ред. Н. В. Тимофеева-Ресовского. М., Атомиздат, 1973, с. 221-274.

28. Крушинская Н. П., Шальнов М. И. О природе разрывов в цепи ДНК при облучении водных растворов. Радиобиология, 1967, т. 7, N 1, с. 24-30.

29. Ward J. F., Kuo I. Strand breaks, base release, and post-irradiation changes in DNA 7-irradiated in dilute CVsatured aqueous solution. Rad. Res., 1976, v. 66, no. 3, p. 485-498.

30. Deeble D. J., Das S. and von Sonntag C. Uracil derivatives: Sites and kinetics of protonation of the radical anions and the UV spectra of the С(5) and С(6) H-atom adducts. J. Phys. Chem., 1985.

31. Fuciarelli A. F., Sisk E. C., Zimbrick J. D. Electron migration in oligonucleotides upon 7-irradiation in solution. Int. J. Radiat. Biol., 1994, v. 65, no. 4, p. 409-418.

32. Colson A. O. and Sevilla M. D. Elucidation of primary radiation damdge in DNA through application of ab initio molecular orbital theory. Int. J. Radiat. Biol., 1995, v. 67, no. 6, p. 627-645.

33. Рябченко H. И. Радиация и ДНК., M. Атомиздат, 1979.

34. Siddiqi М. A. and Botlie Е. Single- and double-strand break formation in DNA irradiated in aqueous solution: dependence on doze and OH radical scavenger concentration. Rad. Res. 1987, v. 112, p. 449-463.

35. Pogozelski W. K., Xapsos M. A., Blakely W. F. Quantitative Assessment of the Contribution of Clustered Damage to DNA Double-Strand Breaks Indused by mCo Gamma Rays and Fission Neutrons. Rad. Res., 1999, v. 151, p. 442-448.

36. Rafi A. A., Wheeler С. M. On the radiation-indused hyperchromicity of DNA. Int. J. Radiat. Biol., 1973, v. 24, no. 3, p. 321-323.

37. Georgakilas A. G., Sakelliou L., Sideris E. G., Margaritis L. H., Sophianopoulou V. Effect of Gamma Rays on the Stability and Size of DNA. Rad. Res., 1998, v. 150, p. 488491.

38. Uyesugi D. F., Trumbore C. N. The effect of low ionic strength on the radiation chemistry and physical properties of calf thymus DNA. Int. J. Radiat. Biol., 1983, v. 44, no. 6, p. 627-643.

39. Frisman E., Zarubina O. Effect of 7-irradiation on the conformation of the native DNA molecule. Biophys. Chem., 1993, v. 46, p. 37-46.

40. Поверенный A. M., Рябченко H. И., Гамов Ю. И., Иванник Б. П., Симонов В. В. Использование реакции с формальдегидом для определения и характеристики повреждений молекул ДНК. Молекуляр. биология. 1972, т. 6, N 4, с. 524-543.

41. Rafi A., Weiss J. J., Wheeler С. M. Effect of 7-radiation on aqueous solutions if DNA's of different base composition. Biochim. Biophys. Acta, 1968, v. 169, p. 230-240.

42. Ciment D. M., Overend W. G. Examination of the effect of gamma-rays on desoxyribonucleic acid. Archiv. of Biochem. and Biophys. 1967, v. 122, p. 563-568.

43. Banath J. P., Wallace S. S., Thompson J., Olive P. L. Radiation-Induced DNA Base Damage Detected in Individual Aerobic and Hypoxic Cells with Endonuclease III and Formamidopyrimidine-glycosylase, Rad. Res., 1999, v. 151, p. 550-558.

44. Sailer K., Viaggi S., Nusse M. Radiation-induced structural modifications in dsDNA analysed by FT-Raman spectroscopy. Int. J. Radiat. Biol., 1996, v. 69, no. 5, p. 601-613.

45. Coquerelle Т., Sexauer C. End group characterization in DNA of thymocytes after low doses of ionizing radiation. Rad. and Environm. Biophys. 1977, v. 14, p. 185-194.

46. Bases R., Maio J., Mendez F. Rad. Res., 1986, v. 105, p. 259271.

47. Henner W. D., Rodriquez L. O., Hecht S. M., Haseltin W. A. 7-ray indused desoxyribonucleic asid strand breaks. J. Biol. Chem. 1983, v. 258, no. 15, p. 198-205.

48. Sequaris J. M., Valenta P., Hurnberg H. W. A new electrochemical approach for the in vitro investigation of damage in native DNA by small 7-radiation doses. Int. J. Radiat. Biol., 1982, v. 42, no. 4, p. 407-415.

49. Cobreros G. L., Lopez-Zumel M. C., Usobiaga P. Modifiers of radiation action on DNA screened by analytical ultracentrifigation. Rad. Res., 1982, v. 92, no. 2, p. 255-267.

50. Lennartz M., Coquerelle Т., Bopp A., Hagen U. Oxygen-effect on strand breaks and specific end-groups in DNA of irradiated thymocytes. Int. J. Radiat. Biol., 1975, v. 27, no. 6, p. 577-587.

51. Фрисман Э. В., Воробьев В. И., Щагина JI. В., Яновская Н. К. Высокомол. соед., 1962, т. 4, N 5, с. 762-768.

52. Herskind С. Single-strand breaks can lead to complex configurations of plasmid DNA in vitro. Int. J. Radiat. Biol., 1987, v. 52, no. 4, p. 565-575.

53. Peak J. G., Ito Т., Robb F. Т., Peak M. J. DNA damage produced by exposure of supercoiled plasmid DNA to high-and low-LET ionizing radiation: effects of hydroxyl radical quenchers. Int. J. Radiat. Biol., 1995, v. 67, no. 1, p. 1-6.

54. Ito Т., Baker S. C., Stickley C. D., Peak J. G., Peak M. J. Dependence of the yield of strand breaks induced by 7-rays in DNA on the physical conditions of exposure: water contentand temperature. Int. J. Radiat. Biol., 1993, v. 63, p. 289296.

55. Гоникберг A. M., Одинцова С. П., Андреева В. М., Круглякова К. Е. Кинетика возникновения одноцепо-чечных разрывов и щелочелабильных связей при облучении суперспиральной ДНК фага РМ2. Радиобиология, 1981, т. 21, N 3, с. 51-57.

56. Schuessler Н., Hartman Н. Chromatographic studies on the radiolysis of DNA in aqueous solution. Int. J. Rad. Biol., 1985, v. 47, no. 5, p. 509-521.

57. Крушинская И. П., Шальнов М. И. О природе разрывов в цепи ДНК при облучении водных растворов. Радиобиология, 1967, т. 7, N 1, с. 24-30.

58. Провоторов А. В., Тронов В. А., Шагалов П. С., Цейтлин П. И. Вискозиметрическое исследование X-облученной ДНК. Радиобиология, 1977, т. 17, N 1, с. 2226.

59. Фрисман Э. В., Зарубина О. П. К вопросу о природе радиационного поражения молекулы ДНК пр 7-облучении ее растворов. Доклады АН СССР, 1988, т. 298, с. 2.

60. Зарубина О. П. Влияние 7-излучения на молекулярные параметры ДНК в водно-солевых растворах. Дисс. на соискание уч. степ. канд. наук (1987), JL, на правах рукописи.

61. Осипов Н. Д., Кондратьева О. П., Фрисман Э. В. Влияние кофеина на параметры молекулы нативной и 7-облученной ДНК. Вестник ЛГУ, 1979, N 4, с. 98-101.

62. Осипов Н. Д., Кондратьева О. П., Громова Е. С., Фрисман Э. В. Влияние ксантобина на степень радиационного поражения молекулы ДНК. Радиобиология, 1980, т. 20, N 5, с. 671-675.

63. Зарубина О. П., Зырянова И. М., Фрисман Э. В. Связывание акрифлавина и стабильность ДНК. Биофизика, 1986, т. 31, вып. 6, с. 940-943.

64. Смит К., Хэнеуолт Ф. Молекулярная фотобиология. М., 1972.

65. Takakura К., Ishikawa М., Ito Т. Action spectrum for the induction of single-strand breaks in DNA in buffered aqueous solution in the wavelength range from 150 to 272 nm: dual mechanism. Int. J. Rad. Biol., 1987, v. 52, no 5, p. 667-675.

66. Рубин А. Б. Биофизика, кн. 2, M., Высшая школа, 1987.

67. Reinbow A. J., Stanley М. DNA damage and biological function of human adenovirus after U.V.-Irradiation. Radiat. Biol. 1973, v. 24, no. 1, p. 59-72.

68. Шафрановская H. H. Исследование УФ-облученной ДНК с помощью кинетического формальдегидного метода: Автореф. канд. дис. М., 1972.

69. Pearlman D., Holbrook S., Pirkle D., Kim S. Molecular Models for DNA Damaged by Photoreaction. Science. 1985. Vol. 227. P. 1304-1308.

70. Denhardt D. Т., Kato A. C. Comparision of the Effect of Ultraviolet Radiation and Ethidium Bromide Intercalation on the Conformation of Superhelical </>X174 Replicative Form DNA.

71. Ciarrocchi G., Pedrini A. M. J. Mol. Biol. 1982. Vol. 155. P. 177-183.

72. Ciarrocchi G., Sutherland B. Irradiation of circular DNA with 254 nm radiation or sensitization in the presence of Ag+ evidence for unwinding by photopro ducts other than pyrimidine dimers. Photochem. and Photobiol., 1983, v. 38., p. 259-263.

73. Veldhuisen G., Bacchetti S., Valk M. Photochem. and Photobiol., 1976, v. 23, no 3, p. 205-208.

74. Alexander P., Moroson H. Effect of Ultra-violet Light on the Shape and Size of Deoxyribonucleic Acid. Nature., I960, v. 185, p. 56-57.

75. Triebel H., Reinert K.-E., Bar H., Lang H. Structural changes of ultraviolet-irradiated DNA derived from hydrodynamic measurements. Biohim. et Biophys. Acta, 1979, v. 561, p. 59-68.

76. Patrick M., Gray D. Independence of photoproduct formation on DNA conformation. Photochem. and Photobiol., 1976, v. 24, p. 507-513.

77. Rahn R. O., Hosszu J. L. Influence of relative humidity on the photochemistry of DNA films. Biohim. et Biophys. Acta., 1969, v. 190, p. 126-131.

78. Wang K-J., Pan X-M., Wu J-I., Wang W-Q. Enhancement of the Photolysis of Nucleic Acid Monomers by Phosphates. Photochem. and Photobiol., 1997, v. 65, p. 656-659.

79. Cremonese M. The wavelength dependence of some effects of ultraviolet radiation on in vitro DNA of phage a. Biophys. J., 1968, v. 8, p. 153-163.

80. Matsumoto H., Takakusu A., Ohnishi T. The effects of ultraviolet С on in vitro nucleosome assembly and stability. Photochem. and Photobiol., 1994, v. 60, p. 134-138.

81. Брандтс Д. Ф. Конформационные переходы белков в воде и в смешанных водных растворителях. В сб.: Структура и стабильность биологических макромолекул. Пер. с англ. Под ред. М. В. Волькенштейна. М.: Мир, 1973.

82. Ланшина Л. В., Дакар Г. М. О природе низкочастотного акустического поглощения в водных растворах неэлектролитов малых и средних концентраций. Жур. физ. хим., 1996, т. 70, N 3, с. 411-415.

83. Свищев И. М., Гончаров В. В. Структура воды и водных растворов неэлектролитов по данным ЯМР 1Н.1.. Водно-спиртовые растворы. Топология сетки Н-связей при малых концентрациях спиртов и объемные свойства. Жур. структ. хим., 1990, т. 31, N 3, с. 71-76.

84. Franks F. The structural properties of alcohol-water mixtures. Quart. Rev. (London), 1966, v. 20, p. 1.

85. Белоусов В. П., Кочнев И. Н., Сидорова А. И. Спектральные и термодинамические свойства и строение водных растворов спиртов. В сб.: Молекулярная физика и биофизика водных систем. Вып. 2. Под ред. А. И. Сидоровой, Л.: ЛГУ, 1974, с. 3-15

86. Кочнев И. Н. Объемные эффекты в спирто-водных растворах. В сб.: Молекулярная физика и биофизика водных систем. Вып. 1. Под ред. М. Ф. Вукса и А. И. Сидоровой, Л.: ЛГУ, 1973, с. 19-24

87. Кочнев И. Н., Сидорова А. И. Свойства водных растворов спиртов. В сб.: Молекулярная физика и биофизика водных систем. Вып. 2. Под ред. А. И. Сидоровой, Л.: ЛГУ, 1974, с. 29-59

88. Вукс М. Ф. Термодинамические и иные особенности водных растворов спиртов. В сб.: Молекулярная физика и биофизика водных систем. Вып. 2. Под ред. А. И. Сидоровой, Л.: ЛГУ, 1974, с. 16-22

89. Носков С.Ю., Киселев М.Г., Колкер A.M. Изучение аномального поведения теплоемкости в смеси метанол-вода методом молекулярной динамики. Жур. структ. хим., 1999, т. 40, N 2, с. 304-313.

90. Бушуев Ю. Г., Дубинкина Т. А., Королев В. П. Свойства сеток водородных связей и молекулярных ассоци-атов водно-метанольных смесей. Жур. физ. хим., 1997, т. 71, N 1, с. 113-117.

91. Hoccart X., Turrell G. Raman spectroscopic investigation of the dynamics of urea-water complexes. J. Chem. Phys., 1993, v. 99, no. 11, p. 8498-8503.

92. Frank H. S. Structural Approach to the Solvent Power of Water for hydrocarbons; Urea as a Structure Breaker. J. Chem. Phys., 1968, v. 48, no. 10, p. 4746-4757.

93. Cristinziano P., Lelj F., Amodeo P., Barone V. A molecular dynamics study of associations in solution. An npt simulation of the urea dimer in water. Chem. Phys. lett., 1987, v. 140, no. 4, p. 401-405.

94. Lee C., Stahlberg E. A., Fitzgerald G. Chemical Structure of Urea in Water. J. Phys. Chem., 1995, v. 99, p. 17737-17741.

95. Herskovits Т., GeiduschekB. Arch. Biochem. Biophys., 1961, v. 95, p. 114-129.

96. Herskovits T. Arch. Biochem. Biophys., 1962, v. 97, p. 474484.

97. Brams J., Mommaerts W. H. N. M. J. Mol. Biol., 1964, v. 10, p. 73-88.

98. Ivanov V. I., Minchenkova L. E., Schyolkina A. K., Poletaev A. I. Biopol., 1973, v. 12, p. 89-110.

99. Ivanov V. I., Minchenkova L. E., Minyat E. E., Franc-Kamenetskii M. D., Schyolkina A. K. The В and A Transition of DNA in Solution. J. Mol. Biol., 1974, v. 87, p. 817-833.

100. Tunis-Schneider M., Maestre M. J. Mol. Biol., 1970, v. 52, p. 521-541.

101. Zimmerman S. В., Pheiffer В. H. A Direct Demonstration that the Ethanol-induced Transition of DNA is between the A and В forms: an X-ray Diffraction Study. J. Mol. Biol., 1979, v. 135, p. 1023-1027.

102. Huey R., Mohr S. C. Condensed States of Nucleic Asids. III. Ф(+) and Ф(—) Conformational Transitions of DNA Induced by Ethanol and Salt. Biopol., 1981, v. 20, p. 2533-2552.

103. Wilson R. W., Bloomfield V. A. Counterion-Induced Condensation of Desoxyribonucleic Acid. Biochemistry, 1979, v. 18, no. 11, p. 2192-2196.

104. Gray D. M., Edmondson S. R, Lang D., Vaughan M. The circilar dichroizm and X-ray diffraction of DNA condensed from ethanolic solutions. Nucleic Acids Res., 1979, v. 6, no. 6, p. 2089-2107.

105. Arscott P. G., Ma C., Wenner J. R., Bloomfield V. A. DNA Condensation by Cobalt Hexaammme (III) in Alcohol-Water Mixtures: Dielectric Constant and Other Solvent Effects. Biopol., 1995, v. 36, p. 345-364.

106. Фрисман Э. В., Веселков A. H., Слоницкий С. В., Влияние растворителя на конформацию молекулы дезокси-рибонуклеиновой кислоты. Воробьев В. И., Докл. АН СССР, 1974, т. 214, N 2, с. 468-471.

107. Frisman Е. V, Veselkov A. N., Slonitsky S. V., Karavaev L. S., Vorob'ev V. I. The Influence of Alcohol-Water Solvents on the Conformation of Deoxyribonucleic Acid. Biopol., 1974, v. 13, p. 2169-2178.

108. Веселков A. H., Фрисман Э. В., Молек. Биол., 1979, т. 13, v. 1, с. 184-191.

109. Frisman Е. V., Slonitsky S. V., Veselkov А. N. Influence of Solvent Structure on the Conformation of the Native DNA Molecule. Int. J. of Quant. Chem., 1979, v. 16, p. 847-855.

110. Веселков A. H., Бильке К., Фрисман Э. В. Вестник ЛГУ, 16, 1974, с. 62-67.

111. Слоницкий С. В., Лаевский В. В., Фрисман Э. В. Молек. Биол., 1980, т. 14, N 4, с. 743-752.

112. Lee У. С., Chan Y. V., Kulhanian F. M., Byfield J. E. Rad. Res., 1974, v. 1, p. 180-181.

113. Takakura K., Ishikawa M., Ito T. Int. J. Rad. Biol., 1987, v. 52, p. 667.

114. Nablen F., Stroom H., Loman H. Int. J. Rad. Biol., 1983, v. 43, no. 5, p. 495-504.

115. Van Rijn K., Mayer Т., Blok J., Werbern J. В., Loman H. Int J. Rad. Biol., 1985, v. 43, no. 3, p. 309-317.

116. Worm К. H., Klimczak U., Schulte-Frohlinde D., Int. J. Rad. Biol., 1993, v. 64, p. 485.

117. Kuhn W. Uber die gestalt faderformiger moleculi in iosungen, Kolloid. J., 1934, v. 68, p. 2-5.

118. Guth E., Mark H., Zur innezmolekularen statistik, insbesonder bei ketten-molekulen, Monatsh. Chem., 1934, v. 65, p. 93.

119. Porod G. Zusammenhang zwischen mittlerem endpunkt-sabstand und kettenlange bei fadenmolekulen. Monatsch. Chem., 1949, v. 80, p. 251-255.

120. Фрисман Э. В., Сюй-Мао Динамическое двойное лучепреломление и вязкость в системе полиизобутилен-бензол вблизи критической температуры растворения. Высокомол. соед., 1961, т. 3, N 2, с. 285-289.

121. Цветков В. Н., Бычкова В. Е., Саввон С. М., Некрасов И. К. Внутримолекулярные взаимодействия и сегментная анизотропия цепных молекул в растворе. Высокомол. соед., 1959, т. 1, с. 1407-1415.

122. Фрисман Э. В., В сб.: Доклады симпозиумов IV Международного биофизического конгресса, Пущино, 1973, т. 1, с. 301.

123. Щагина JI. В., Рихтер Д., Фрисман Э. В., Воробьев В. И., Мол. биология, 1969, т. 3, N 2, с. 221.

124. Слоницкий С.В., Фрисман Э. В., Мол. биология, 1980, т. 14, N 3, с. 496.

125. Цветков В. Н., Френкель С. Я., Эскин В. Е. Структура макромолекул в растворе. М., 1964, с. 93-200.

126. Flory P. Principles of the polymer chemistry, 1953, p. 4.

127. Птицын О. В., Эйзнер Ю. Е. Гидродинамика растворов полимеров. IV". О влиянии объемных эффектов на рассеяние света и константу трения макромолекул в растворе, Высокомол. соед., 1959, т. 1, N 7, с. 966-977.

128. Птицын О. В., Эйзнер Ю. Е. Гидродинамика растворов полимеров. II. Гидродинамические свойства макромолекул в хороших растворителях, Журнал Тех. Физ., 1959, т. 29, с. 1117-1134.

129. Yamakawa Н., Fujii М. Intrinsic viscosity of wormlike chains determination of the salt factor, Macromol., 1974, v. 7, N 1, p. 128-135.

130. Eigner J., Doty P. J. Mol. Biol., 1965, v. 12, N 3, p. 549-580.

131. Фрисман Э. В., Щагина JI. В., Воробьев В. И. Колло-идн. журн. 1965, т. 27, N 1, с. 130-133.

132. Kuhn W., Kuhn Н., Helv. Chim. Acta, 1943, v. 26, p. 1394.

133. Цветков В. H., Фрисман Э. В., Доклады АН СССР, 1954, 976, с. 647-650.

134. Цветков В. Н. Об оптическом эффекте формы жестких полимерных цепей в растворах. Высокомолекулярные соединения, 1963, т. 5, с. 740-746.

135. Фрисман Э. В., Сибилева М. А., Красноперова А. В. Высокомолекулярные соединения, 1959, т. 1, с. 597-606.

136. Peterlin A. A. J. Polym. Sci., 1954, v. 12, p. 45-57.

137. Фрисман Э. В., Сибилева М. А., Воробьев В. И., Гор-шенкина Е. С., Туроверова JI. В., Борхсениус С. Н. Исследование ДНП, последовательно объединенных белками. Молек. биол., 1970, т. 4, N 5, с. 707-714.

138. Eigner I., Doty P., J. Molek. Biol., 1964, v. 9, p. 545.

139. Спирин А. С., Биохимия, 1958, т. 23, с. 656.

140. Sibileva M. A., Moiseenko A. F., Frisman E. V., Studia. Biophys., 1989, v. 120, N. 1, p. 37-54.

141. Паркер С1., "Фотолюминесценция растворов", М., Мир, 1972.

142. Lang Н., Luck G. Photochem. and Photobiol., 1973, v. 17, p. 387-393.

143. Фрисман Э. В., Зарубина О. П., Зырянова И. М., Кух-тин А. А., Тарасенко О. А., Биофизика, 1997, т. 42, вып. 1, с. 117.

144. Пастон С. В., Замотин В. В., Румянцева И. М., Зырянова И. М. Исследование конформационных изменений молекулы ДНК, вызванных 7-облучением в водно-этанольных растворах. Препринт SPbU-IP-00-Ю.

145. Пастон С. В., Зырянова И. М. Влияние мочевины на процесс радиационного поражения молекулы ДНК в растворе. Вестник молодых ученых, серия Физические Науки, 2000, N2, с. 25-32.

146. Пастон С. В., Румянцева И. М., Зырянова И. М. Исследование влияния УФ- и 7-облучения на конформацию молекулы ДНК при разных ионных условиях. Сб. тезисов докладов II Съезда биофизиков России, Москва, 23-27 августа 1999, с. 144-145.

147. Пастон С. В., Зырянова И. М. Исследование гидродинамических и оптических параметров УФ-облученной молекулы ДНК в растворе. Вестник СПбГУ, Сер. 4, 2000, вып. 1 (N 4), С. 50-59.

148. Выражаю искреннюю признательность руководителю моей диссертационной работы Анатолию Анатольевичу Трусову, за поддержку, неизменную доброжелательность и внимание к моей работе.

149. Хочу поблагодарить Ирину Михайловну Зырянову за большую помощь в проведении экспериментов, а также Майю Александровну Сибилеву и Евгению Борисовну Мо-рошкину за интересное обсуждение результатов.

150. Особую признательность хочу выразить Нине Анатольевне Касьяненко, без активного и непосредственного участия которой эта работа бы не состоялась.