Пепсин в ферментативном синтезе пептидов тема автореферата и диссертации по химии, 02.00.10 ВАК РФ

Анисимова, Вероника Валерьевна АВТОР
кандидата химических наук УЧЕНАЯ СТЕПЕНЬ
Москва МЕСТО ЗАЩИТЫ
1995 ГОД ЗАЩИТЫ
   
02.00.10 КОД ВАК РФ
Автореферат по химии на тему «Пепсин в ферментативном синтезе пептидов»
 
Автореферат диссертации на тему "Пепсин в ферментативном синтезе пептидов"

МОСКОВСКИЙ ОРДЕНОВ ЛЕНИНА, ОКТЯБРЬСКОЙ РЕВОЛЮЦИИ

И ТРУДОВОГО КРАСНОГО ЗНАМЕНИ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ имени М.В.ЛОМОНОСОВА

Ш,5НЕСК1М ФАКУЛЬТЕТ

На правах рукописи УДК 577.152.344'135

АНИСИМОВА ВЕРОНИКА ВАЛЕРЬЕВНА

ПЕПСИН В ФЕРМЕНТАТИВНОМ СИНТЕЗЕ ПЕПТИДОВ

02.00.10 - Виоорганическая химия, химия природных и физиологически активных веществ

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук

Москва 1995

Работа выполнена на кафедре химии природных соединений химического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова

Научный руководитель: доктор химических наук,

профессор В.М.Степанов

Официальные оппоненты: доктор химических наук,

профессор Ю.В.Митин

кандидат химических наук

Т.В.Ротанова

Ведущая организация: Институт биохимии им. А.Н.Баха РАН

заседании Специализированного совета Д 053.05.47 по химическим наукам при Московском государственном университете им. М.В.Ломоносова по адресу: 119899, Москва, ГСП-3, Ленинские г:ры, Институт физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского МГУ, аудитория 501.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке химического факультета МГУ.

Защита состоится "14" ноября 1995 г. в

Автореферат разослан

октября 1995 г.

Ученый секретарь

\

Специализированного совет?

кандидат химических наук

И.Г.Смирнова

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблеш. Ферментативный метод образования гтидных связей имеет ряд преимуществ перед химическими: :рео- и региоселектигность, возможность введения в реакции шокислот и пептидов с незащищенными боковыми функциональны™ тагами, проведение реакций в мягких условиях, легкость выделения »дуктов. Использование протеиназ в качестве катализаторов синтеза гаидов позволяет получать физиологически активные соединения, а ;же различные субстраты, применяющиеся при исследовании логических объектов. Более глубокое понимание процессов, исходящих при конденсации пептидов под действием неолитических ферментов и изучение поведения ферментов в ходе ттеза весьма актуально, так как способствует расширению 5можностей данного метода. С другой стороны, использование зтеиназ в пептидном синтезе открывает новые перспективы для гчения свойств самих ферментов.

Целью данной работы является развитие ферментативного пептидного гтеза под действием пепсина в водных растворах органических ;творителей, в органических растворителях с малым содержанием хы и в системах, содержащих денатурирующие агенты - мочевину, фохлорид гуанидина и додецилсульфат натрия. В нашу задачу эдило изучение некоторых закономерностей процессов конденсации, >текающих с участием этого фермента.

Научная новизна и практическая ценность работы. В

дао-органической среде синтезирована серия пептидов с хорошими содами. Изучено поведение пепсина в реакциях конденсации пептидов таких условиях и показано, что при использовании больших пичеств фермента происходит его соосавдение в ходе реакции с разующимся осадком продукта. Показана возможность применения

' распределенного на поверхности неорганического носителя, качестве катализатора образования пептидной связи з органически растворителях, и в зтих условиях получен ряд пептидов различно, длины. Исследована возможность применения пепсина в синтез, гидрофобных октз- и декапептидов в концентрированных раствора мочевины. Показана возможность синтеза пептидов з присутстви других денатурирующих агентов - гидрохлорида гуанидинз з додецилсульфата натрия.

Публикация и апробация работы. Материалы исследования по тем диссертации опубликованы в 6 статьях, а также были представлены н vil Всесоюзном симпозиуме по инженерной энзимологии (Москва, 1991) Международной конференции "Протеиназы в пептидном синтезе (Богензее, 1991) и ill Симпозиуме по химии протеолитическг ферментов (Москва, 1993).

Структура и объем работы. Диссертация состоит ' из введения обзора литературы, посвященного специфичности пепсина в реакци* гидролиза и синтеза пептидных связей, обсувдения результатов экспериментальной части, выводов и списка цитируемой литератур ( ссылки). Диссертация содержит 29 рисунков и ¿2 таблицы.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Протеолитический фермент пепсин довольно редко использовался реакциях конденсации пептидов несмотря -на доступность стабильность, достаточно широкую специфичность. Пепсин мохе принимать участие только в равновесном синтезе пептидной связи Ввиду этого, в отличие от кинетически контролируемых процессоЕ субстратами в реакциях конденсации, катализируемых пепсином, Morj служить только неактивированные производные аминокислот и пептидо! В этом случае роль фермента сводится к ускорению скорост достижения равновесия реакции синтеза-гидролиза пептидной связ!

о

;я смешения равновесия в етсрону сорагсзання пептидного продукта •обходимо его выведение из сферы реакции га счет осакдения иди .■стракцни з другую фазу, либо псннжкне активности зоды в системе ;и проведении реакций в органических' растворителях с очень малым > содержанием. Работа состоит из тред частей: | синтез пептидов в водно-органической среде; ) синтез пептидов в органических растворителях с малым дерганием вода;

) синтез пептидов в системах, ссдернашх денатурируксие агенты.

I. Катализируемый пепсином синтез пептидов в водно-органической

среде

1.1 .Подбор агтикиькых условиг синтеза. 3 качестве модельной дстемы изучалась катализируемая пепсином реакция мехду трипептидами -А1а-А1а-РЬе-0Н и Н-1>еи-А1а-А1а-ССН3 в водно-органической среде:

г-АХа-АХа-РИе-ОН + Н-Ьен-АХа-АХа-ОСН,

-' I

| -гепсмн

г-А1а-А1а-РЬе-Ьеи-А1з-А1а~0СН3(раств0р) + 1^0

2;-А1а-А1а-РКе-Ьеи-А1а-А1а-ОСН3 (ссадок)

Чтобы сохранить постоянным значение рН реакционной смеси, ¡ксперименты проводились в 1М ацетатном буфере, рН 4,6, в который ум повышения растворимости исходных пептидов вводили 18-20% щметилформамвда (ДМФА). Продукт реакции, защищенный гептапептид, шпенный ионогенных групп, гораздо хуке растворяется з реакционной зреде и выпадает в осадок. Этим достигается смещение равновесия в

"23 7v"b _,2~СМ Г г ^ ' ПГ ^^ >f ]' I * т'.^л-; c.—~

r.z'ii изучении 3 3H'/.g;lvoct;; выхода г5ксз"~гтг;1ла er нодичестза пепсина, введенного в реакций, препаративный нь^ссд продукта составляет 56-сс-г в интервале ссотнсаэкй! [S]:[E] ст ю-3:-! до 2*ic":i. Гак™ с'разом, показано, что для эффективного катализа образования пептидной связи достаточно небольших концентраций пепсина, хотя в литературе есть примеры использования очень бользих его количеств.

1.2.Пепсин на:-: пализапер сушеза различных пеплисод. С помощью пег.с;ез былэ синтезирована серия пептидов (Табл.1). На их выход Елиет ряд фактсроЕ: соотвествие исходных соединений специфичности пепсина, длина с:с-:тезируемого пептида, растворимость образующихся продуктов реакции. Соединения (i)-(vili), где в положениях Р1 н находятся гидрофобные аминокислоты (?he, Leu, Met), были получены с достаточно высокими выходами. Заметно повышает эффективность синтеза введение С-концевсй п-нитроанилидной группировки в аминокомпенент (соединения (XII) - (ZIY)). п-Нитроанилиды аминокислот, кроме аминокислотного остатка, способного связываться в подцентре s^, содержат гидрофобную п-нитроанилидную часть, взаимодействующую с подцентром Sg субстрат-связывавдей области фермента. Появление -NH-группы в молекулах п-нитроанилидов также, возможно, улучшает связывание таких субстратов с ферментом за счет образования водородных связей. Вследствие этого п-ттроашшщы аминокислот как аминокомпоненты лучше соответствующих эфиров. Кроме того, наличие остатка п-нитроанллина ухудшает растворимость целевых пептидов по сравнению с соответствующими метиловыми эфирами, что приводит к

ллее глубокому сдвигу равновесия в сторону- синтеза. Так, например, случае соединения (XII) удается ввести в пологени? ?1 заряхенный зтаток Особого внимания заслугивает гзразсвание связи ?*е-А1а хептид (XIII)), поскольку гон глдрслкЕе различных субстратов л, в ;обенности, белков, связь Хаа-л1а расселяется пепсином довольно здко.

Таблица 1. Синтез пепгяюаб с испольговател пепсина в еодно-органической среде*

пептид кснл. ВЫХОД, Я5

2-А1а-А1а-Р1ге-»Ьеи-А1а-А1г-0СН7 (I) 13 58

Вос-РЬе-Ме^РЬе-А1а-А1а-0СНт (II) 15 59

2-А1а-Р1ге-»Ьеи-А1а-А1а-0СЕ, (III) ' 1 я 53

г-А1а-А1а-РЬ.е-»РЬе-А1а-А1а-0СН3 (IV) 13 I 58 | |

2-А1а-А1а-РКе-»РЬе-0СН3 (V) : со с-

г-А1а-А1а-Ьеи-»РЬе-ОСН3 (VI) 13 1 66

г-А1а-А1а-Ьеи-»РЬе-А1а-А1а-ОСН-, (VII) 24 59

г-А1а-А1а-Ьеи-*Ьеи-А1а-А1а-ОСЕ, > (VIII) 23 64

Воо-11е-Р1ге-»РЬе-А1а-А1а-ОСНт (IX) 33 15

2-А1а-А1а-РЬе-»Р11е-01у-01у-ССНт (X) 18 39

2-А1а-РЬе-»РЬе-ОСН3 (XI) 11 47

2-А1а-А1а-01и-»Ьеи-рЫА (XII) 8 60

г-А1а-А1а-Р11е-»А1а-А1а-рНА (хш; ГО 77

2-А1а-А1а-Р}ге-»?}1е-А1а-А1а-р?{А (XIV) 33 67

Стрелкой показаны образушиеся в синтезе связи.

с

1.3 .СэдС-йхдение пепсиж с продуктам, ферлентсягибного сикхе пепхиЭоЗ как ^хисг.ор, ограничиваема эфрэглывноспь ферлента. Д более полного понимания процессов, протекающих с участием пепсин мы изучили поведение фермента в реакции конденсации А1а-А1а-?Ье-ОН и Н-1,еи-А1а-А1а-ОСН~ при рН 4,5 (соотнесение [Б]:[ ю-'п). Было обнаружено, что в процессе синтеза пептн 2-А1а-А1а-?Ье-Ьеи-А1а-А1а-0СН3 активность пепсина в раствор определяемая по скорости гидролиза бычьего гемоглобина, постеаег утрачивается (рис.1). Присутствующий в реакционной смеси ДЬЯ исходные компоненты и продукт реакции не оказывают ингибирующе действия на пепсин.

Мы предположили, что потеря активности фермента в процесг синтеза связана с его соосаздением с формирующимся осадком пептиде Исчезновение активности фермента коррелировало с уменьшение содержания белка в растворе, которое оценивалось по поглощению щ 280 нм. Так, через час с момента начала реакции в надосадочкс жидкости содержалось только 33% белка от первоначально! количества. Кроме того, аминокислотный анализ кислотног гидролизата осадка синтезированного пептида обнаруживал присутстЕ! небольших количеств аминокислот, содержание которых саответствуе составу пепсина. Это свидетельствовало о том, что снижет активности пепсина в растворе связано с его соосаждением продуктом реакции.

Было показано, что при проведении катализируемого пепсин« синтеза г-А1а-А1а-РЬе-Ьеи-А1а-А1а-0СН3 в присутствии посторонн белков в реакционной смеси (лизоцима или карбоангидразы) осаждает« и пепсин, и посторонний белок. Так, при введении в реакционн; смесь лизоцима наблюдается уменьшение суммарной концентрации Селю в растворе в ходе реакции, что определялось по поглощению цри 2 нм (рис 2, кривая 1). Одновременно падает и активность пепсина

растворе (рис. 2, кривая 2), однако, соосгждение фермента происходит медленнее, чем в отсутствие постороннего белка. Наличие лизоцима в осадке также подтверждалось методом дискэлектрофореза в иолиакрилатдноы геле. '

i z ъ Время реакции, ч

1 2 Ъ k Время реакции, ч

Рис.1. Изменение активности пепсина в растворе в процессе синтеза

Z-Ala-Ala-Phe-Leu-Ala-Ala-OCHj

Рис.2. Изменение активности пепсина (1) я суммарной концентрации белков (А2ао) (2) в растворе в процессе синтеза 2-А1а-А1а-Р1ге-1,ец-А1а-А1а-ОСН3 в присутствии лизоцима. (Пепсин: лизоцим 1:5 (по массе))

Пепсин, захваченный осадком, можно частично элюировать 2 м Nací и 20% изопропиловым спиртом в 1М ацетатном буфере (рН 4,6). Качественно была показана возможность извлечения активного фермента из образовавшегося осадка электроэлвцией в электрическом поле. Интересно, что соосажденный с осадком фермент может катализировать образование пептидной связи. Например, конденсация Z-Ala-Ala-Phe-OH и H-Phe-Ala-Ala-ocEj, катализируемая пепсином, осавденным при получении пептида z-Ala-Aia-Phe-Leu-pNA, прошла с 55%-ным выходом.

Было исследовано изменение активности пепсина в растворе пр

синтезе пептидов общей формулы Z-Ala^-Xaa+Yaa-Aia-Ala-ocH-j (п=1 ил

2, Хаа, Yaa=Phe или Leu). Полученные кривые снижения активност

пепсина во времени распадаются на дзэ группы (рис.3). В случая

синтеза пептидов Z-Ala-Phe-»Phe-OCH3 И Z-Ala-?he->Leu-Ala-Ala-OCK

(кривые 1, 2) активность пепсина сохраняется без значительны

изменений в течение нескольких часов. При синтез

Z-Ala-Ala-Phe->Phe-OCH-,, Z-Ala-Ala-Phe-»Leu-Ala-Ala-OCH-,

У j

Z-Ala-Ala-Leu-»Phe-Ala-Ala-OCH3, Z-Ala-Ala-Leu->Phe-OCH3

Z-Ala-Ala-Leu-»Leu-Ala-Ala-00H3 (кривые 3-7) уже через час с момент начала реакции в растворе остается лишь 20-30% фермента. Пр использовании в качестве исходных соединений да-, а не трипептидо (кривые 1, 2 на рис.3) происходит менее эффективное связывание их активным центром фермента и, следовательно, уменьшение скороса синтеза продукта реакции. При этом замедляется образование осада пептида и пепсин дольше остается в растворе, не соосакдаясь продуктом синтеза.

12 Ъ к Время реакции, ч

Рис.3. Изменение активное! пепсина в реакциях синтез различных пептидов:

1 Z-Ala-Phe-»Phe-OCH3

2 Z-Ala-Phe-»Leu-Ala-Ala-OCH3

3 Z-Ala-Ala-Phe-»Phe-OCH3

4 Z-Ala-Ala-Phe-»Leu-Ala-Ala-OC

5 Z-Ala-Ala-beu-*Phe-Ala-Ala-OC

6 Z-Ala-Ala-Leu-»Phe-OCH3

7 Z-Ala-Ala-ieu-»beu-Ala-Ala-OC

Оказалось, что уменьшение активности пепсина в растворе може происходить не только в ходе синтеза пептидов, но и просто щ осавдении пептида из раствора, содержащего фермент. Так, щ

добавлении растворенного в ЛМФА 2-А1з-А1з-?1хе-Ьеи-А1а-А1а-осн3 в водный раствор пепсина, выпадет осадок пептида, захватывающий фермент. В аналогичных условиях осаждающимся пептидом захватывется -не только пепсин, но и другие бедки лизоцим, рибонуклеаза А, яичный альбумин.

Очевидно, важным фактором, определяющим эффективность пепсина в пептидном синтезе, является соосаждение фермента с аморфным осадком пептида. Можно предположить, что механизм соосаждения пепсина с образующимся в результате синтеза пептидом состоит в следующем. В результате кэковалентных взаимодействий между достаточно длинными молекулами продукта реакции образуются более или менее протяженные агрегаты. Из них на начальных стадиях синтеза происходит формирование геля, пронизывающего весь реакционный объем, причем в крупные ячейки геля оказываются включенными, помимо раствора исходных веществ, и молекулы бежа. Реакция продолжается дальше, гель становится все более плотным, и молекулы пепсина, катализирующие синтез, остаются заключенными внутри этой растущей структуры. В конце концов гель разрушается, при этом происходит "выталкивание" раствора низкомолекулярных компонентов, в то время как включенный белок остается внутри образовавшегося твердого (не обязательно кристаллического) осадка.

II. Катализируемый пепсином синтез пептидов в органических

растворителях.

Существует ряд преимуществ проведения реакции синтеза в органической среде по сравнению с водными растворами, в частности, возможность более глубокого сдвига равновесия реакции за счет малого содержания воды в системе, увеличение растворимости гидрофобных субстратов, легкость отделения фермента от продуктов синтеза. Мы показали возможность применения пепсина,

г»

распределенного на поверхности неорганических носителей, ферментативном синтезе пептидной связи.

и.;.Оптилалъные условия синтеза. Для приготовления катализатор раствор пепсина в 25мМ цитратном буфере (рН 4,5) смешивается носителем и высушивается до постоянного веса. После высушивая приготовленный катализатор содержит пепсин, осажденный на порист неорганическом материале, причем фермент, очевидно, находится водно-солевой оболочке, покрывающей поверхность носителя. Д проведения реакции на такой катализатор наслаивается раств исходных соединений в органическом растворителе. Реагируют пептида, содержащие заряженные группы, лучше растворимы в воде поэтому концентрируются в водной "микрофазе", непосредствен контактирующей с ферментом. Таким образом, повышается локальн концентрация реагирующих веществ вблизи активного центра фермент: и, следовательно, реакция синтеза должна протекать более эффективнс Продукт реакции, обладающий большей длиной и лишенный заряженш а-карбоксильной и а-аминогрупп, хуже растворяется в воде диффундирует в органический растворитель. В результате происходи разделение исходных веществ и продукта реакции и равновесие долж! более глубоко сдвигаться в сторону синтеза. Существенно, ч: понижение активности еоды в системе приводит к уменьшен! вероятности гидролиза образующегося пептида.

На модельной реакции конденсации трипептидов г-А1а-А1а-РЬе-он I Н-Ьеи-А1а-А1а-0СН3 были подобраны оптимальные условия синтез; пептидов. В качестве носителей пепсина использовали силохром С-80 аминосилохром, макропористое стекло и целит. Синтез пептид! наблюдался во всех случаях, однако лучший результат был получен < ферментом, осажденным на целите, и в дальнейших исследования; именно он использовался как носитель.

Прочного связывания фермента ни с одним из носителей ш

каоладайтсл - белок легко смывается уже при суспеядирсвзнии катализатора з 1М ацетатном буфере, рН 3,5. Однако, в условиях реакции пепсин удерживается носителем, будучи нерастворимым в органической фазе, что позволяет использовать одну и ту же порцию пепсина, осажденного на целите, в четырех циклах синтеза гексапептида г-А1а-А1а-Р1ае-Ьеи-А1а-А1а-осн3 з ацетонитриле. Выход продукта несколько понижается от цикла к циклу и составляет соответственно 90, 86, 80 и 71%. Снижение выхода продукта синтеза можно объяснить частичной инактивацией фермента органическим растворителем и, кроме того, постепенным переходом воды в органическую фазу.

Синтез модельного гексапептида проводили в ацетонитриле, хлористом метилене, этаноле, этилацетате, из которых ацетонитршь оказался наиболее подходящим. На ход реакции влияет содержание солей на носителе. Нанесение белка на целит в буферном растворе позволяет поддерживать постоянное значение рН в микроокружении пепсина и стабилизирует гидратную оболочку, предотвращая переход воды в органическую фазу. " Так, синтез

г-А1а-А1а-РЬе-Ьеи-А1а-А1а-осн3 не наблюдается, если пепсин нанесен на целит не в буфере, а просто в подкисленной до рН 4,5 воде, несмотря на то, что фермент не инактивируется. Максимальный выход продукта достигается значительно быстрее, если пепсин нанесен на носитель в 25 мМ буфере. Таким образом, существует оптимальное соотношение между количествами пепсина и солей на поверхности катализатора (60-600 нмоль фермента и 200 мкмоль солей на 1 г носителя).

Реакции, катализируемые пепсином в органической среде, протекают в достаточно широком диапазоне значений рН ( 3 - 4,5 ) буфера, в котором происходит нанесение фермента на целит. В случае конденсаций в ацетонитриле, катализируемых, пепсином, распределенным

на поверхности целита, 90%-НЫЙ ЕЫХОД г-А1а-А1а-РЬе-Ьеи-А1а-А1а-ОСН3 достигается за 2 ч при молярном соотношении субстратгфермент ю3:1.

Таблица 2. Синтез различных пептидов прч полет осажденного на целите пепсина.

пептид к выход, % (ПО ВЗЖХ) условия реакции

2-А1а-А1а-Р1ге-»1,еи-А1а-А1а-0СН3 (I) 90 20ч, 30°С

г-А1а-А1а-Р1ге->РЬе-ОСН3 (V) 20(70) 2ч, 30°С

Воо-11е-Р1ге-»Ьеи-А1а-А1а-0СН3 (IX) 25(70) 14ч, 18°С

г-А1а-А1а-РЬе-»Тгр-А1а-А1а-ОСН3 (XV) 90 24ч, 18°С

2-А1а-А1а-РЬе-»Туг-А1а-А1а-ОСН3 (XVI) 50(60) 20ч, 30°С

2;-А1а-А1а-Тгр-»Ьец-А1а-А1а-ОСН3 (XVII) 20(90) 18ч, 18°С

г-А1а-А1а-Тгр-*Р11е-А1а-А1а-ОСН3 (XVIII) 55(90) 20ч, 30°С

2-А1а-А1а-Туг^Ьеи-А1а-А1а-ОСН3 (XIX) 60(85) 24, 30°С

2-А1а-А1а-Ту1^РЬе-А1а-А1а-0СН3 (XX) 50(90) 204, 30°С

2-А1а-А1а-РПе-»РИе (Ш2 )-ОСН3 (XXI) 50(70) 54, 30°С

2-А1а-А1а-РКе-»Тгр-А1а-Ьеи-

А1а-РЬе-0СН3 (XXII) 80 484, 30°С

Вос-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-Р1ге-»Ьеи-

А1а-А1а-0СН3 (XXIII) 80 484, 30°С

Вос-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РЬе->Тгр- 484, 30°С,

А1а-Ьеи-А1а-Р1ге-0СН3 (XXIV) 70 10% буф.

Вос-Тгр-А1а-1еи-А1а-Р11е-»Туг- 484, 30°С,

А1а-Ьеи-А1а-РЬе-ОСН3 (XXV) 40 1056 буф.

*В скобках приводится выход за 72 ч., 30°С.

а.2.Синтез различных пептидов в ацетоишрюё, нтализируеяьсй пепсинол, распределении! на поверхности цел-лпа. С удовлетворительными выходами сыла синтезирована серия пептидов строения г-А1а-А1а-Хаа->Уаа-А1а-А1а-0СН3, где Хаа = ?1ге, Туг, Тгр; Уаа = 1еи, РИе, Тут, Тгр (Табл.2).

Синтез некоторых гоптидоз ((V), (IX), (XVII)) требует большего времени для установления равновесия (до 72 ч), но они образуются с хорошими выходами. Следует отметить значительное увеличение выхода продуктов синтеза в случаях пептидов (I) и (IX) при проведении реакций в органической среде по сравнению с водно-органической. Это связано с более глубоким сдвигом равновесия реакций в сторону синтеза из-за снижения активности воды в системе.

Нами была показана возможность введения в реакции конденсации более длинных гидрофобных пептидов (соединения (ххи)-(XXV)). Октапептиды (XXII) и (XXIII) образуются с хорошими аналитическими выходами. Условия синтеза декапептидов (XXIV) и (XXV) пришлось немного изменить. В последних случаях в реакционную смесь требуется введение до 10% буферного раствора.

III. Синтез пептидов в присутствия денатурирующих агентов.

1x1.1.Синтез серии опта- и декапептидов. Получение относительно длинных гидрофобных пептидов в водно-органической или органической среде затруднено. Так, например, конденсация пентапептидов Вос-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-ОН И Н-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-Р1ге-0СН3 С образованием Вос-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РЬечЭСН3 В смеси ДМФА с водой практически невозможна из-за низкой растворимости -исходных соединений. При проведении этой ке реакции в органической среде с использованием пепсина, распределенного на поверхности целита, продукт реакции осаждается на катализаторе.

Мы предположили, что введение денатурирующих агентов - мочевины,

гуанидинз или додецилсульфата натрия - в реакционную смесь уменье гидрофобные взаимодействия между молекулами исходных соединений повысит за растворимость з водно-органической среде. Нами бы показано, что после 24 ч инкубации в 1М цитратном буфере, рН 4,6 содержащем 8М мочевину, пепсин не утрачивает своей активност! Учитывая это, мы вводили мочеьину в реакционную смесь п конденсации пептидов с участием пепсина. Так, добавляя 8М мочевш в 1М цитратном буфере к растворам пентапептидов в ДМФА, удаетс провести синтез окта- и декапептидов в 27% ДМФА и 4,3 М мочевш (Табл. 3).

Таблица 3. Пептиды, полученные с полощью пепсина в растворах, содержащих 4,3 М лочевину и 2?%-шй ДМФА.

Аналитические выходы определяли с помощью ВЗНОС.

Пептид

анал щ

2-А1а-А1а-РЬе-»Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-0СН3

2-А1а-А1а-РЬе-*Туг-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-ОСН3

Вос-Туг-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-»Ьеа-А1а-А1а-ОСН3

Вос-Т2^р-А1а-Ьеи-А1а-РКе-»Ьеи-А1а-А1а-ОСН3

Воо-Туг-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-»Туг-А1а-1еи-А1а-РЬе-

Вос-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РКе-»Тгр-А1а-Ьеи-А1а-Р11е-

Воо-Тгр-А1а-Ьеи-А1а-Р1ге-»Туг-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-

Вос-Туг-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-»Тгр-А1а-Ьеи-А1а-РЬе-

(XXII) 95

(XXVI) 95

(XXVII) 84

(XXIII) 46

3(XXVIII) 66

3 (XXIV) 51

3 (XXV) 42

3 (XXIX) 55

Оптимальные условия были подобраны на примере реакции синт< октапептида 2-А1а-А1а-РЬе-*Тгр-А1а-Ьеи-А1а-Р1-1е-ОСН3 (XXI:

полученном с 95%-ным выходом за 48ч. при соотношении [Б]:[Е] ю3

В этих условиях с 84-95&-ными выходами были синтезированы также октапептиды г-АХа-АХа-Рке^т^АХа-Ьеи-АХа-РЬе-ССН^ (XXVI),

Вос-Туг-А1а-Ьеи-А1а-?Ье*Ьеи-А1а-А1а-ССН3 (XXVII). Так как реакции синтеза проходил:! практически до :-;онца, то после промывания образовавшегося осадка водой легко выделяются чистые продукты реакции. Конденсация пентапептидов проходят в 4,3 М мочевине при 32Ж-ном содержании ДМФА в реакционной смеси (Табл. 3).

ш.г.Сравнение поведения пепсина как кажииэалюра образования пептидных связей в присутствии и в отсутствие лочевинн. Представляет интерес сравнение поведения пепсина как в присутствии, так и в отсутствие денатурирующего агента ез примере синтеза модельного пептида' г-АХа-АХа-РЬе-^Ьеи-АХа-АХа-осн^ Увеличение концентрации мочевины уменьшает выход пептида (Рис. 4). В специальном спыте было показано, что в 8 М мочевине 20%-ный выход гексапептида й-АХа-АХа-РЬе-Ьеи-АХа-АХа-осн^ Слизок к равновесному, поскольку при инкубации гексапептидэ в этих же условиях он расщепляется пепсином на трипептиды, так что через 48 ч в смеси сохраняется 25% гексапептида (Рис. 5). Очевидно, мочевина повышает растворимость не только исходных соединений, но и продукта реакции.

Нами была выбрана концентрация мочевины, при которой еыход 2-А1а-А1а-Р1ге-Ьеи-А1а-А1а-ОСН3 был достаточно большим - (5,5 М мочевина в 20% ДМФА) и в этих условиях изучалась зависимость выхода гексапептида от концентрации пепсина. Через 20 часов при 20°С достигалось равновесие при соотношении [Б]:[Е] ю5:1, так ге как и в отсутствие мочевины. Мочевина не оказывает влияедя и на рН-оптимум равновесного синтеза - максимальные выходы достигаются при рН 4-5 так же, как и в отсутствие денатурирующего агента.

. п

35 ¿С 'I-

1=1 О >4

20,-

г * 6 в [Мочевина), JM

¿0 ■

3 20' N

¿4 Зо (М

Время, ч

Рис. 4. Зависимость Еыхода г-А1а-А1а-РЬе-Ьеи-А1а-А1а-ОСН3 от содержания мочевины в реакционной смеси.

3'

Рис. 5. Зависимость от времени синтеза (1) и гидролиза (2) 2-А1а-А1а-?Пе-Ьеи-А1а-А1а-ОСН3 катализируемых пепсином в 8 М мочевине и 20% ДМФА. По оси ординат отложено молярное процентное содержание гексапептида в реакционной смеа

г

Соосаздение пепсина с продуктом реакции наблюдается и I присутствии 5,3 М мочевины. Так, при соотношении [Б]:1Е] ю3:1, потеря активности пепсина происходит немного медленнее по сравненю с обычными условиями. При использовании меньших количеств ферментг ([Б]:[Е] Ю5:1) активный пепсин значительно дольше находится ] растворе (рис. 6), но увеличение выхода продукта сопровождаете: захватом фермента из раствора.

Следовательно, введение в реакционную среду мочевины существен» не изменяет поведение пепсина как катализатора образована пептидной связи, хотя нельзя исключить влияния мочевины на кинетик; процессов.

Рис. 6. Активность пепсина з гастзоге (1) * -

И ЕЫХОД 2-А1а-А1а-РЬе-1«и-А1а-А1а-ОСЕ, (2) в хсде синтеза в 5,3 М мочевине ([Б]: [Е]=ю5:1 ).

[оказано, что пепсин такге сохраяет активность после 24 ч гСир-эвания з растворах 6 М гидрсхлсридэ гуанидинэ и 0,5? ;цилсульфатэ натрия. При проведении конденсации трягептидэз .з-А1а-РЬе-сн и н-Ьеи-А1а-А1а-0С1Ц, катализируемой пепсином, при гении 4,8 М гидрохлорида гуаниджа или 0,35$ додецилсульф-ата :ия в реакционную смесь модельный гексапептид образуется с 60 и -ными выходами соответственно.

штор выражает глубокую благодарность И.Ю.Филипповой и .Лысогорской за постоянную помощь з планировании и проведении тедований и Е.С.Оксенойт за осуществление синтеза исходных идов.

т

выводы.

1.Развит метод ферментативного синтеза пептидов при помощи пепсина в годно-органической среде, о препаративными выходами получена серия три - гексгпептидов. Обнаружено, что в процессе реакции происходит соосаздение фермента с образующимся осадком пептида, при этом пепсин не теряет активности. Скорость соосаждения фермента зависит от структуры синтезируемого соединения и от условий проведения реакции.

2.Показана возможность использования пепсина, распределенного нг поверхности неорганического носителя, в реакциях синтеза пептидов е органической среде, что обеспечивает более глубокий сдвиг равновесия в сторону образования продуктов конденсации. Применение органических растворителей с малым содержанием воды позволяв провести синтез гидрофобных тетра - декапептидов разлкчногс строения с высокими выходами (60-90%).

3.Найдено, что пепсин может катализировать образование пептидно связи в концентрированных растворах денатурирующих агентов мочевины, гидрохлорида гуанидина, а также додецилсульфата натрия Изучены закономерности ферментативного синтеза пептидов катализируемого пепсином, в присутствии высоких концентраци мочевины. Введение денатурирующих агентов в реакционную смес открывает возможности для препаративного получения протяжений гидрофобных пептидов, склонных к образованию вторичной структуры.

Основное содержание работы изложено в следующих публикациях:

1. Адли К., Филиппова И.Ю., Лысогорская E.H., Анисимова В.В.

Лавренова Г.И., Оксенойт Е.С., Степанов В.М. Использовани

пепсина в синтезе п-нитроанилидов и эфиров пептидов. - В сб.

Тезисы докладов vil Всесоюзного симпозиума "Инженерна

энзимология". Москва, 1991, с.71.

Pilippova I.Yu., Lysogorskaya 3.N., Anisimova Y.V., Abdel Malak C.A. , Lavrenova G.I., Stepancv 7.if.. Pepsin behavior as a catalyst in equilibrium-control_=d peptide synthesis. - Workshop "Enzymes in Peptide Synthesis", 3cgensee (Germany). Sept.2-6. 1991. P.71.

Lysogcrskaya E.N., Pilippova I.Yu., Abdel Malak C.A., Anisimova V.V., Oksenoit E.S., Lavrenova G.I., Stepanov V.M.. Pepsin-catalyzed synthesis of protected peptide p-nitrcanilides and esters. - Workshop "Enzymes in Peptide Synthesis", Bcgensee (Germany). Sept.2-6. 1991. P.76.

Pilippova I.Yu., Lysogorskaya Z.X., Anisimova V.V., Abdel Malak C.A., Lavrenova G.I., Stepancv Y.J£.. Pepsin behavior as a catalyst in equilibrium-controlled peptide synthesis. - Biomed. Biochim. Acta. 1991.V.50, No.10/11. ?.98-101. Лысогорская E.H., Филиппова И.Б., Абделъ Малак К.А., Лазренова Г.И., Анисимова В.В., Оксенойт Н.С., Степанов В.М. Пепсин в ферментативном синтезе эфиров л п-нитроанилидов пептидов. -Биоорган, химия. 1992. Т.18. о. С.1081-1088. Abdel Malak С.А., Pilippova I.Yu., Lysogorskaya E.N., Anisimova V.V., Lavrenova G.I., Stepanov 7.M.. Pepsin as a catalyst of peptide synthesis - enzyme cc-prs-cipitation with emerging peptide products. - Int. J. Pept. к Prot. Res. 1992. V.39. N0.5. p.443-449.

Анисимова B.B., Филиппова И.Ю., Лысогорская E.H., Оксенойт Е.С., Степанов В.М. Пепсин как катализатор образования пептидных связей в органических растворителях. - ill симпозиум "Химия протеолитических ферментов". Тезисы докладов и стендовых сообщений. Москва, 1993. С.124.

Филиппова И.Ю., Лысогорская E.H., Аннсимова В.В., Абдель Малак К.А., Лавренова Г.И., Анисимова В.Е., Оксенойт Е.С., Степанов

ш

B.M. Соосзждение пепсина с продуктами ферментативного синтез' пептидов как фактор, ограничивающий эффективность фермента. Биохимия. 1993. Т.53. Вып.6. С.921-927.

9. Анисимова В.В., Лысогорская Е.Н., Филиппова И.Ю., Оксенойт E.G. Степанов В.М. Катализируемый пепсином синтез пептидов органических растворителях. - Биоорган, химия. 1994. Т.20. J6 3

C.316-322

10.Anisimova V.V., Filippova I.Yu., Lysogorskaya E.N., Oksenoi1 E.S., Kolobanova S.Y., Stepanov V.M. Proteinase-catalyze peptide synthesis in concentrated solutions c£ urea and о the., denaturing agents. - Int. J. Pept. & Prot. Res. (in press).

/