Ферментативный анализ пептидов, содержащих остатки аргинина и лизина тема автореферата и диссертации по химии, 02.00.10 ВАК РФ
Терентьева, Елена Юрьевна
АВТОР
|
||||
кандидата химических наук
УЧЕНАЯ СТЕПЕНЬ
|
||||
Москва
МЕСТО ЗАЩИТЫ
|
||||
1995
ГОД ЗАЩИТЫ
|
|
02.00.10
КОД ВАК РФ
|
||
|
Р Г 5 ОД
МОСКОВСКИ! ОРДШД ЛЕШНА И ТРУДОВОГО КРАСНОГО ЗНАМЕНИ
0 Ч АКТ Г^аАРСТВШНЫ;! УНИВЕРСИТЕТ Екенп М.З. ЛОМОНОСОВА
1 О и1\1 1ЗДЭ. УШИЧТОККЙ бАТШтТТТГ
На правах рукописи
ТлРШТЬЕВА ШИНА ЮРЬ2ША
УДК 577.152
ФЕРМЕНТАТИВНЫЙ СИНТЕЗ ПЕПТИДОЗ, СОДЗРШЖ ОСТАТКИ АРПЙИНА И ЛИЗИНА
Специальность - 02.СО.10 Еиоорганическая химия, химия природных и физиологически активных веществ
АВТОРЕФЕРАТ
диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук
Москва 1995
Работа выполнена в Государственном научно-исследовательском институте генетики и селекции промышленных микроорганизмов.
Научные руководители: доктор химических наук,
профессор В.М. Степанов,
. кандидат химических наук с.н.с. Т.Л. Воннина
Официальные оппоненты: доктор химических наук,
профессор Ю.П. Швачкин
доктор химических наук, Л.В. Козлов
Ведущая организация: Институт Сиоорганиче-ской химии РАН
им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова
Защита состоится НкК()кР1ЪЪЬ г. в 16 ч. на заседании
специализированного совета Д 053.05.47 по химическим наукам при Московском государственном университете им. Ы.В.Ломоносова по адресу II95'99 ГСП, Москва В-234, Ленинские горы, МГУ, лаСороторный корпус "А", аудитория
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке химического факультета ¡.{ГУ.
Автореферат разослан ¿ЩА'АУ 1ЭЭ5 г.
Ученый секретарь специализированного совета кандидат химических наук / ^ К.Г.Смирнова
лгЩАа Т<ШтЛ'гт,ТГТЖГ'ФТГ1Г* ТЭДЕУУПМ
Актуальность теиы. Использование ферментов в качестве катализаторов является перспективном подходе;,; при синтезе 'нолсгически активных соединений, поскольку позволяет в мягких услс=лях получать препараты высокой степени химической и оптическсй чистоты. Успешно развизается ферментативный синтез пептидов, з котором видная рель прпнадлезгит сериновым претекназам. Е-^пт'зрнальные фс-р-менты этого класса до недавнего времени еае недостаточно широко применялись для этой цели, поэтому избранная нами гг.ча - применение суотилигпка для синтеза пептидов, соде ржаных остатки аргинина и лизина - является актуальней.
Цель и задачи исследования. Основная
оЗди Чс5 с! ■„•'„гТ1*. О а 0/1»ЛЗ л-!
дальнейшем раэЗътхм летхода ферлеьгхяшбного сикпеза. '«етлхмЗсв с использоЕ-знием з качестве катализаторов сериновых протеиназ, прежде всего субтилизина. Уд -поставили своей целью создаете экзи-матичеексго подхода к получению пептидов, включающих зжнокислоты с функциональными группами в боковой цепи - аргинин и лизин. Помимо развития общего метода в нашу задачу _входила разработка ферментативного синтеза хралогенких субстратов для протеиназ системы гемостаза. Для этого был получен ряд пептидов, содержащих на С-конце я-нитроанилиды аргинина и лизина. Еще одним приложением разработанного нами подхода стал синтез пептида, влгязощего на клеточную адгезия - пенжпеглшдного фрогленли .юлижнг - Ас-Туг-Ие-О1у-Зег-Аг§-Он и его аналогов. В эти соединения потаю остатков аргинина и тирозина входит остаток серина, содеркгдий гидрок-силъную группу в боковой цепи, что делает их ферментатдвный синтез интересной в методическом отношении задачей.
Научная новизна и практическая ценность работы. Впегзие ферментативный метод синтеза использован для получения болыгого набора п-нитроанилидов пептидов, содержащих на С-конце остаткж аргинина или лизина. Впервые с использованием ферментов, сорбированных на носителе, синтезирован пентапептидный фрагмент ламинина, ответственный за связывание рецепторов опухолевых клеток. Практическая значимость работы состоит в- возможности осуществления масштабного синтеза хромогенных субстратов сериноЕых протеиназ, в том числе протеиназ систеш гемостаза, а также пегстда адгезии Туг-НеЧЛу-
5-r-Arg и его аналогов - потенциальных ингибиторов лгминина.
Публикация и апробация работы. Материалы исследования по те. лиссёотчции ОПУбЛИКОВSHH в Четырех CTäTbriX, 2 ТЙКЖ9 бЫЛИ ПреДСТ';
r.--7öri на Бсеес-йбных снмпс-?иумй>: но химий пептидов и белков в !?Э0 г. и ~ Москве в ' гЭ1 г., на семинаре "Ферменты -ятттг!синтезе" в Богеньее, Германия, в 1931 г. и на III Сил по хиуии протеолйт:^ческ»5х ферментов в Москве в 1S93 г.
Структура и объеу диссертации. Диссертация состоит из ВЕеде.1 ля, обзора литераторы, посвященного возможностям и проблем* ферментативного синтеза в органической среде с м^лым содержание вода, обсуждения результатов, экспериментальной части, выводов списка цитируемой литературы [ ссылок]. Диссертация содержа ^ рисунков и 9 таблиц. Полный обьем работы /^страниц .
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ Еабор фермента - катализатора.
В качестве катализаторов синтеза пептидов мы использовали ода ;:з субтияизиков бацилл - еериновую протеина:? у Вас.subtills шт.1 ,'субтнлизин V2), стабильный, доступный фермент достаточно широкс специфичности. Важное значение имел и опыт работы с этой протез назой, накопленный в нашей лаборатории. В некоторых случаях П] синтезе коротких пептидов мн использовали а-химотрипсин, - прот* иназу, менее т-ребователъну» к длине цепи карбоксильного и амине компонента.
Синтез ацилпептидов, содержащих п-нитроанилиды основных аминокислот, катализируемый ферментом в растворе.
В качестве аминокомпонентов использовали п-нитроанилиды арп нина и лизика, а в качестве ацилирущих компонентов - метилоы гфгры бензилоксикарбонил (£) да- и трипептидов, синтез катализ] ровался субтилизином 72. Первоначально реакции проводили в вод» органической среде при рН 7,5-8,4, содержащей минимальное колич( ство.ДМФ для растворения исходных реагентов.
Рассмотрим механизм реакции на примере синтеза 2-А1а-А1а-РЬ
АТ£ I -лМ-'^'Л яге* ира крайним /еОМ'укОя
2-А1а-А1 а-РЬе-ОСН~, введенном для камп^-ясации про те к а ?.чде го параллельно ферментативного гидролиза эфирной связи. Типичные кинетические кривые представлены на рисунке 1.
Piic. 1. Зависимость содержания компонентов реакционном смеси от времени при синтезе Z-A!a-Ala-I'he-Arg-/>NA, катализируемом субпсишшом 72 в растворе. Условия: 40% ДМФ, рН 8.4. (I )-Z- Ala-Ala- Phe-OC Н3.
(2)-Z-Ali-Ah-Phe-Arg-/)NTA,
(3)-Z-Ala-Ah-Phe-OH.
• 50 -
100 usra 20ч
Синтез протекает через стадию образования ацилфермента ш следующей схеме: _ • ■ - . '
г-А1а-А1а-РЬе-А1^-рНА + Е-ОН
Z-Ala-Ala-Phe-ОСНз + Е-ОН ■'
С)
(2)
+H-Arg-pNA
(-2)
-H-Arg-pNA
(фермент) (-1 )
Z-Ala-Ala-Phe-O-E + СН3ОН
(3) +1^0
(-3) -H2°
Z-Ala-Ala-?he-OÏÏ + Е-ОН
Ацилфермент - г-А1а-А1а-Р11е-Ф-Е - быстро образуется по реакции (1), чему способствует использование активированного эфиром кар-5оксильного компонента й-АХа-АХа-РЬе-ОСНд. Далее он подвергается гуклеофильной атаке аминокомпонентом Н-Аг^-рМ (реакция 2), кото-зая приводит к образованию целевого продукта г-А1а-А1а-Р11е-А^-зМА (кривая 2, рис. 1.), или водой (реакция 3), результатом чего гвляется гидролиз ацилфермента и, соответственно, исходного эфира
с образованием Z-Ala-AIa-beu-OK (кривая (3), рис. !,,. ре-з 2 мин выход п-нитро&нилида тетоапептида достигает г^^ксимальног значения - 355, - после чего постепенно уменьшается нз-за актив» псотека^дего вторичного гидролиза 2-Ala-AIa-?hy-Ar¿-pNA по син-rt зированкой связи.
Качественно аналогичная картина повторяется и при . синте: Z-füa-AIa-Leu-Arg-pNA с той лишь разницей, что максимальный вкхс - 25% достигается за 4,5 мин. В конечном счете в обоих случа весь ацшшруулций компонент превращается в продукт гидролиза. .
Б ряде случаев эффективность гидролиза хромогенных субстратс (производных трипептидов) 'трипсиноподобными протеиназами сущес венно повышается, если подцентр Sg занят D-аминокислотой субстр; та írozsgay, 1930, 1?ЗП. Учитывая это, мы попытались найти огга мальные условия для синтеза Z—D—Ala—Leu—Arg—рКА и 2—D—Ala—Leu—Ъ; —p*v\. Рисунок 2. иллюстрирует ход синтеза Z—D—Ala—Ъви—I^ys—pNA -ттгат рплчшпгюшлт^ карбоксильного и аминочомпонентоз
О/
.-Л
Рис. 2. Зависамосгь содержания компонентой . реакционной смеси о
BpCMCllH IIpII ClllITwC
D-.Ala-Lcu-L.vs-/jN А, катализируемом субтнлилшом 72 п • растворе. Услошш: 2 ДМФ, pH 13. ; (!)-Z-D-A!a-Leu-OCH3, (:)-Z-D-Ala-L«j-I.vs-/fN.' (3)-Z-D-Ala-Leu-OH.
160
320
•4S0 мин
Скорость этих реакций значительно ниже, чем в синте п-нитроакилидов тетрапептидов, что объясняется кеблагеприятн влиянием В—аминокислоты к меньшей длиной эфира дипептида по ср внению с трипептидом. Максимальный выход 2—13—А1 а—Ьей-лг^—р составил около 20%, а г-С-Лха-Ьеи-Ьуз-рМ около 50%.
Одним из способов уменьшить первичный и вторичный гидрол является повышение содержания органического растворителя в ре
кцисккой смеси [Бокаина, 1935ï. Однако, высокие концэнтрышл ДМЗ могут инактивировать растворенный фермент iDordick, 19391. ¥яьгл было найлено, что при выдергивании в 62£-ом активность субти— лизкнэ 72 уменьшается 5 32 pasa за 4,5 часа, а в 92?-ом - в 29 раз уже за 45 мин. Синтез Z-Ala-AIa-Phe-Arg-pNA в 925- ьоинсч останавливается через 13 мин при 30S выходе тетрапептнда и 58« неизрасходованного эфира тр-ипептида.
Использование менее концентрированного - T-Zv-SSZ водного рае? вора Л?.'Ф и на порядок большего количества фермента (Таблица 1 > дало более приемлемые результата. В этих условиях были получены Z-Ala-Ala-Leu-Arg-pNA с выходом реакции 84À и выходом Енделения 5GS, и Z-D-AIa-Leu-Arg-pNA с 70% выходом реакции и 46% выходом ьыделекия.
В этой части работы мы показали возможность синтеза aцитированных три- и тетрапептидов с С-концевым n-нитроанилидом этгинина и лизина по реакции, катализируемой субтилизином 72, находящемся в растЕоре. Выходы полученных соединений и условия их синтеза суммированы в Таблице 1.
Таблица 1. Синтез пептидов, катализируемый субтилизином 72, в водных растворах, содержащих
ПЕПТИД
Исходная концентрация реагентов
RC00CH мМ
Xaa-piíA мм
фермент мкМ
Время Выход реакции продукта
ЛМФ
%
Ala-Ala-Leu-Arg-pNA
Ala-Ala-Phe-Arg-pNA Z-Ala-Ala-Arg-pNA
Z-D-Ala-Leu-Arg-pNA Z-D-Ala-Leu-Lys-pNA
38,3 152
33,8
163
168
40
40
19,4
76
19,4
83
88
20
20
0,24 8,7
0,24
9,6
9,6
0,17
0,19
Z-D-Ála-Leu-Arg-pNA 200 100 138
20 83
40
80
80
20
20
70
4 МИН
22 ч 22 мин
5 мин 4 ч
7 ч
8 ч 7 ч
25 Ы
35
3-0
37
20
50
70
У этого способа, однако, имеются и серьезные недостатки - ина-
кт;;ьаиия фермента при высоком содержании ДМФ и большой вкла; гидролитических процессов, затру дня?жий достижение ъысокнх выходе з пептидов. Трудоемко и выделение продукта из реакционной смес; сложного устава, включающее неоднократную экстракции неполярны/-растворителем и колоночную хтзоматогоафию на ионнообменнике.
Синтез пептидов, включающих основные аминокислоты, в среде органических растворителей с малым содержанием вода, катализируемый сорбированными протеиназаки.
Для радикального подавления гидролитических процессов мы обратились к проведению пептидного синтеза в смеси ДМФ и ацетонитрил; с низким содержанием вода, используя в качестве катализатор; оубтилизин и.тл а-химотрипсин, сорбированные на макропористо» стекле С?й-1П или силохроме [АсИегоге^г е1 аХ, 1938]. Поверхность этих сорбентов насыщена гидроксильными силанольными группами (-31-0К) и при высушивании катализатора удерживает связанную < ней гидратную воду. При перенесении сорбированной протеиназы ■ органический растворитель водное микроокружение предохраняв' фермент от инактивации. В то же время показано [Уеппаиаг а! 1994, е+, а1, 19931, что конформация активного центр:
а-химотрипсикл и субтилизина в органической среде аналогична той которую они имеют в воде, и механизм катализа одинаков в любы: растворителях.
При катализе реакций сорбированным субтилизином 72 в большинстве случаев не требовалось введения в систему воды, хотя небольшое ее количество, очевидно, содержится в растворителях, носите ле, ферменте. Рассмотрим'более подробно реакцию - " '
субтилизин
г-АХа-АХа-РИе-ОСНз + Н-Аг£-рКА -► г-А1а-А1а-?Ь.е-Агз-рМ
в 28%-ои ДМФ в СН^СН при молярном соотношении аминокомпонента : сложного эфира трипептида 1:1,1 (Рис 3.)
В течение первого часа наблюдается активный синте: п-нитроанилида ацилтетрапептида (кривая 2), содержание эфир трипептида быстро падает (кривая 1), и лишь небольшая его дол
(около 12%) гпдролизуется с образованием 2-А1а-А1з-?пе-0К. Чтобы перекрыть потери за счет гидролиза ^ этс« опыте вполне достаточным был 10% избыток 2-А1а-А1а-Р11е-0СК^. Основное отличие рассматриваемого подхода от ферментативного с;шт-зза з водяо-отзганической среде состоит в подавлении первичного и коричного гидролиза, что приводит к высокому выходу целевого пептида, который составил 99«, выход после выделения - 85%.
%
Рис. 3. Зависимость содержания компонентов реакционной смеси от времени при синтезе Z-А!л-АЬ-РЬе-АгЕг-/;\'А. ■ катализируемо:.; сорбированным субталзпшюм 72. • Условия: 28% ДМФ з гшмошгтрилс. (1>-г-ЛЬ-.Л1з-Р!1е-ОСИз, (^^АЬ-АЬ-РЬе-Аг^чА, (3>-г-А!п-А!а-РЬе-ОН.
По нашему мнению, в случае применения сорбированного фермента концентрация аминокомпонента - Н-Агз-рйА алн Е-Ьуз-рИА в гидрат-ном слое вокруг протеиназы может быть весьма велика, т.к. используемые нуклеофилы достаточно гидрсфиьнн. Это обстоятельство способствует преимущественному взаимоде£стБШ> -ацилфермента с молекулами нуклеофила с образованием целевого пептида, а не с молекулами гидратной воды..п-Нитроанилид ацщщрованного пептида,' видимо, переходит в органический растворитель, удаляясь от сорбированной протеиназы, что, в йзою очередь, затрудняет вторичный гидролиз продукта.
Высокий выход и простота состава реакционной смеси делает удобным и выделение полученного пептида. 15? окончании синтеза и отделения катализатора раствор концентрируют и осавдают п-нитроанилид защищенного тетрапептида этадацетатом или толуолом.
Ферментативный синтез набора п-ннтроанилидов пептидов -потенциальных субстратов трипсиноподобных протеиназ
В нашу задачу входил синтез субстратов для ферментов систем! гемостаза, родственных трипсину по первичной специфичности, н-. сблада;сщих хорошо выраженной вторичной специфичностью. Ка основ разработанного метода мы синтезировали набор тетрапептидов обще! Формулы Z—А 1а-А1&-лаа-"в&-р1<"А, где Хаа (положение F«) - остатю ijí'-i, Trp, 1 уг, HÍ5, Met, Ala, Ile, Píie, - a Y&a (положение Pj) остатки Arg или Lys. Б качестве катализатора ь этой серии опыте: был 'использован сорбированный субтилизин 72. Основные условия ¡ выходы полученных соединений приведены в таблице 2. Почти вс синтезы проведены с высокими выходами реакции - 75-100% - и выде ления - 70-77%. Исключение составили два тетрапептида с Не I-Ala-Ala-Ile-Arg-pNA (17%) и Z-Ala-Ala-Iie-Lys-pNA и лизин содержаний пептид с Hís - Z-AI&-Aia-His-Iys-pN*A.
Отметим, что в предложенных нами условиях удается ввести в синтез ацилирущие компоненты, содержащие в качестве С-концевы остатки триптофана, тирозина и гистидина - аминокислот с функци опальными группами в боковой цепи, которые нередко требуют допол нительной защиты в химическом синтезе. Все три соединения - Z АIа-А1a-Trp-Arg-pNA, Z-Ala-Aia-Ty^-Arg-pNA и Z-Aia-Ala-Hís-Arg-р-:,'А - были получены с высокими выходами - 100%, 100« и 83%, соот ьетственнно. Выхода выделенных пептидов составили 78% для триптофан- и 79% - для тирозин-содержащих пептидов.
С использованием субтилизина 72 было также получено нескольк« тг-нитроанилидов трипегггидов, три из которых содержали остати В-аминокислот в положении Рд (Таблица 3). Выходы реакции составили 61-33«, выходы выделения около 70%.
Почти все ацилирущие компоненты, использованные для получени: аргинин-содержащих пептидов, были введены также в синтез с H-Lys pNA (таблица 2), например:
субтилизин
Z-Ala-Ala-Trp-0CH3 + H-Lys-pNA-» Z-А1 а-А ia-Trp-Lys -pNA
Хотя лизин имеет £-аминогруппу в боковой цепи, ее защита : синтезе не потребовалась, что объясняется региоселективность;
Таблица 2. Синтез гс-нитроанилидоз тетрапептидов с использованием в качестве катализатора сорбированного субтилизина 72. Условия: 2о% 72« ацетонитрила, 20° С.
Пептид Молярное ИСОССНд Выход продукта
соотношение концентра- по !выделе—
Н( К) -рНА :НС00СН3:Е ЦИЯ, реакции ни я
мМ % %
¿-А1а-А1а-Ьеи--»А^-рНА 1 :1.1 1.9*10-4 —4 17.1 97 70
П Пг, Пп П^а V и— дха~«хс*— х ис—*п1 ¿^—у^п 1 :1.1 1.9*10 17.1 99* 85
2-А1а-А1а-А1а—>Агг-р"А 1 :1.5 8.4*10-4 —4 21.4 ' 93 83
г-А1а-А1а-7гр-~* Аг£-рИА 1 : 1.5 7.5*10 -4 42.1 100* 78
г-А1а- А Ха-Туг—► Аг§-рМ 1 :1.5 7.' *10 —4 / о »э • о 100* 79
2-А1а-А1а-?,Гег—АГ£-рТИ * : 1.5 3.3*10 42.3 100 83
2-А1а-А1а-Н1з-*Аг5-рНА 1 :1.5 3.8*10 о «♦¿I «о 83** -
2-А1а-А1а-11е-*Аг£-р?«тА 4 < : 2 1.6*10 41.7 17** -
г-АХа-АХа-Пе—»Ьуз-рНА 1 :.. с- 3.3*10-3 57.2 48** -
2-А1а-А1а-РЬе—»Ьуэ-риА 1 :1.1 3.3*10"3 34.2 95 77
г-АХа-АХа-Ьеи-^Ъуз-рЯА 1 :1.1 3.3*1 о"3 3^.2 85 -
2-А1а-А1а-Тгр—Ъув-рМА 1 :1.5 3.8*10-4 42.8 76 -
г-АХа-АХа-Туг—Ьуэ-рКА 1 :1.5 3.8*10"4 42.8 75 -
г-АХа-АХа-ЯХв—Ьуз-рЯА 1 :1.5 3.8*10-3 42.8 40** -
*Время реакции 4ч. В остальных случаях время реакции 24 ч.
*Время реакции 72 ч
ToCví/IiI3 о . C»IH?63 П.—КйТрОйпЛ-чДЛОБ ТргТПвПТИДОВ, К Э 7 S ЛИ. 3 Иру 'г Vü Л о *'рб;гр о б SKKK м с у б та лл о FlH о м 72. Многократное и спол ь з о ь а ни
пТо.
— _ , ^Г-» ^ ir» TJ Г> -IT --V /-> 'J /-»
•«^v.VDh". . ' , < 't-Xf О . — * ** » ^ •
К он и с н т р.^ 'J>i я H-Arg-pNA 17,2 мУ, H-Lys-pNA - 7-¿ мУ.
Молярное Номер Бремя Выход
Пептид соотношение цикла реакции по pea
R (К ) -pliА : RCCGCE-J : S Ц ЦК!-,
гт ¿J" -Е-Al a-Leu— Arg-pNA 1:2:5. 4* 10"3 1 39 96
? 52 96
г" -1 93
1:2:8.5*10~~ 1 24 9-3
2 42 96
3 46 9:
4 69 9 ¿
2;. -D-rro-Fïie—»Arg-pNA 1:2:1. 4* 1 G~~ 1 24 8;
2 26 7{
3 84 61
¿j- -B-7al-Leu—Arg-pNA t:1,8:9,8«10~2 1 168 т:
г» ¿>- о -Ala-Ala—Arg-pNA 1:1.5:4.'»'G ~ 1 1.5 9(
2 1.5 8=
3 20 8'
F7 ь- -Ala-Ala—Lys-pNA 1:1.5:3.4*1 G-3 1 1.5 9<
2 2 9
3 19 9
4 72 8'
Фермента. Четыре тетрапептида - 2-А1а-А1а-?Ье-1у8-рг<А, 2-А1а-А1а-Ьеи-Ьуз-р^А, 2-А1а-А1а-1гр-1уз-рКА уи 2-А1а-А1а-Туг-Ьуз-р«А были получены с хорошими выходами - 55?, 85-, 75? и 75%, соответствен но. Фенилалакин-содераащий пептид был выделен препаративно с выходом 77?.
Субтилизин обладает протяженной зоной связывания, поэтому в синтезах, катализируемых этим ферментом, эффективными ацилирукщи-мя агентами являются производные трипелтидов. При синтезе коротких субстратов - да- и трипептицов, по нашему мнению, более эффективен сорбированный с-химотрипсин - фермент, .менее требовательный к длине цепи ацилирунцего компонента.
Таблица 4. Синтез п-нктроанилидов трнпептадов, катализируемый сорбированном с-химотрипеином.
Условия: 2655 Д®, 2,2% Н~0, 69.8% СН3СК, 20° С, 24 ч. Концентрация К-А^-р»ЧА - 15,1 мМ, Н-Ьуз-рЯА - 30,2 мМ.
Пептид Молярное Выход продукта, %
соотношение .по выде-
К (К) ■-р«у А: ЯС00СН3: Е реакции ления
1:2:3.8 10"3 97* 75
г-РИе—>Аг£-рМ 1:2:7.5 10~3 97 60
Бос-С1у-РЬе—*Аг£-рКА 1:2:7.5 10~3 98 44
Зос-СИу-РЬе—»Ьуз-рМ 1:2:3.8 10~3 53 -
г-А1а-?11е— ЬуБ-рМ 1:2:3.8 Ю-3 63 • -
*Выход через 6 ч.
Нами было синтезировано пять пептидов по реакциям, катализируемым этой протеиназой (Таблица 4), например:
•
а-ХИМОТрИПСИН г-РЪе-ОСНз + Н-АгЕ~рКА -» £-?Ъ.е-кТ£-рК\
Все синтезы проводились при соотношении аминкого и ацилирующ; го компонентов 1:2 в 28Ж-ом ДМФ в ацетонитриле в присутстну 2,25-ов воды. Степень превращения H-Arg-pNA в этих синтезах бли; ка к количественной. При образовании пептидной связи с H-Lys-p* в тех не условиях она была ниже. Видимо, для «д-химотрипси*-я-нитроанилид лизша менее предпочтителен в качестве нуклеофила.
Таким образом, каш были синтезированы двадцать четы£ п-нитроанилида пептида с остатками аргинина или лизина на C-kohl при использовании в качестве катализаторов сорбированных субтша-зина 72 и а-химотрипсина. Все это указывает на общность предлс женного метода и его пригодность для масштабирования.
Исследование гидролиза полученных я-нитроанилидов пептидов различных« сериновыми протеиназами.
Заключительной стадией этого этапа работы стало исследована возможности использования полученных соединений в качестве хроме генных субстратов для ферментов системы гемостаза. Поскольку si протеиназы по первичной специфичности близки трипсину, для част пептидов были определены кинетические параметры их гидроли; трипсином (Таблица 5).
Все испытанные пептиды хорошо гидролизуются трипсином с отще плением п-нитроанилина, наиболее эффективно - Z-Ala-Ala-Arg-pJ (N°1) и Z-Ala-Ala-Ala-Arg-pHA (N°3).
Тетрапептиды, содержащие остатки фенилаланина, триптофана метионина в положении Pg несколько хуже гидролизуются этим фе^ ментом, возможно, из-за стерических препятствий. Наши даннъ находятся в соответствии с данными Пожгай и сотрудников, tPozsgi et al, 19811 которые показали, что S2 участок трипсина предпоч* тает гидрофобные неароматические аминокислотные остатки. Дипепта Z-Phe-Arg-pNA наименее эффективно гидролизуется трипсином из-: недостаточной длины и несоответствия ароматического остатка фе нилаланина характеру S2 подцентра фермента и Z-группы - специф^ ности Sg сайта.
Двенадцать пептидов были проверены на расщепляемость фермент? ми системы гемостаза: тромбином, урокиназой и плазмином в Инсп
туте гематологии РАМН в .--бсратории профессора В.А.Макарова при рН 8,3. Полученные данные открываютувозможность подбора оптимальных хрсмогенных субстратов для тромбина, плазмина и урекиназы, основанного на различиях з специфичности этих Ферментов гемостаза в откоаении остатков и Так, mpQ.tC-.vH. предпочитает субстраты с С-концевым остатком арггнзяа и аминокислотой с небольшой боковой цепью в положении Р-. Плазлин из числа испытанных предпочтительно гидролизует субстраты с С-концевым п-нитроакилидом аргинина, в которых положение занято крупным гидрофобным остатком. Неожиданным оказался легкий гидролиз уронтазой субстрата, содер-. жащего остаток триптофана. :
Таблица 5. Кинетические параметры гидролиза хромогеЕных субстратов'трипсином при рл 8,15 и 20°С.
7М % :"-кэт/кМ
Субстрат ьеталь/мин М М-1 с-*
1. 2-А1а-А1а-Аг£-рЯА « ( .6*10" -1 1.7*10" -5 1, .2*10б
2. 2-А1а-Р1ге-А^-рКА т .9*10" -2 9.2*10" -5 5, .4*105
3. Z-Aia-AIa-Ala-Arg-pNA 1 .5*10" -1 3.3*10' -5 3, .8*106
4. г-А1а-А1а-РПе-Аг£-рКА 6 .5*10" -2 1.8*10" -4 2. .5*105
5. г-А1а-А1а-Мег-Агв-рЫА 1 .4*10" -1 1.1*10" ■4 7, .5*1О5
6. г-А1а-А1а-Тгр-А^-рМ л "у .3*10" -2 1.6*10" -5 1, .3*105
7. г-РЬе-Агё-рМ 2 .5*10" -2 _ 4.0*10" -4 4. .4*104
Существенно, что предажнкнЯ нами способ синтеза хроуогенных субстратов указанного типа удобен для масштабирования.
Ферментативный синтез фрапента лаыинина - пентапептида Ас-Туг-11е-С1у-5ег-Аг£-Ш, его л-нитроанилида и амида.
Развитый нами подход к" ферментативному синтезу аргинин-
сскрхигг.к пептидов в органических, раствори гелях с использованием в ка-естье катализатора гтротеиназы, сортированной на макропористом носителе, мы применили для .получения защищенного пентапептида Ac-Tyr-IIe-GIy-Ser-irg-OH, его n-нитроанилида и амида.
7Г-;-.тапептид Tyr-Ile-Gly-Ser-Arg является фрагментом аминокислотной последовательности 51 цепи ламинина - гликопротеина соединительной ткани, основного компонента базальных мембран. Обычные и опухолевые клетки имеют рецепторы, проявляющие высокое сродство к ламин1?ну. Их связывание с ламинкном - ниобходш/лй момент в метастаг-проБании опухолей и секреции злокачественными клеткам! Ферментов деградации межклеточного матрика ilwamoto et al, 1937].
Было обнаружено, что нонапептид Cys-Asp-Pro-Gly-Tyr-Ile-Gly-Зег-Arg - фрагмент аминокислотной последовательности BI цепи лауинтг-а - конкурирует с ламияином за связывание с клеточными рецепторами и подавляет взаимодеиствие клеток с ламинином, тем cavb'v препятствуя их закреплению б соединительной ткани [Теггапо-va et al, 19361 Амид нонапептида значительно более действен как конкурентный ингибитор ламинина, а пентапептид Tyr-Ile-Gly-Ser-Arg сохраняет около 50 % активности амида нонапептида. Амида обс;пс пептидов приблизительно одинаково эффективны [Grai et al,
4 Г>Ог* ч (j•
Хз^пчеткий синтез пентапептида Tyr-Ile-Gly-Ser-Arg и его аналогов ослогнен необходимостью защиты боковых функциональных групп Туг, Ser, Arg. Обычно эти пептида получают, используя пептидный синтезатор [Graf et al, 1937]. Имея в виду перспективу масштабирс ванил синтеза этого соединения и его производных, мы поставили перед собой задачу получить эти пептиды, используя, в основном, ферментативные метода образования пептидной связи.
Схема синтеза выглядит следующим образом:
H-c-l^-Gi'.-Nd
+H- Л гг-N Н,. с\ ó i и-ппя н
Rcc-F^-G^-Ser-Are-NH.
сксоон
100%
H-IIi-C-iy-Ser-Ars-NH,
+Ac-T>t-OC,H}. 95".
а-химотрилеин
Ас-Ту r-lio-Giy-Ser-Ars-NH,
+H-Ar?-pNA. с\01и.ипин
Hoc-I'í-GW-Se.-- \r?-pN.\
¡0£T.
CF-COOH
+Ac-Tyr-OC,H5, я-тнмогряпсия
Ас-1 >i-tí-G;> -Sar-.Uf-pXA
трипсин
.^-T^-ík-C.iy-Ser-.Vri-OII
V
Первоначально конденсацией производных аминокислот с помощью карбодиимида был получен дипептлд Бос-Ile-Gly-OCH- с выходом 66%.
* О
Далее ферментативным гидролизом папаззом, сорбированным на сило-хроме, получили Eoc-Ile-Gly-CH с выходе« SQ%:
папаин "
Бос-IIe-Gly-OCKg + HgO --» Бос-Ile-Gly-OH
Гидролиз проводили в ацетонитриле, ссдерзадем воды при рН 7,6 и температуре 20° С.
Ацилирование H-Ser-0CH3 пент&^тор'енялозым эфиром Boc-Ile-Gly-0-С6Р5 с количественным выходом дало Boc-Ile-Gly-Ser-OCHg -
дцгк
Boc-Ile-Gly-OH + C6F50H-» Boc-Iie-Gly-O-CgFg + H-3er-0CH3 —>
-<• Boc-IIe-Gly-Ser-OCH3 + CgFgOH
Был возможен и другой путь синтеза эфира Вос-трипептида -
реакция, катализируемая папаиноы, сорбированным на силохроме, в
ацетстатршю ■ _
■ папааа
Вос-11е-С1у-0СН3 + Н-Зег-ОСЕз -» Вос-11е-С1у-Зег-0СН3
•Однако, максимальный выход этого синтеза составил 502.
Вос-11е-С1у-Зег-0СН3 конденсировала далее с Н-Аг£-р»А в 28Х-ом даф в ацетонитриле, используя 1,5-кратный избыток эфира трипепти-
да. Реакция катализировалась сорбированным субтилизинс
'Л" су бтилизин Бос-Пе-иХу-Нег-ССН^ + Н-Аг£-рЛ*А -■-» Бос-11е-01у-5ег-Аг2-р!\
Через 2 ч выход продукта достиг 93%. Выход выделения - 92%.
Значительно труднее было обеспечить высокий выход при синтез Бос-11е-С1у-Зег-Аг£-!чН2.
субтилизин
Вос-11е-01у-5ег-0СН3 + Н-Аг£-КК? -► Вос-11е-01у-Зег-Аг£-иЕ
Реакцию проводили в 25% ДГ^СО в ацетонитриле, при 1,8-кратнс избытке амида аргинина. 37% еыход продукта достигался лишь чере 1С дней, причем через 5 дней требовалось ввести в реакционну смесь свежу® порцию сорбированного фермента. По нашему мненик столь дргл'яттгческое замедление реакции -интеза объясняется боль з",".; различием в связывании субтилизином амида и п-нитроакилил аггинина. А;«кд асгикина может взаимодействовать только с одю п-~."центром фер?/екта - . В отличие от этого, п-нитроакилкд арги ник а закинет, пс-ьидгчому, три подцентра - Зр , Компенси решать замэчлечие реакции увеличением содержания фермента ил избытка амида аргинина в смеси было нельзя, поскольку это могл привести к включению в продукт второго остатка аргинина [Юсупова Новгородова, 13Э5 3.
После удаления Вос-защиты трифторуксусной кислотой с количественном выходом были получены Н-11е-С1у-Зег-Аг£-рКА и Н-11е
01у-Зег-Аг£-НН2-
Конденсацией п-нитроанилида тетрапептида и Ас-Туг-ОС2Нд бы получен гс-нитроанилид пентапептида
а-химотрипсин
Ас-Туг-0С2Н5 + Н-11е-С1у-5ег-Аг£-рНА -►
Ас-Туг-11е-С1у-3ег-Аг§-рКА
В качестве катализатора был выбран а-химотрипсин, - как фермент менее чувствительный, по сравнению с субтилизином, к длине цеп ацилирукщего компонента. Синтез проводили в 18£ ДМСО в ацетони трале в присутствие 3,6« вода, при четырехкратном избытке Ас-Туг 0С2Н5. Через пять дней выход-продукта составил 98%. Выход пр
вклеленпп 85%.
Заключительной стали«« синтеза ац*гатентапепткяа со свободной -СССН-группой являлось отцепление -ч-нитроакилина трипсином -
ттапеин
Ac-Tyr-IIe-GIy-Ser-Arg-p-N-4 - Ну,0 —-» Ac-I^-I±e-Gly-Ser-Arg-OK
-fSi
Количественное отщепление n-нитроанилидной группы происходило при рК 7,4-7,6 в течение 15 мин. г^л предотвращения дальнейшего гидролиза пептидной цепи трипсин ингнбировэли соевым ингибитором трипсина. После удаления ~г-нитроанилннэ экстракцией этилацетатом и отделения комплекса трипсин - ингибитор ультрафильтр^цией, раствор был лиофильно Еысушен, что дало целевой продукт - Ас-Гуг-11е-Г,Iу-5ьг-Аrg-GH с небольшим содержанием солей и выходом
Амид пентапептида А с -Туг-71 е-"- ] у-- ~ г-Аг£-?."Н2 также синтегиро-вали по реакции, катализируемой сорбированным а-химотрипсиком, -
о-2ИМ0ТРИПСИН
Ас-Тут-ОС?п5 + H-Ile-Gly-Ser-Arg-iH- -:-»
Äc-Tyr-IIe-GIy-Ser-Arg-Tin?
в 13% ДМСО з ацетонитриле в присутствие 3,5%-эоды, при 4-х кратном избытке Ас-Туг-ОС^Нг;. Через сутки выход амида пентапептида составил 37%.
ВЫВОДЫ
1. Изучен .ферментативный подход к синтезу пептидов, содержащих в качестве С-ксниевых остатки аргинина и лизина. Показано, что сериковые протеиназы - субтилизин и а-химотрипсин - с высоким выходом могут катализировать ецилирование »-аминогруппы тг-нлтроанилидов этих аминокислот. Наиболее удобным является использование органических растворителей с очень малым содержанием волы в качестве реакционной среды синтеза, катализируемого протеиназами, сорбированными на макропористых кремнеземах. При этом подавление гидролитических процессов обеспечивает высокие выходы и упрощает схему выделения целевых продуктов.
2. С использованием разработанного метода синтезировано 24
генными суСстгыгьи. р-^личных серкноныл 7тпг>7£-уг~?<з - гг-ичин*, плазмина, -тромбина и урокиназы.
3. Разработан способ синтеза пэнтапептидного фрагмента ламикике Tyr-Ile-Giy-Ser-Arg и его производных - перспективных ингибиторе? процесса клеточкой адгезии. Предложенный подход предусматривает исполь -ование знзиматического синтеза на основных стадиях.
Результаты работы отражены в следующих публикациях:
1. Т.Л.Вошина, Е.Ю.Терентьева, Л.А.Люблинская, Б.В.иозднев, А.В.Гайда, М.Ю.Гололобов, В.М.Степанов Ферментативный синтез .«ПТЛПоПТИдоб, содержащих n-нитроанилиды основных аминокислот. // Биоорган. химия.- 1991.— Т. 17.- С. 1056-1073.
2. T.L.Voyushina, E.Yu.Terent'eva, v.tf.Stepanov The Synthesis oi chrorr,o££r,io peptide substrates containing p-nitroanilides ol argir.ine -and lysine. // Biomed. Biochim. Acta.- 1991.- 7. 50.- P.
r-y J
CU7-ClС.
3. V.".otepanov* T.L.Voyushina, E.Yu.Terent'eva, tf.Yu.Goiolobov, Subtillsine or ^-Chyrr.otrypsin Catalysed Synthesis оГ Peptides: Contaning Argir.ine or Lysine p-IJi':>oanilides as C-Terminal Moieties. // Bioorganic & Medicinal Chemistry.- 1995.- V. 3.- P.-479—¿Я5
4. E.Yu.Terent'eva, T.L.Voyushina, V.M.Stepanov Enzymatic Synthesis of YIGSR - Larainln Pentapeptide Fragment - Derivatives. // Biomed, Chem Lett.- 1995