Модифицированные олигонуклеотиды, содержащие химически активные группы в 2'-положении углеводного фрагмента, и получение конъюгатов на их основе тема автореферата и диссертации по химии, 02.00.10 ВАК РФ

1. УСЛОВНЫЕ СОКРАЩЕНИЯ

2. ВВЕДЕНИЕ

3. НУКЛЕОЗИДЫ И ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ С ХИМИЧЕСКИ АКТИВНЫМИ 9 ГРУППАМИ ПРИ С2-АТОМЕ: СИНТЕЗ И ПРИМЕНЕНИЕ

Литературный обзор)

3.1. Введение

3.2. Синтез модифицированных нуклеозидов, содержащих 11 реакционноспособные группы в 2'-положении углеводного фрагмента

3.2.1. Синтез нуклеозидов, содержащих нуклеофильные группы в

2'-положении углеводного фрагмента

3.2.1.1. Синтез 2'-амино-2'-дезоксинуклеозидов

3.2.1.2. Синтез 2'-0-аминоалкилнуклеозидов

3.2.1.3. Синтез нуклеозидов, содержащих аминооксигруппу

3.2.1.4. Синтез нуклеозидов, содержащих тиольную группу

3.2.2. Синтез нуклеозидов, содержащих электрофильные группы в 31 2'-положении углеводного фрагмента

3.2.2.1. Синтез 2'-оксонуклеозидов

3.2.2.2. Синтез нуклеозидов, содержащих альдегидную группу или 33 диальдегидную группировку

3.2.2.3. Синтез нуклеозидов, содержащих карбоксильную группу

3.2.2.4. Синтез нуклеозидов, содержащих другие электрофильные группы

3.3. Синтез 2'-конъюгатов нуклеозидов и олигонуклеотидов

3.3.1. Синтез конъюгатов нуклеозидов с различными соединениями

3.3.2. Синтез 2'-конъюгатов олигонуклеотидов твердофазным методом

3.3.3. Синтез 2'-конъюгатов олигонуклеотидов в растворе

3.4. Применение нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов, содержащих 72 реакционноспособные группы в 2'-положении углеводного фрагмента, и конъюгатов на их основе

3.4.1. Применение нуклеозидов и нуклеотидов

3.4.2. Применение 2'-модифицированных олигонуклеотидов

3.4.2.1. Антисмысловая и антигенная биотехнология

3.4.2.2. Изучение ДНК-белковых взаимодействий

3.4.2.3. Изучение структуры нуклеиновых кислот

3.4.2.4. Рибозимы 87 3.5. Заключение

4. МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ, СОДЕРЖАЩИЕ 91 ХИМИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ ГРУППЫ В 2'-ПОЛОЖЕНИИ УГЛЕВОДНОГО ФРАГМЕНТА, И ПОЛУЧЕНИЕ КОНЪЮГАТОВ НА ИХ ОСНОВЕ (Обсуждение результатов)

4.1. Синтез модифицированных олигонуклеотидов, содержащих альдегидную 92 группу при 02'-атоме, и получение конъюгатов на их основе в растворе

4.2. Синтез модифицированных олигонуклеотидов, содержащих альдегидную 109 группу при (32'-атоме, и получение конъюгатов на их основе твердофазным методом

4.3. Синтез и свойства олигонуклеотидов, содержащих другие химически 117 активные группы в 2'-положении углеводного фрагмента

4.3.1. Синтез олигонуклеотидов, содержащих остаток 117 2' -0-(2-гидразиноэтил)ури дина

4.3.2. Синтез олигонуклеотидов, содержащих (3-дикетогруппировку в 122 2'-положении углеводного фрагмента

4.3.3. Синтез олигонуклеотидов, содержащих остаток 2'-0- 126 (карбоксиметил)уридина

4.3.4. Синтез олигонуклеотидов, содержащих остаток 128 2'-0-(2,3-диаминопропил)уридина

4.3.5. Синтез олигонуклеотидов, содержащих остаток 2'-О- 133 {2,3-ди-[МА^-бис(этоксикарбонилметил)амино]пропил}уридина

4.4. Синтез ^/-модифицированных пептидов и получение олигонуклеотидо- 135 пептидных конъюгатов

5. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

6. ВЫВОДЫ

Синтетические, в том числе модифицированные, олигонуклеотиды широко используются в различных областях биологии и медицины. Характер модификации зависит от задачи исследования, но во всех случаях необходимо сохранение способности производных нуклеиновых кислот (НК) к комплементационным взаимодействиям. Для направленного введения в НК реакционноспособных и репортерных групп, интеркаляторов, биологически активных пептидов и ферментов необходима разработка методов, позволяющих осуществить этот процесс региоселективно и с высокими выходами. В связи с этим актуальной задачей становится получение одно- или двутяжевых молекул ДНК, имеющих в своем составе группировки, реакционная способность которых отличается от реакционной способности функциональных групп природных ДНК. Одним из возможных подходов к синтезу таких олигомеров является замена мономерных звеньев или их фрагментов различными аналогами, содержащими реакционноспособные группировки.

Целью настоящего исследования является разработка эффективных методов синтеза олигонуклеотидов, содержащих химически активные группы при СТ-атоме, и изучение химических свойств полученных соединений. Важной частью настоящей работы является также получение конъюгатов с различными аминосоединениями, в том числе пептидами, на основе модифицированных олигонуклеотидов данного типа.

В настоящее время получение конъюгатов олигонуклеотидов с различными молекулами представляется достаточно перспективным подходом к направленному изменению физико-химических и субстратных свойств фрагментов нуклеиновых кислот, что в свою очередь является необходимым условием для использования последних в молекулярно-биологических и медицинских исследованиях. Оптимальным можно считать такой вариант синтеза олигонуклеотидных конъюгатов, при котором реакционноспособная группировка в составе олигонуклеотида избирательно реагирует с реакционноспособной группировкой лиганда, в то время как другие функциональные группы обеих молекул остаются незатронутыми. Анализ литературных данных, показывает, что этим требованиям в общем виде удовлетворяют реакции аминосоединений как с карбоксильной, так и с альдегидной группами.

Известно, что для образования амидной связи необходимо осуществлять активацию карбоксильной группы. Выбор реагента для активации зависит в том числе и от того, в какой среде проводится конъюгация. В водных растворах чаще всего используют водорастворимый карбодиимид, а в органической фазе предпочитают конденсирующие реагенты на основе фосфониевых или урониевых солей. Тот и другой вариант имеют свои недостатки. В первом случае гетероциклические фрагменты нуклеиновых кислот могут реагировать с карбодиимидом. С другой стороны, при проведении конъюгации в органических растворителях возникают проблемы с растворимостью реагирующих молекул. В этой связи достаточно часто молекулу-лиганд присоединяют к олигонуклеотиду, иммобилизованному на нерастворимом полимерном носителе. Дальнейшая обработка конъюгата аммиаком или щелочью, необходимая для расщепления связи олигонуклеотид-полимерный носитель и деблокирования функциональных групп, может привести к деструкции ненуклеотидной части гибридной молекулы, что в свою очередь ограничивает выбор исследователей в процессе конструирования олигонуклеотидных конъюгатов. С учетом все этих трудностей и недостатков использование олигонуклеотидов, содержащих альдегидную функцию, кажется предпочтительным. В данном случае нет необходимости в дополнительной активации электрофильной группировки, реакцию можно проводить в водно-органическом растворе, что помогает решить проблему растворимости реагирующих молекул в процессе конъюгации. Неоспоримым достоинством является тот факт, что существует возможность применять не только амины, но и гидразины, гидразиды, гидроксиламины, а также соединения, содержащие в своем составе 1,2-аминотиол. Интенсивный рост числа публикаций по этой тематике подтверждает сделанные выводы.

Основными этапами работы были получение З'-амидофосфитных производных модифицированных нуклеозидов, содержащих защищенные реакционноспособные группы при С2'-атоме, встраивание модифицированных звеньев в олигонуклеотидную цепь и получение конъюгатов олигонуклеотидов с аминами, гидразинами, гидразидами, карбазатами и 1,2-аминотиолами.

6. выводы

Предложены и разработаны методы синтеза модифицированных олигонуклеотидов, содержащих альдегидную, карбоксильную, гидразино-, Р-дикето-, и а-диаминофункции в 2'-положении углеводного фрагмента. Олигонуклеотиды с включениями 2'-<9-(2-оксоэтил)цитидина, 2'-0-(2,3-диаминопропил)уридина, 2'-<3-(2-гидразиноэтил)уридина, 2 '-О

2,3-ди[бис(карбоксиметил)амино]пропил}уридина получены впервые. Разработаны эффективные схемы синтеза конъюгатов 2'-альдегидсодержащих олигонуклеотидов с маркерными и репортерными соединениями, имеющими в своем составе гидразино-, гидразидную, карбазатную или аминооксигруппу, в растворе и на полимерном носителе.

На основе олигодезоксирибонуклеотидов и 2'-0-метилолигонуклеотидов с включениями 2'-0-(2-оксоэтил)уридина впервые синтезированы конъюгаты с N-модифицированными пептидами. Продемонстрировано, что полученные олигонуклеотидо-пептидные конъюгаты являются эффективными ингибиторами Tat-зависимой транскрипции на ДНК-матрице ВИЧ-1 in vitro.

Показано, что олигонуклеотиды, содержащие альдегидную группу в 2'-положении углеводного фрагмента, являются эффективными реагентами для селективной аффинной модификации ДНК-связывающих белков.

3.5. Заключение

В данном обзоре нами были рассмотрены методы синтеза 2'-модифицированных нуклеозидов и олигонуклеотидов, получение конъюгатов на их основе и применение полученных конструкций.

К настоящему моменту опубликовано большое количество работ, посвященных синтезу и применению олигонуклеотидов, содержащих химически активную группу или конъюгированную молекулу в 2'-положении углеводного фрагмента. Наиболее распространенными являются 2'-амино-2'-дезоксинуклеозиды, так как они могут быть включены в состав НК и химически, и энзиматически, и в последствии селективно проацилированы. Эти исключительные свойства, а также относительная простота синтеза, обусловили коммерческую доступность стандартных компонентов автоматического олигонуклеотидного синтеза и 5'-трифосфатов пиримидиновых 2'-амино-2'-дезокси-2'-дезоксинуклеозидов (TriLink BioTech, США).

Анализ существующих работ, связанных с синтезом и применением 2'-модифицированных олигонуклеотидов, показывает значительные успехи, достигнутые в большинстве областей, где в настоящее время используются модифицированные олигонуклеотиды.

4. МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ, СОДЕРЖАЩИЕ ХИМИЧЕСКИ АКТИВНЫЕ ГРУППЫ В 2'-ПОЛОЖЕНИИ УГЛЕВОДНОГО ФРАГМЕНТА, И ПОЛУЧЕНИЕ КОНЪЮГАТОВ НА ИХ ОСНОВЕ

Обсуждение результатов)

В литературном обзоре были рассмотрены основные направления применения 2'-модифицированных олигонуклеотидов и их производных. Для получения конъюгатов олигонуклеотидов с различными соединениями, как правило, требуется предварительное введение химически активных групп в состав олигомера. К химически активным группам мы относим группы или группировки, которые являются реакционноспособными в водной или водно-органической среде в условиях, когда гидроксильные группы углеводного фрагмента и экзоциклические аминогруппы гетероциклического основания не вступают в реакции. Модификация 2'-положения углеводного фрагмента представляется одним из наиболее удачных вариантов, так как при этом, как правило, вносятся минимальные искажения в структуру НК и не нарушаются комплементационные взаимодействия.

В рамках настоящего исследования предложены и разработаны методы синтеза модифицированных олигонуклеотидов, содержащих альдегидную, карбоксильную, гидразино-, Р-дикето-, а-диаминофункции и фрагмент этилендиаминтетраацетата в 2'-положении углеводного фрагмента 2.1-2.7. Получен ряд конъюгатов этих олигонуклеотидов с маркерами, гидрофобными соединениями и пептидами.

NHNR

2.1

2.2

2.3

2.4 О

2.5

2.6

2.7

В = Ura, Cyt

R1, R2 - фрагменты олигонуклеотидной цепи

Для успешного осуществления синтеза конъюгатов модифицированных олигонуклеотидов с рядом соединений было необходимо решить следующие задачи:

1. Синтез модифицированных нуклеозидов и получение их 3'-амидофосфитных производных, которые могут быть встроены в олигомерную цепь с минимальными изменениями стандартного регламента автоматического олигонуклеотидного синтеза.

2. Осуществление олигонуклеотидного синтеза, деблокирования модифицированных олигонуклеотидов и их выделения.

3. Получение конъюгатов модифицированных олигонуклеотидов с различными соединениями и подбор методов для их выделения.

В данной главе будет рассматриваться получение олигонуклеотидов, содержащих химически активные группировки, и их реакции с различными соединениями.

4.1. Синтез модифицированных олигонуклеотидов, содержащих альдегидную группу при 02'-атоме, и получение конъюгатов на их основе в растворе

Для синтеза альдегидсодержащих олигонуклеотидов первоначально, как правило, получают соединение-предшественник с ем^-диольной группой и далее ее окисляют периодатом натрия (см. литературный обзор).

Нами предложен метод синтеза олигонуклеотидов, содержащих альдегидную группу в 2'-положении углеводного фрагмента (схема 2.1). Для этого было проведено аллилирование производного уридина 2.10 и последующее окисление аллильной группы каталитическими количествами тетраоксида осмия в присутствии jV-оксида JV-метилморфолина. Для блокирования лактамной группировки гетероциклического основания нами была использована нитрофенильная защитная группа, что в дальнейшем позволило получить как 2'-производное уридина, так и 2'-производное цитидина. но—1 Ura

ОН ОН 2.8

Ру о

Pr^sK n о ч о он

2.10 О hn O^N

1. TMS-CI, Et3N, CH2CI2 ) Ura 2. a. Mes-CI, Et3N, DMAP, CH2CI2 b. 2-N02CsH40H, DBU

P^Si"0 OH 2.9

AII0C(0)0Me

Pr^Si"0 °\Д

2.12

OsO„ f>°

Me

ТГФ, H20

3. 4-MeCeH4COOH, диоксан, CH2CI2 a: n no2 n-oh

2.11

Me2Nx NMe2, CH3CN nh

Ura ca

BzCN,

OH

Et3n, CH2CI2

-.^O О

OH

2.13

Ura

О. V—T OBz

Pr2Si'

-O О тгф

OBz

ОН о

Ura

OBz

DMTrCI

РУ

OBz

2.14

2.15

Ura

DMTrO—| I w

OBz он о 2.16

L = (C6H5CH=CH)2CO

OBz

Рг^Р(С1)0(СН2)2СМ

PrUNEt, CH2CI2

Ura

OBz

О О j /РХ

Pr'2N 0(CH2)2CN

2.17

OBz

5\3'-Гидроксильные группы соединения 2.8 были блокированы защитой Маркевича. На второй стадии проводили реакцию с 2-нитрофенолом, что позволяло необходимое для того, чтобы предотвратить последующее алкилирование по А^-атому, аналогично описанному в работе [434]. (92'-Атом соединения 2.10 алкилировали аллилметилкарбонатом в присутствии палладиевого катализатора. Следующей стадией синтеза было получение ew^-диольной группировки окислением аллильной группы в 2'-положении углеводного фрагмента нуклеозида 2.12 каталитическими количествами тетраоксида осмия в присутствии N-оксида А^-метилморфолина [435]. Использование соокислителя позволяет избежать модификации гетероциклического основания, которая протекает при использовании эквимолярных количеств тетраоксида осмия [436,437].

Общий выход соединения 2.17 после девятистадийного синтеза составил 23%. Здесь и далее строение ряда промежуточных и целевых соединений было подтверждено данными 'Н-, 13С и 31Р-ЯМР-спектроскопии.

Синтез модифицированных олигодезоксирибонуклеотидов и 2 '-0-метилолигонуклеотидов осуществляли по амидофосфитной схеме на синтезаторе Applied Biosystems 380В с использованием коммерческих реагентов в соответствии со стандартным регламентом. Амидофосфит модифицированного нуклеозида использовали в виде раствора в абсолютном ацетонитриле с концентрацией 0,12 М. На стадии присоединения модифицированного мономерного компонента к олигомерной цепи время реакции увеличивали до 30 минут. Степень превращения в данном случае была несколько меньше, чем для З'-амидофосфитов природных 2'-дезоксирибонуклеозидов, и составляла 90-95%.

Модифицированные олигонуклеотиды, содержащие 2'-0-(2,3-дибензоилоксипропил)уридин, отщепляли от полимерного носителя и деблокировали защитные группы аналогично процедуре для стандартных олигодезоксирибонуклеотидов.

Были синтезированы следующие модифицированные олигонуклеотиды (таблица 1). Строение ряда олигомеров было подтверждено методом масс-спектрометрии с ионизацией методом лазерной матричной десорбции (MALDI-TOF).

1. Braasch, D.A., Corey, D R. (2002) Novel antisense and peptide nucleic acid strategies for controlling gene expression. Biochemistry, V. 41, N 14, P. 4503-4510.

2. Praseuth, D , Guieysse, A.L., Helene, C. (1999) Triple helix formation and the antigene strategy for sequence-specific control of gene expression. Biochim. Biophys. Acta, V. 1489, N 1, P. 181-206.

3. Doherty, E.A., Doudna, J.A. (2000) Ribozyme structures and mechanisms. Annu. Rev. Biochem., V. 69, P. 597-615.

4. Gold, L., Polisky, В., Uhlenbeck, O., Yarns, M. (1995) Diversity of oligonucleotide functions. Annu. Rev. Biochem., V. 64, P. 763-797.

5. Zamore, P.D. (2001) RNA interference: listening to the sound of silence. Nat. Struct. Biol., V. 8, N 9, P. 746-750.

6. Hannon G.J. (2002) RNA interference. Nature, V. 418, N 6894, P. 244-251.

7. Коршун, В.А., Манасова, E.B., Берлин, Ю.А. (1997) Алкинилированные нуклеозиды и их аналоги. I. Методы синтеза. Биоорг. химия, Т. 23, N 5, С. 324-387.

8. Насонов, А.Ф., Коршунова, Г.А. (1999) С-Алкенилирование пиримидиновых нуклеозидов и их аналогов. Успехи химии, Т. 68, N 5, С. 532-554.

9. Tierney, M.T., Grinstaff, M.W. (2000) Synthesis and stability of oligodeoxynucleotides containing C8-labeled 2'-deoxyadenosine: novel redox nucleobase probes for DNA-mediated charge-transfer studies. Org. Lett., V. 2, N 22, P. 3413-3416.

10. Manoharan, M. (1999) 2'-Carbohydrate modifications in antisense oligonucleotide therapy: importance of conformation, configuration and conjugation. Biochim. Biophys. Acta, V. 1489, N 1, P. 117-130.

11. Pathak, T. (2002) Azidonucleosides: synthesis, reactions, and biological properties. Chem. Rev., V. 102,N5,P. 1623-1668.

12. J.G.Moffat. In Nucleoside Analogues. Chemistry, Biology and Medical Applications. Vol. A26. (Eds R.T.Walker, E.De Clercq, F.Eckstein). Plenum, New York; London, 1979. P.92

13. T.Ueda. In Chemistry of Nucleosides and Nucleotides. Vol. 1. (Ed. L.B.Townsend). Plenum, New York; London, 1988. P. 50

14. Verheyden, J.P.H., Wagner, D., Moffat, J.G. (1971) Synthesis of some pyrimidine 2'-amino-2'-deoxynucleosides. J. Org. Chem., V. 36, N 2, P. 250-254.

15. Sasaki, Т., Minamoto, K., Siguira, T. (1975) Convenient synthesis of 2,3'-imino-l-(3-D-lyxofuranosyl)uracil and its derivatives using azide ion. J. Org. Chem., V. 40, N 24, P. 3498-3502.

16. Sasaki, Т., Minamoto, K., Siguira, Т., Niwa, M. (1976) Introduction of an azide group into some uridine derivatives via 2',3'-benzoxonium and 2'-3'-azidonium intermediates. J. Org. Chem., V. 41, N 19, P. 3138-3143.

17. Kirschenheuter, G.P., Zhai, Y., Pieken, W.A. (1994) An improved synthesis of 2'-azido-2'-deoxyuridine. Tetrahedron Lett., V. 35, N 46, P. 8517-8520.

18. McGee, D.P.C., Vargeese, C., Zhai, Y., Kirschenheuter, G.P., Settle, A., Siedem, C.R., Pieken, W.A. (1995) Efficient synthesis of 2'-amino-2'-deoxypyrimidine 5'-triphosphates. Nucleosides, Nucleotides, V. 14, N 6, P. 1329-1340.

19. Logue, M.W., Han, B.H. (1980) Conversion of pyrimidine nucleoside 2',3'-orthoacetates into pyrimidine 2'-azido-2'-deoxynucleosides. J. Org. Chem., V. 45, N 24, P. 5000-5002.

20. McGee, D.P.C., Vaughn-Settle, A., Vargeese, C., Zhai, Y (1996) 2'-Amino-2'-deoxyuridine via an intramolecular cyclization of a trichloroacetimidate. J. Org. Chem., V. 61, N 2, P. 781-785.

21. McGee, D.P.C., Sebesta, D.P., O'Rourke, S.S., Martinez, R.L., Jung, M.E., Pieken, W.A. (1996) Novel nucleosides via intramolecular functionalization of 2,2'-anhydrouridine derivatives. Tetrahedron Lett., V. 37, N 12, P. 1995-1998.

22. McGee, D.P.C., Vaughn-Settle, A. (1997) Novel intramolecular introduction of nucleophiles to 2,2'-anhydrouridine. Nucleosides, Nucleotides, V. 16, N 7-9, P. 10951098.

23. Krider, E.S., Miller, J.E., Meade, T.J. (2002) 2'-Modified nucleosides for site-specific labeling of oligonucleotides. Bioconjugate Chem., V. 13, N 1, P. 155-162.

24. Mengel, R., Wiedner, H. (1976) Umwandlung von Adenosin in 2'- und З'-azido-, -amino-sowie chlor-substituierte Deoxyadenosine. Chem. Ber., V. 109, N 2, P. 433-443.

25. McEvoy, F.J., Baker, B.R., Weiss, M.J. (1960) Studies on the synthesis of 9-(2-amino-2-deoxy-P-D-ribofuranosyl)-6-dimethylaminopurine, an analog of the aminonucleoside derived from puromycin. J. Am. Chem. Soc., V. 82, N 1, P. 209-214.

26. Wolfrom, M.L., Winkley, M.W. (1967) Anomeric purine nucleosides of the furanose form of amino-2-deoxy-D-ribose. J. Org. Chem., V. 32, N 6, P. 1823-1825.

27. Hobbs, J.В., Eckstein, F. (1977) A general method for the synthesis of 2'-azido-2'-deoxy- and 2,-amino-2'-deoxyribofuranosyl purines. J. Org. Chem., V. 42, N 4, P. 714719.

28. Imazawa, M, Eckstein, F. (1979) Facile synthesis of 2'-amino-2'-deoxyribofuranosylpurines. J. Org. Chem., V. 44, N 12, P. 2039-2041.

29. Markiewicz, W.T. (1979) Tetraisopropyldisiloxane-l,3-diyl, a group for simultaneous protection of 3'- and 5'-hydroxy functions of nucleosides. J. Chem. Res. Synop., N 1, P. 24-25.

30. Ferrero, M., Gotor, V. (2000) Chemoenzymatic transformations in nucleoside chemistry. Monatsh. Chem., V. 131, N 6, P. 585-616.

31. Utagawa, T. (1999) Enzymatic preparation of nucleoside antibiotics. J. Mol. Catalysis B, V. 6, N 3, P. 215-222.

32. Matsuyama, K., Takahashi, Y., Yamashita, M., Hirano, A., Omura, S. (1979) 2'-Amino-2'-deoxyadenosine produced by a strain of Actinomadura. J. Antibiot., V. 32, N 12, P. 1367-1369.

33. Utagawa, Т., Morisawa, H., Nakamatsu, Т., Yamazaki, A., Yamanaka S. (1980) Enzymatic synthesis of purine 2'-amino-2'-deoxyriboside. FEBS Lett., V. 119, N 1, P. 101-104.

34. Morisawa, H., Utagawa, Т., Yamanaka, S., Yamazaki, A. (1981) A new method for the synthesis of 2'-amino-2'deoxyguanosine and -adenosine and their derivatives. Chem. Pharm. Bull., V. 29, N 11, P. 3191-3195.

35. Wagner, D., Verheyden, J.P.H., Moffat, J.G. (1974) Preparation and synthetic utility of some organotin derivatives of nucleosides. J. Org. Chem., V. 39, N 1, P. 24-30.

36. Sato, A., Imai, R., Nakamizo, N., Hirata, T. (1979) Synthesis of 2-amino-2-deoxy-p-D-arabinofuranosyl nucleosides. Chem. Pharm. Bull., V. 27, N 3, P. 821-823.

37. Manoharan, M, Prakash, T.P., Barber-Peoc'h, I., Bhat, В., Vasquez, G., Ross, B.S., Cook, P.D. (1999) N-(2-Cyanoethoxycarbonyloxy)succinimide: a new reagent for protection of amino groups in oligonucleotide. J. Org. Chem., V. 64, N 17, P. 6468-6472.

38. Manoharan, M. (2002) Oligonucleotide conjugates as potential antisense drugs with improved uptake, biodistribution, targeted delivery, and mechanism of action. Antisense Nucleic Acid Drug Dev., V. 12, N 2, P. 103-28.

39. Manoharan, M„ Tivel, K.M., Andrade, L.K., Cook, P.D. (1995) T-O- and У-О-pyrimidine aminotether-containing oligonucleotides: synthesis and conjugation chemistry. Tetrahedron Lett., V. 36, N 21, P. 3647-3650.

40. Ross, B.S., Springer, R.H., Tortorici, Z., Dimock, S. (1997) A novel and economical synthesis of 2'-0-alkyl-uridines. Nucleosides, Nucleotides, V. 16, N 7-9, P. 1641-1644.

41. Manoharan, M., Prakash, T.P., Barber-Peoc'h, I., Bhat, В., Vasquez, G., Ross, B.S., Cook, P.D. (1999) A new protecting group strategy for amino groups in oligonucleotide chemistry: CEOC group. Nucleosides, Nucleotides, V. 18, N 6-7, P. 1199 1202.

42. Prhavc, M, Prakash, T.P., Minasov, G., Egli, M., Manoharan, M. (2003) 2'-C-2-[2-(N,N-dimethylamino)ethoxy.ethyl] modified oligonucleotides: symbiosis of charge interaction factors and stereoelectronic effects. Org. Lett., V. 5, N 12, P. 2017-2020.

43. Martin, P. (1995) A new access to 2'-0-alkylated ribonucleosides and properties of 2'-0-alkylated oligoribonucleotides. Helv. Chim. Acta, V. 78, N 2, P. 486-504.

44. Cuenoud, В., Casset, F., Husken, D., Natt, F., Wolf, R.M., Altmann, K.-H., Martin, P., Moser, H.E. (1998) Dual recognition of double-stranded DNA by 2'-aminoethoxy-modified oligonucleotides. Angew. Chem. Int. Ed., V. 37, N 9, P. 1288-1291.

45. Klopfer, A.E., Engels, J.W. (2002) Universal fluorinated nucleobases: their effect on the catalitic activity of rybozymes. Collection Czechoslovak Chemical Communications, Symp. Ser., N 5, P. 348-351.

46. Sollogoub, M., Domingues, В., Fox, K.R., Brown, T. (2000) Synthesis of a novel bis-amino-modified thymidine monomer for use in DNA triplex stabilisation. J. Chem. Soc., Chem. Coramun., N 23, P. 2315-2316.

47. Dubey, I., Pratviel, G., Meunier, B. (2000) Synthesis and DNA cleavage of 2'-0-amino-linked metalloporphyrin-oligonucleotide conjugates. J. Chem. Soc., Perkin Trans. I, N 18, P. 3088-3095.

48. Prhavc, M., Lesnik, E.A., Mohan, V., Manoharan, M. (2001) 2'-Ocarbamate-containing oligonucleotides: synthesis and properties. Tetrahedron Lett., V. 42, N 50, P. 8777-8780.

49. Keller, Т.Н., Haner, R. (1993) A general method for the synthesis of 2'-0-modified ribonucleosides. Helv. Chim. Acta, V. 76, N 6, P. 884-892.

50. Sund, C., Puri, N., Chattopadhyaya, J. (1996) Synthesis of C-branched spermine tethered oligo-DNA and the thermal stability of the duplexes and triplexes. Tetrahedron, V. 52, N 37, P. 12275-12290.

51. Sund, C., Puri, N., Chattopadhyaya, J. (1997) The chemistry of C-branched spermine tethered oligo-DNAs and their properties in forming duplexes and triplexes. Nucleosides, Nucleotides, V. 16, N 5-6, P. 755-760.

52. Mitsunobu, O. (1981) The use of diethyl azodicarboxylate and triphenylphosphine in synthesis and transformation of natural products. Synthesis, N 1, P. 1-28.

53. Prakash, T.P., Kawasaki, A.M., Vasquez, G., Fraser, A.S., Casper, M.D., Cook, P.D., Manoharan, M. (1999) 2'-DMAOE RNA: emerging oligonucleotides with promising antisense properties. Nucleosides, Nucleotides, V. 18, N 6-7, P. 1381-1382.

54. Prakash, T.P., Manoharan, M., Kawasaki, A.M., Lesnik, E.A., Owens, S.R., Vasquez, G. (2000) 2'-0-2-[Af A^dialkyl)aminooxy.ethyl]-modified antisense oligonucleotides. Org. Lett., V. 2, N 25, P. 3995-3998.

55. Prakash, T.P., Kawasaki, A.M., Fraser, A.S., Vasquez, G., Manoharan, M. (2002) Synthesis of 2'-0-2-[(A/,Ar-dimethylamino)oxy.ethyl] modified nucleosides and oligonucleotides. J. Org. Chem., V. 67, N 2, P. 357-369.

56. Karpeisky, A., Gonzalez, C., Burgin, А.В., Beigelman, L. (1998) Highly efficient synthesis of 2'-<9-amino nucleosides and their incorporation in hammerhead ribozymes. Tetrahedron Lett., V. 39, N 10, P. 1131-1134.

57. Chambert, S., Decout, J.-L. (2002) Recent developments in the synthesis, chemical modifications and biological applications of sulfur modified nucleosides, nucleotides and oligonucleotides. ,Org. Prep. Proced. Int., V. 34, N 1, P. 27-86.

58. Brown, D.M., Parihar, D.B., Todd, A., Varadarajan, S. (1958) Deoxynucleosides and related compounds. Part VI. The synthesis of 2-thiouridine and З'-deoxyuridine. J. Chem. Soc., N 6, P. 3028-3035.

59. Furukawa, Y, Yoshioka, Y, Imai, K., Honjo, M. (1970) Studies on synthesis of pyrimidine deonucleosides. 1. Synthesis of 2',3'-dideoxyuridine and l-(3-ethylthio-3-deoxy-p-D-xylofuranosyl)uracil. Chem. Pharm. Bull., V. 18, N 3, P. 554-558.

60. Patel, A.D., Schrier, W.H., Nagyvary, J. (1980) Synthesis and properties of 2'-deoxy-2'-thiocytidine. J. Org. Chem., V. 45, N 24, P. 4830-4834.

61. Ranganathan, R. (1977) Modification of the 2'-position of purine nucleosides: syntheses of 2'-a-substituted-2'-deoxyadenosine analogs. Tetrahedron Lett., V. 18, N 15, P. 12911294.

62. Imazawa, M. Ueda, Т., Ukita, T. (1975) Nucleosides and nucleotides. 12. Synthesis and properties of 2'-deoxy-2'-mercaptouridine and its derivatives. Chem. Pharm. Bull., V. 23, N 3, P. 604-610.

63. Divakar, K.J., Reese, C.B. (1982) Reaction between 2,2'-anhydro-l-p-D-arabinofuranosyluracil and thiolate ions. J. Chem. Soc., Perkin Trans. I, N 7, P. 16251628.

64. Hamm, M.L., Piccirilly, J. A. (1997) Incorporation of 2'-deoxy-2'-mercaptocytidine into oligonucleotides via phosphoramidite chemistry. J. Org. Chem., V. 62, N 10, P. 34153420.

65. Ozaki, H., Momiyama, S., Yokotsuka, K., Sawai, H. (1999) Synthesis of oligodeoxyribonucleotides bearing a functional group at 2'-position by post-synthetic modification. Nucleic Acids Symp. Series, N 42, P. 47-48.

66. Ozaki, H., Momiyama, S., Yokotsuka, K., Sawai, H. (2001) Post-synthetic functionalization of oligodeoxyribonucleotides at the 2'-position. Tetrahedron Lett., V. 42, N 4, P. 677-680.

67. Divakar, K.J., Mottoh, A., Reese, C.B., Sanghvi, Y.S. (1990) Approaches to the synthesis of 2'-thio analogues of pyrimidine ribosides. J. Chem. Soc., Perkin Trans. I, N 4, P. 969974.

68. Chambert, S., Gautier-Luneau, I., Fontecave, M., Decout, J.-L. (2000) 2-(Trimethylsilyl)ethanethiol in nucleoside chemistry. A short route for preparing thionucleosides and their methyl disulfides. J. Org. Chem., V. 65, N 1, P. 249-253.

69. Ryan, K.J., Acton, E.M., Goodman, L. (1971) Synthesis of 2-thio-D-ribose and 2'-thioadenosine derivatives. J. Org. Chem., V. 36, N 18, P. 2646-2657.

70. Reese, C.B., Simons, C„ Pei-Zhuo, Z (1994) The synthesis of 2'-thiouridylyl-(3'^5')-uridine. J. Chem. Soc., Chem. Commun., N 15, P. 1809-1810.

71. Manoharan, M., Johnson, L.K., Tivel, K.L., Springer, R.H., Cook, P.D. (1993) Introduction of a lipophilic thioether tether in the minor groove of nucleic acids for antisense applications. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 3, N 12, P. 2765-2770.

72. Manoharan, M., Tivel, K.L., Ross, В., Cook, P.D. (1994) A 2'-0-thiol tether in the ribose moiety of nucleic acids for conjugation chemistry. Gene, V. 149, N 1, P. 147-156.103. Пат. 5,578,718 США (1996)

73. Douglas, M.E., Beijer, В., Sproat, B.S. (1994) An approach towards thiol mediated labelling in the minor groove of oligonucleotides. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 4, N 8, P. 995-1000.

74. Goodwin, J.T., Osborne, S.E., Scholle, E.J., Glick, G. (1996) Design, synthesis, and analysis of yeast tRNAphe analogs possessing intra- and interhelical disulfide cross-links. J. Am. Chem. Soc., V. 118, N 22, P. 5207-5215.

75. Maglott, E.J., Glick, G. (1998) Probing structural elements in RNA using engineered disulfide cross-links. Nucleic Acids Res., V. 26, N 5, P. 1301-1308.

76. Gundlach, C.W., Ryder, T.R., Glick, G.D. (1997) Synthesis of guanosine analogs bearing pendant alkylthiol tethers. Tetrahedron Lett., V. 38, N 23, P. 4039-4042.

77. Wu, X., Pitsch, S. (1999) Functionalization of the sugar moiety of oligoribonucleotides on solid support. Bioconjugate Chem., V. 10, N 6, P. 921-924.

78. Качалова, А. В., Зубин, E.M., Орецкая, Т. С. (2002) Методы синтеза олигонуклеотидов, содержащих реакционноспособные электрофильные группировки. Успехи химии, Т. 71, N 12, С. 1171-1192.

79. Brodbeck, U., Moffat, J.G. (1970) Carbodiimide—sulfoxide reactions. IX. Synthesis of 2'- and З'-keto derivatives of cytidine. J. Org. Chem., V. 35, N 10, P. 3552-3558.

80. Hansske, F., Robins, M.J. (1983) Nucleic acid related compounds. 43. A convenient procedure for the synthesis of 2' and З'-ketonucleosides. Tetrahedron Lett., V. 24, N 15, P. 1589-1592.

81. Hansske, F., Madej, D., Robins, M.J. (1984) 2' and З'-ketonucleosides and their arabino and xylo reduction products: convenient access via selective protection and oxidation of ribonucleosides. Tetrahedron, V. 40, N 1, P. 125-135.

82. Tronchet, A., Benhamza, R., Bernardinelli, G., Geoffroy, M. (1990) Novel types of cyclonucleosides. Tetrahedron Lett., V. 31, N 4, P. 531-534.

83. Matsuda, A., Itoh, H., Takenuki, K., Sasaki, Т., Ueda, T. (1988) Alkyl addition reaction of pyrimidine 2'-ketonucleosides: synthesis of 2'-branched-chain sugar pyrimidine nucleosides. Chem. Pharm. Bull., V. 36, N 3, P. 945-953.

84. Takenuki, K., Matsuda, A., Ueda, Т., Sasaki, Т., Fujii, A., Yamagami, K. (1988) Design, synthesis, and antineoplastic activity of 2'-deoxy-2'-methylidenecytidine. J. Med. Chem., V. 31, N 6, P. 1063-1064.

85. Matsuda, A., Takenuki, K., Sasaki, Т., Ueda, T. (1991) Nucleosides and nucleotides. 97. Synthesis of new broad spectrum antineoplastic nucleosides, 2'-deoxy-2'-methylidenecytidine (DMDC) and its derivatives. J. Med. Chem., V. 34, N 2, P. 234-239.

86. Omura, K., Sharma, A.K., Swern, D. (1976) Dimethyl sulfoxide-trifluoroacetic anhydride. New reagent for oxidation of alcohols to carbonyls. J. Org. Chem., V. 41, N 6, P. 957-962.

87. Omura, K., Swern, D. (1978) Oxidation of alcohols by "activated" dimethyl sulfoxide. A preparative, steric and mechanistic study. Tetrahedron, V. 34, N 11, P. 1651-1660.

88. Samano, V., Robins, M.J. (1990) Mild periodinane oxidation of protected nucleosides to give 2'- and З'-ketonucleosides. The first isolation of a purine 2'-deoxy-3'-ketonucleoside derivative. J. Org. Chem., V. 55, N 18, P. 5186-5188.

89. Dess, D.B., Martin, J.C. (1983) Readily accessible 12-1-5 oxidant for the conversion of primary and secondary alcohols to aldehydes and ketones. J. Org. Chem., V. 48, N 22, P. 4155-4156.

90. Kjell, D.P., Slattery, B.J. (1997) Convenient synthesis of rf,Ш',05'-triacetyl-2'-ketocytidine. Nucleosides, Nucleotides, V. 16, N 4, P. 469-474.

91. Dunkel, M., Reither, V. (1999) Synthesis of 2'-C-a-difluoromethylarauridine and its 3'-<9-phosphoramidite incorporation into a hammerhead ribozyme. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 9, N 5, P. 787-792.

92. Appell, R.B., Duguid, R.J. (2000) New synthesis of a protected ketonucleoside by a non-cryogenic oxidation with TFAA/DMSO. Organic Process Res., Dev., V. 4, N 3, P. 172174.

93. Buff, R., Hunziker, J. (2002) 2'-Ethynyl-DNA: synthesis and pairing properties. Helv. Chim. Acta, V. 85, N 1, P. 224-254.

94. Freier, S.M., Altmann, K.H. (1997) The ups and downs of nucleic acid duplex stability: structure-stability studies on chemically-modified DNA:RNA duplexes. Nucleic Acids Res., V. 25, N 22, P. 4429-4443.

95. Matsuda, A., Inada, M., Nara, H., Ohtsuka, E., Ono, A. (1993) Nucleosides and nucleotides. 126. Incorporation of a mutagenic nucleoside, 5-formyl-2'-deoxyuridine, into an oligodeoxyribonucleotide. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 3, N 12, P. 2751-2754.

96. Гриценко, O.M., Громова, E.C. (1999) Диальдегидсодержащие нуклеиновые кислоты и их компоненты: синтез, свойства, аффинная модификация белков. Успехи химии, Т. 68, N 3, С. 267-283.

97. J37. Ермолинский, Б.С., Михайлов, С.Н. (2000) Реакция периодатного окисления в химии нуклеиновых кислот. Диальдегидные производные нуклеозидов, нуклеотидов и олигонуклеотидов. Биоорг. химия, Т. 26, N 7, С. 483-504.

98. Ефимцева, Е.В., Михайлов, С.Н. (2002) Дисахаридные нуклеозиды и олигонуклеотиды на их основе: новые инструменты исследования ферментов метаболизма нуклеиновых кислот. Биохимия, Т. 67, N 10, С. 1374-1384.

99. Prakash, Т.Р., Kawasaki, A.M., Lesnik, E.A., Owens, S.R., Manoharan, M. (2003) T-<9-2-(amino)-2-oxoethyl. oligonucleotides. Org. Lett., V. 5, N 4, P. 403-406.

100. Eraser, A., Wheeler, P., Cook, P.D., Sanghvi, Y.S. (1993) Synthesis and conformational properties of 2'-deoxy-2'-methylthiopyrimidine and -purine nucleosides: potential antisense applications. J. Heterocyclic Chem., V. 30, N 8, P. 1277-1287.

101. Egli, M. (1996) Structural aspects of nucleic acid analogs and antisense oligonucleotides. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., V. 35, N 18, P. 1894-1909.

102. Zehl, A., Cech, D. (1997) Synthesis and application of isothiocyanato derivatives of nucleosides. Liebigs Ann., Reel., N 3, P. 595-600.

103. Dolinnaya, N.G., Shabarova, Z.A. (1995) Chemical reaction in double helical nucleic acids: modelling the action of DNA ligases. Sov. Sci. Rev. D, Physicochem. Biol., V. 13, N3, P. 1-49.

104. Leitzel, J.C., Lynn, D.G. (2001) Template-directed ligation: from DNA towards different versatile templates. Chem Rec., V. 1, N 1, P. 53-62.

105. Aurup, H., Williams, D.M., Eckstein, F. (1992) 2'-Fluoro- and 2'-amino-2'-deoxynucleoside 5'-triphosphates as substrates for T7 RNA polymerase. Biochemistry, V. 31, N40, P. 9636-9641.

106. Pieken, W. (1997) Efficient process technologies for the preparation of oligonucleotides. Ciba Found. Symp.,V. 209, P. 218-222.

107. Kujau, M.J., Siebert, A., Wolfl, S. (1997) Design of leader sequences that improve the efficiency of the enzymatic synthesis of 2'-amino-pyrimidine RNA for in vitro selection. J. Biochem. Biophys. Methods, V. 35, N 3, P. 141-151.

108. Yu, C.J., Wang, Д, Yowanto, H„ Kim, J.C., Donilon, L.H., Tao, C„ Strong, M„ Chong, Y. (2001) 2'-Ribose-ferrocene oligonucleotides for electronic detection of nucleic acids. J. Org. Chem., V. 66, N 9, P. 2937-2942.

109. Yu, C.J., Wan, X, Yowanto, H., Li, J., Tao, C., James, M.D., Tarn, C.L., Blackburn, G.F., Meade, T.J. (2001) Electronic detection of single-base mismatches in DNA with ferrocene-modified probes. J. Am. Chem. Soc., V. 123, N45, P. 11155-11161.

110. Bashkin, J.K., Xie, J., Daniher, A.T., Sampath, U.S., Kao, J.L.-F. (1996) Building blocks for ribozyme mimics: conjugates of terpyridine and bipyridine with nucleosides. J. Org. Chem., V. 61, N 7, P. 2314-2321.

111. Asanuma, H., Yoshida, Т., Ito, Т., Komiyama, M. (1999) Photo-responsive oligonucleotides carrying azobenzene at the 2'-position of uridine. Tetrahedron Lett., V. 40, N 45, P. 7995-7998.

112. Yamana, K, Ohashi, Y., Nunota, K, Kitamura, M., Nakano, H., Sangen, ()., Shimidzu, T. (1991) Synthesis of oligonucleotide derivatives with pyrene group at sugar fragment. Tetrahedron Lett., V. 32, N 44, P. 6347-6350.

113. Yamana, K, Aota, R., Nakano, H. (1995) Oligonucleotides having covalently linked anthracene at specific sugar residue: differential binding to DNA and RNA and fluorescence properties. Tetrahedron Lett., V. 36, N 46, P. 8427-8430.

114. Yamana, K, Nishijima, Y., Ikeda, Т., Gokota, Т., Ozaki, H., Nakano, H., Sangen, O., Shimidzu, T. (1990) Synthesis and interactive properties of an oligonucleotide with anthraquinone at the sugar fragment. Bioconjugate Chem.,V. 1, N 5, P. 319-324.

115. Ly, D., Sanii, L, Schuster, G.B. (1999) Mechanism of charge transport in DNA: internally-linked anthraquinone conjugates support phonon-assisted polaron hopping. J. Am. Chem. Soc., V. 121, N 40, P. 9400-9410.

116. Manoharan, M., Tivel, K.L., Cook, P.D. (1995) Lipidic nucleic acids. Tetrahedron Lett., V. 36, N21, P. 3651-3654.

117. Whittemore, N.A., Mullenix, A.N., Inamati, G.B., Manoharan, M., Cook, P.D., Tuinman, A. A., Baker, D.C., Chambers, J.Q. (1999) Synthesis and electrochemistry of anthraquinone-oligodeoxynucleotide conjugates. Bioconjugate Chem., V. 10, N 2, 261270.

118. Keller, Т.Н., Haner, R. (1993) Synthesis and hybridization properties of oligonucleotides containing 2'-0-modified ribonucleotides. Nucleic Acids Res.,V. 21, N 19, P. 4499-4505.

119. Seio, K., Wada, Т., Sakamoto, K, Yokoyama, S., Sekine, M. (1998) Chemical synthesis and properties of conformationally fixed diuridine monophosphates as building blocks of the RNA turn motif. J. Org. Chem., V. 63, N 5, P. 1429-1443.

120. Seio, K, Wada, Т., Sakamoto, K, Yokoyama, S., Sekine, M. (2000) Synthesis and properties of oligothymidylates incorporating an artificial bend motif. Helv. Chim. Acta, V. 83, N 1,P. 162-180.

121. Anisuzzaman, A.K.M., Alam, F., Soloway, A.H. (1990) Synthesis of a carboranyl nucleoside for potential use in neutron capture therapy of cancer. Polyhedron, V. 9, N 6, P. 891-892.

122. Barth, R.F., Soloway, A.H., Fairchild, R.G., Brugger, R.M. (1992) Boron neutron capture therapy for cancer. Realities and prospects. Cancer, V. 70, N 12, P. 2995-3007.

123. Soloway, A.H., Tjarb, W., Barnum, B.A., Rong, F.G., Barth, R.F., Codogni, I.M., Wilson, J.G. (1998) The chemistry of neutron capture therapy. Chem. Rev., V. 98, N 4, P. 1515-1562.

124. Liu, L., Barth, R.F., Tjarks, W., Soloway, A.H., Anisuzzaman, A.K.M. (1996) In vitro and in vivo evaluation of carboranyl uridines as boron delivery agents for neutron capture therapy. Anticancer Res., V. 16, N 1, P. 113-120.

125. Mitsui, Т., Hayashi, H., Yamana, K., Nakano, H. (1997) Synthesis and properties of oligonucleotide derivatives containing a hydrophobic fluorescent dye at the 2'-position. Nucleic Acids Symp. Ser., N 37, P. 69-70.

126. Yamana, K., Mitsui, Т., Hayashi, H., Nakano, H. (1997) An uridine derivative containing a hydrophobic fluorescent probe at the 2'-position: synthesis and its incorporation into oligonucleotides. Tetrahedron Lett., V. 38, N 33, P. 5815-5818.

127. Mitsui, Т., Nakano, H., Yamana, K. (2000) Coumarin-fluorescein pair as a new donor-acceptor set for fluorescence energy transfer study of DNA. Tetrahedron Lett., V. 41, N 15, P. 2605-2608.

128. Milne, L., Perrin, D.M., Sigman, D.S. (2000) An approach to gene-specific transcription inhibition using oligonucleotides complementary to the template strand of the open complex. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 97, N 7, P. 3136-3141.

129. J 83. Kryatova, O.P., Connors, W.H., Bleczinski, C.F., Mokhir, A.A., Richert, C. (2001) A 2'-acylamido cap that increases the stability of oligonucleotide duplexes. Org. Lett., V. 3, N 7, P. 987-990.

130. Matulic-Adamic, J., Beigelman, L., Dudycz, L.W., Gonzalez, C., Usman, N. (1995) Synthesis and incorporation of 2'-amino acids conjugated nucleotides into ribozymes. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 5, N 22, P.2721-2724.

131. Matulic-Adamic, J., Serebryany, V., Haeberli, P., Mokler, V.R., Beigelman, L. (2002) Synthesis of jV-acetyl-D-galactosamine and folic acid conjugated ribozymes. Bioconjugate Chem., V. 13, N 5, P. 1071-1078.

132. Link, A., van Calenbergh, S., Herdewijn, P. (1998) Practical method for the parallel synthesis of 2'-amido-2'-deoxyadenosines. Tetrahedron Lett., V. 39, N 29, P. 5175-5176.

133. Backes, В., Virgilio, A.A., Ellmann, J.A. (1996) Activation method to prepare a highly reactive acylsulfonamide "safety-catch" linker for solid-phase synthesis J. Am. Chem. Soc., V. 118, N 12, P. 3055-3056.

134. Golisade, A., Van Calenbergh, S., Link, A. (2000) 2,-Amino-2'-deoxy-A^6-(l-naphthylmethyl)adenosine as novel scaffold for a polymer-assisted amidation protocol. Tetrahedron, V. 56, N 20, P. 3167-3172.

135. Golisade, A., Herforth, C., Quirijnen, L., Maes, L., Link, A. (2002) Improving an antitrypanosomal lead applying nucleophilic substitution on a safety catch linker. Bioorg. Med. Chem., V. Ю, N 1, P. 159-165.

136. Polushin, N.N. (1996) Synthesis of functionally modified oligonucleotides from methoxyoxalamido precursors. Tetrahedron Lett., V. 37, N 19, P. 3231-3234.194. Пат. 5,902,879 США (1999)

137. Polushin, NN. (1999) Synthesis of highly functionalized oligonucleotides using novel modifying and branching phosphoramidite units. Collection Czechoslovak Chemical Communications, Symposium Series, V. 2, P. 145-150.

138. Meade, T.J., Kayyem, J.F. (1995) Electron transfer through DNA: site-specific modification of duplex DNA with ruthenium donors and acceptors. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., V. 34, N 3, P. 352-354.

139. Krider, E.S., Meade, T.J. (1998) Electron transfer in DNA: covalent attachment of spectroscopically unique donor and acceptor complexes. J. Bioinorg. Chem., V. 3, P. 222225.

140. Hall, D.B., Holmlin, R.E., Barton, J.K (1996) Oxidative DNA damage through long-range electron transfer. Nature, V. 382, N 6593, P. 731-735.

141. Dandliker, P.J., Holmlin, R.E., Barton, J.K. (1997) Oxidative thymine dimer repair in the DNA helix. Science, V. 275, N 5305, P. 1465-1468.

142. Rack, J.J., Krider, E.S., Meade, T.J. (2000) Spectroscopy and electrochemistry of ruthenium-modified nucleic acids: design of a novel metal-binding nucleoside. J. Am. Chem. Soc., V. 122, N 26, P. 6287-6288.

143. Krider, E.S., Rack, J.J., Frank, N.L., Meade, T.J. (2001) Automated synthesis of 3'-metalated oligonucleotides. Inorg. Chem., V. 40, N 16, P. 4002-4009.

144. Frank, N.L., Meade, T.J. (2003) 5'-Modification of duplex DNA with a ruthenium electron donor-acceptor pair using solid-phase DNA synthesis. Inorg. Chem., V. 42, N 4, P. 1039-1044.

145. Dombi, K.L., Steiner, U.E., Richert, C. (2003) Rapidly measuring reactivities of carboxylic acids to generate equireactive building block mixtures: a spectrometric assay. J. Comb. Chem., V. 5, N 1, P. 45-60.

146. Barber-Peoc % I., Manoharan, M., Cook, P.D. (1997) Solid phase conjugation chemistry: use of Alloc as a protecting group for 2'-aminolinker containing oligonucleotides. Nucleosides, Nucleotides, V. 16, N 7-9, P. 1407-1410.

147. Maier, M.A., Barber-Peoc 'h, I., Manoharan, M. (2002) Postsynthetic guanidilation of primary amino groups in the minor and major grooves of oligonucleotides. Tetrahedron Lett., V. 43, N 42, P. 7613-7616.

148. Connors, W.H., Naranayan, S., Kryatova, O.P., Richert, C. (2003) Synthesis of oligonucleotides with a 2'-cap at the З'-terminus via reversed phosphoramidites. Org. Lett., V. 5, N 3, P. 247-250.

149. Zubin, E.M., Romanova, E.A., Volkov, E.M., Tashlitsky, V.N., Korshunova, G.A., Shabarova, Z.A., Oretskaya, T.S. (1999) Oligonucleotide-peptide conjugates as potential antisense agents. FEBS Lett., V. 456, N 1, P. 59-62.

150. Hwang, J.-T., Greenberg, M.M. (1999) Synthesis of modified oligodeoxyribonucleotides on a solid-phase support via derivatization of a selectively revealed 2,-amino-2'-deoxyuridine. Org. Lett., V. 1, N 12, P. 2021-2024.

151. Hwang, J.-T., Greenberg, M.M. (2001) Synthesis of 2'-modified oligodeoxynucleotides via on-column conjugation. J. Org. Chem., V. 66, N 2, P. 363-369.

152. Tam, J.P., Spetzler, J.C. (1995) Chemoselective approaches to the preparation of peptide dendrimers and branched artificial proteins using unprotected peptides as building blocks. Biomed. Pept. Proteins Nucleic Acids, V. 1, N 3, P. 123-132.

153. Wu, X., Pitsch, S. (2000) Synthesis of 5'-C- and 2'-0-(bromoalkyl)-substituted ribonucleoside phosphoramidites for the post-synthetic functionalization of oligonucleotides on solid support. Helv. Chim. Acta, V. 83, N 6, P. 1127-1144.

154. Gueschlbauer, W., Jankowski, K. (1980) Nucleoside conformation is determined by the electronegativity of the sugar substituent. Nucleic Acids Res., V. 8, N 6, P. 1421-1433.

155. Kan, L.-S., Bauman, R., Bhan, P., Miller, P.S. (1993) Proton magnetic resonance measurements of 2'-aminodeoxyuridylyl-3',5'-deoxyuridine. J. Chinese Chem. Soc., V.40, N 5, P. 469-473.

156. Aurup, H., Tuschl, Т., Benseler, F., Ludwug, J., Eckstein, F. (1994) Oligonucleotide duplexes containing 2'-amino-2'-deoxycytidines: thermal stability and chemical reactivity. Nucleic Acids Res., V. 22, N 1, P. 20-24.

157. Beigelman, L., Karpeisky, A., Matulic-Adamic, J., Haerberli, P., Sweedler, D., Usman, N. (1995) Synthesis of 2'-modified nucleotides and their incorporation into hammerhead ribozymes. Nucleic Acids Res., V. 23, N 21, P. 4434-4442.

158. Miller, P.S., Bhan, P., Kan, L.-S. (1993) Synthesis and interactions of oligonucleotides containing 2'-amino-2'-deoxyuridine. Nucleosides, Nucleotides, V. 12, N 8, P. 785-792.

159. Wincott, F., Di Renzo, A., Shaffer, C., Grimm, S., Tracz, D., Workman, C., Sweedler, D., Usman, N. (1995) Synthesis, deprotection, analysis and purification of RNA and ribozymes. Nucleic Acids Res., V. 23, N 14, P. 2677-2684.

160. Heindenreich, O., Benseler, F., Fahrenholz, A., Eckstein, F. (1994) High activity and stability of hammerhead ribozymes containing 2'-modified pyrimidine nucleosides and phosphorothioates. J. Biol. Chem., V. 269, N 3, P. 2131-2138.

161. Walcher, G., Pfleiderer, W. (1996) Synthesis of 2'-amino-2'-deoxyarabinonucleoside building blocks. Helv. Chim. Acta, V. 79, N 5, P. 1067-1074.

162. Greiner, В., Phleiderer, W. (1998) Synthesis of phosphoramidite building blocks of 2'-amino-2'-deoxyribonucleosides: new compounds for oligonucleotide synthesis. Helv. Chim. Acta., V. 81, N6, P. 1528-1544.

163. Polushin, N.N., Smirnov, LP., Verentchikov, A.N., Coull, J.M. (1996) Synthesis of oligonucleotides containing 2'-azido- and 2'-amino-2'-deoxyuridine using phosphotriester chemistry. Tetrahedron Lett., V. 37, N 19, P. 3227-3230.

164. Кузнецова, Л.Г., Волков, Е.М., Романова, Е.А., Ташлицкий, В.Н., Орецкая, Т.С., Шабарова, З.А. (1991) Синтез олигодезоксирибонуклеотидов, содержащих 2'-амино-2'-дезоксиуридиновые звенья. Биоорг. химия, Т. 17, N 9, С. 1289-1291.

165. Кузнецова, JI.Г., Романова, Е.А., Волков, Е.М., Ташлицкий, В.Н., Орецкая, Т.С., Крынецкая, Н.Ф., Шабарова, З.А. (1993) Синтез олигодезоксирибонуклеотидов, содержащих 2'-амино-2'-дезоксиуридиновые нуклеозиды. Биоорг. химия, Т. 19, N 4, С. 455-466.

166. Yamana, К., Mitsui, Т., Nakano, Н. (1999) Synthesis and properties of oligonucleotide duplexes containing donor and acceptor fluorophores at 2'-position. Tetrahedron, V. 55, N30, P. 9143-9150.

167. Sergiev, P., Dokudovskaya, S., Romanova, E., Topin, A., Bogdanov, A., Brimacombe, R., Dontsova, O. (1998) The environment of 5S rRNA in the ribosome: cross-links to the GTPase-associated area of 23S rRNA. Nucleic Acids Res., V. 26, N 11, P. 2519-2525.

168. Sigurdsson, S.T., Tushl, Т., Eckstein, F. (1995) Probing RNA tertiary structure: interhelical crosslinking of the hammerhead ribozyme. RNA, V. 1, N 6, P. 575-583.

169. Sigurdsson, S.T., Eckstein, F. (1996) Site specific labelling of sugar residues in oligoribonucleotides: reactions of aliphatic isocyanates with 2' amino groups. Nucleic Acids Res., V. 24, N 16, P. 3129-3133.

170. Alefelder, S., Sigurdsson, S T. (2000) Interstrand disulfide cross-linking of internal sugar residues in duplex RNA. Bioorg. Med. Chem., V. 8, N 1, P. 269-273.

171. Анцыпович, С.И., Волков, Е.М., Орецкая, Т.С., Романова, Е.А., Ташлицкий, В.Н., Блюменфельд, М., Шабарова, З.А. (1995) Синтез модифицированных олигонуклеотидов и дуплексов с ковалентно-связанными цепями. Биоорг. химия, Т. 21, N 10, С. 774-780.

172. Анцыпович, С.И., Орецкая, Т.С., Романова, Е.А., Волков, Е.М., Ташлицкий, В.Н., Вассер, М., Шабарова, З.А. (1996) ДНК-дуплексы с ковалентно-связанными цепями: синтез и свойства. Биоорг. химия, Т. 22, N 4, С. 264-268.

173. Antsypovich, S.I., Oretskaya, T.S., Romanova, E.A., Volkov, E.M., Tashlitsky, V.N., Vasser, M., Shabarova, Z.A. (1996) Synthesis and properties of cross-linked DNA duplexes. FEBS Lett., V. 378, N 3, 224-226.

174. Качалова, А.В., Зубин, E.M. (1998) Синтез модифицированных олигодезоксирибонуклеотидов, содержащих 1 -(2-амино-2-дезокси-р-0-арабинофуранозил)урацил. Докл. Акад. Наук РАН, Т. 363, N 4-6, С. 507-509.

175. Silverman, S.K., Cech, T.R. (1999) RNA tertiary folding monitored by fluorescence of covalently attached pyrene. Biochemistry, V. 38, N 43, P. 14224-14237.

176. Chamberlin, S.J., Weeks, KM. (2000) Mapping local nucleotide flexibility by selective acylation of 2'-amine substituted RNA. J. Am. Chem. Soc., V. 122, N 2, P. 216-224.

177. John, D.M., Weeks, KM. (2000) Tagging DNA mismatches by selective 2'-amine acylation. Chem. Biol., V. 7, N 6, P. 405-410.

178. John, D.M., Weeks, KM. (2002) Chemical interrogation of mismatches in DNA-DNA and DNA-RNA duplexes under nonstringent conditions by selective 2'-amine acylation. Biochemistry, V. 41, N 21, P. 6866-6874.

179. Beban, M., Miller, P S. (2000) Preparation of an imidazole-conjugated oligonucleotide. Bioconjugate Chem., V. 11, N 4, P. 599-603.

180. Louie, A.Y., Meade, T.J. (1998) A cobalt complex that selectively disrupts the structure and function of zinc fingers. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 95, N 12, P. 6663-6668.

181. Hall, J., Husken, D., Haner, R. (1996) Towards artificial ribonucleases: the sequence-specific cleavage of RNA in a duplex. Nucleic Acids Res.,V. 24, N 18, P. 3522-3526.

182. Стеценко, Д.А., Арзуманов, А.А., Коршун, В.А., Гейт, М.Дж. (2000) Пептид-олигонуклеотидные конъюгаты как антисмысловые конъюгаты нового поколения. Молекуляр. биология, Т. 34, N 6, С. 998-1006.

183. Cohen, S.B., Cech, T.R. (1997) Dynamics of thermal motions within a large catalytic RNA investigated by cross-linking with thiol-disulfide interchange. J. Am. Chem. Soc., V. 119, N 27, P. 6259-6268.

184. Hamm, M.L., Piccirilly, J.A. (1999) Synthesis and characterization of oligonucleotides containing 2'-S,3'-0-cyclic phosphorothiolate termini. J. Org. Chem., V. 64, N 15, P. 5700-5704.

185. Johnson, R., Reese, C.B., Pei-Zhuo, Z. (1995) Lability of glycosidic linkages of 2'-thio-ribonucleosides. Tetrahedron, V. 51, N 17, P. 5093-5098.

186. Dantzman, C.L., Kiesseling, L.L. (1996) Reactivity of a 2'-thio nucleotide analog. J. Am. Chem. Soc.,V. 118, N47, P. 11715-11719.

187. Manoharan, M., Andrade, L.K, Cook, P.D. (1999) Site-specific cross-linking of nucleic acids using the abasic site. Org. Lett., V. 1, N 2, P. 311-314.257. Пат. 5,719,271 США (1998)258. Пат. 5,543,507 США (1996)

188. Fontecave, M. (1998) Ribonucleotide reductases and radical reactions. Cell Mol. Life Sci., V. 54, N 7, P. 684-695.

189. Stubbe, J., van der Donk, W.A. (1995) Ribonucleotide reductases: radical enzymes with suicidal tendencies. Chem. Biol., V. 2, N 12, 793-801.

190. Smith, D.H., Pepin, J., Stich, A.H. (1998) Human African trypanosomiasis: an emerging public health crisis. Br. Med. Bull., V. 54, N 2, P. 341-355.

191. Aronov, A.M., Verlinde, C.L.M.J., Hoi, W.G.J., Gelb, M.H (1998) Selective tight binding inhibitors of trypanosomal glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase via structure-based drug design. J. Med. Chem., V. 41, N 24, P. 4790-4799.

192. Suresh, S., Bressi, J.C., Kennedy, K.J., Verlinde, C.L., Gelb, M.H., Hoi, W.G. (2001) Conformational changes in Leishmania mexicana glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase induced by designed inhibitors. J. Mol. Biol., V. 309, N 2, P. 423-445.

193. Uhlmann, E., Peyman, A. (1990) Antisense oligonucleotides: a new therapeutic principle. Chem. Rev., V. 90, N 4, P. 543-584.

194. Milligan, J.F., Matteucci, M.D., Martin, J.C. (1993) Current concepts in antisense drug design. J. Med. Chem., V. 36, N 14, P. 1923-1937.

195. Boiziau, C., Thuong, N.T., Toulme, J.J. (1992) Mechanisms of the inhibition of reverse transcription by antisense oligonucleotides. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 89, N 2, P. 768-772.

196. Baker, B.F., Khalili, #., Wei, N., Morrow, JR. (1997) Cleavage of the 5'-cap structure of mRNA by a europium(III) macrocyclic complex with pendant alcohol groups. J. Am. Chem. Soc., V. 119, N 38, P. 8749-8755.

197. Wilson, D.S., Szostak, J.W. (1999) In vitro selection of functional nucleic acids. Annu. Rev. Biochem., V. 68, P. 611-647.

198. Emilsson, G.M., Breaker, R.R. (2002) Deoxyribozymes: new activities and new applications. Cell Mol. Life Sci., V. 59, N 4, P. 596-607.

199. Trawick, B.N., Daniher, А.Т., Bashkin, J.K. (1998) Inorganic mimics of ribonucleases and ribozymes: from random cleavage to sequence-specific chemistry to catalytic antisense drugs. Chem. Rev., V. 98, N 3, P. 939-960.

200. Сильников, B.H., Власов, ВВ. (2001) Конструирование реагентов для направленного расщепления рибонуклеиновых кислот. Успехи химии, Т. 70, N 6, С. 562-580.

201. Knorre, D.G., Vlassov, V.V., Zarytova, V.F. (1985) Reactive oligonucleotide derivatives and sequence-specific modification of nucleic acids. Biochimie, V. 67, N 7-8, P. 785-789.

202. Bennett, C.F. (2002) Efficiency of antisense oligonucleotide drug discovery. Antisense Nucleic Acid Drug Dev., V. 12, N 3, P. 215-224.

203. Sung, J., Garestier, Т., Helene, C. (1996) Oligonucleotide directed triple helix formation. Curr. Opin. Struct. Biol., V. 6, N 3, P. 327-333.

204. Schmid, N. Behr, J.-P. (1995) Recognition of DNA sequences by strand replacement with poly amino-oligonucleotides. Tetrahedron Lett., V. 36, N 9, P. 1447-1450.

205. Demidov, V., Frank-Kamenetskii, M., Egholm, M., Buchardt, O., Nielsen, P.E. (1993) Sequence selective double strand DNA cleavage by peptide nucleic acid (PNA) targeting using nuclease SI. Nucleic Acids Res., V. 21, N 9, P. 2103-2107.

206. Ragunathan, K.G., Schneider, H.-J. (1996) Zweikernige lanthanoidkomplexe als katalysatoren fuer die hydrolyse von bis(p-nitrophenyl)phosphat und von doppelstraengiger DNA. Angew. Chem., V. 108, N 11, P. 1314-1316.

207. Sergeyev, D.S., Godovikova, T.S., Zarytova, V.F. (1995) Catalytic site-specific cleavage of a DNA-target by an oligonucleotide carrying bleomycin A5. Nucleic Acids Res., V. 23, N21, P. 4400-4406.

208. Povsic, T.J., Dervan, P.В. (1990) Sequence-specific alkylation of double-helical DNA by oligonucleotide-directed triple-helix formation. J. Am. Chem. Soc., V. 112, N 25, C. 9428-9430.

209. Fire, A., Xu, S., Montgomery, M.K., Kostas, S.A., Driver, S.E., Mello, C.C. (1998) Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature, V. 391, N 6669, P. 806-811.

210. Elbashir, S.M., Hardworth, J., Lendeckel, W., Yalcin, A., Weber, K., Tuschl, T. (2001) Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells. Nature, V. 411, N 6836, P. 494-498.

211. Elbashir, S.M., Lendeckel, W„ Tuschl, T. (2000) RNA interference is mediated by 21-and 22-nucleotide RNAs. Genes Dev., V.15, N 2, P. 188-200.

212. Parrish, S., Fleenor, J., Xu, S., Mello, С., Fire, A. (2000) Functional anatomy of a dsRNA trigger: differential requirement for the two trigger strands in RNA interference. Mol. Cell, V. 6, N 5, P. 1077-1087.

213. Elbashir, S.M., Martinez, J., Patkaniowska, A., Lendeckel, W., Tuschl, T. (2001) Functional anatomy of siRNAs for mediating efficient RNAi in Drosophila melanogaster embryo lysate. EMBO J., V. 20, N 23, P. 6877-6888.

214. Scadden, A.D.J., Smith, C.W.J. (2001) RNAi is antagonized by A->I hyper-editing. EMBO Rep., V. 2,N 12, P. 1107-1111.

215. Braasch, D.A., Jensen, S., Liu, Y., Kaur, K., Arar, K., White, M.A., Corey, D.R. (2003) RNA interference in mammalian cells by chemically-modified RNA. Biochemistry, V. 42, N 26, P. 7967-7975.

216. Grosshans, H., Slack, F.J. (2002) Micro-RNAs: small is plentiful. J. Cell Biol., V. 156, N 1,P. 17-21.

217. Moss, E.G. (2002) MicroRNAs: something new under the sun. Curr. Biol., V. 12, N 20, P. R688-R690.

218. McManus, M.T., Sharp, P.A. (2002) Gene silencing in mammals by small interfering RNAs. Nat. Rev. Genet., V. 3, N 10, P. 737-747.

219. Gottesman, S. (2002) Stealth regulation: biological circuits with small RNA switches. Genes Dev., V. 16, N 22, P. 2829-2842.

220. Tuerk, С., Gold, L. (1990) Systematic evolution of ligands by exponential enrichment: RNA ligands to bacteriophage T4 DNA polymerase. Science, V. 249, N 4968, P. 505510.

221. Ellington, A.D., Szostak, J.W. (1990) In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands. Nature, V. 346, N 6287, P. 818-822.

222. Копылов, A.M., Спиридонова, В.A. (2000) Комбинаторная химия нуклеиновых кислот: SELEX. Молекуляр. биология, Т. 34, N 6, С. 1097-1 ПЗ.

223. Hermann, Т., Patel, D.J. (2000) Adaptive recognition by nucleic acid aptamers. Science, V. 287, N 5454, P. 820-825.

224. Kusser, W. (2000) Chemically modified nucleic acid aptamers for in vitro selections: evolving evolution. J. Biotechnol., V. 74, N 1, P. 27-38.

225. Beck, J.L. Col grave, M.L., Ralph, S.F., Sheil, M.M. (2001) Electrospray ionization mass spectrometry of oligonucleotide complexes with drugs, metals, and proteins. Mass. Spectrom. Rev., V. 20, N 2, P. 61-87.

226. Huber, C.G., Oberacher, H. (2001) Analysis of nucleic acids by on-line liquid chromatography-mass spectrometry. Mass. Spectrom. Rev., V. 20, N 5, P. 310-343.

227. Jayasena, V.K., Gold, L. (1997) In vitro selection of self-cleaving RNAs with a low pH optimum. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 94, N 20, P. 10612-10617.

228. Cazenave, C., Chevrier, M., Nguyen, T.T., Helene, C. (1987) Rate of degradation of a-and (3-oligodeoxynucleotides in Xenopus oocytes. Implications for anti-messenger strategies. Nucleic Acids Res., V. 15, N 24, P. 10507-10521.

229. Eder, P.S., Devine, R.J., Dagle, J.M., Walder, J.A. (1991) Substrate specificity and kinetics of degradation of antisense oligonucleotides by a 3' exonuclease in plasma. Antisense Res. Dev.,V. 1,N2, P. 141-151.

230. Petersen, M., Wengel, J. (2003) LNA: a versatile tool for therapeutics and genomics. Trends Biotechnol., V. 21, N 2, P. 74-81.

231. Elayadi, A.N., Corey, DR. (2001) Application of PNA and LNA oligomers to chemotherapy. Curr. Opin. Investig. Drugs, V. 2, N 4, P. 558-561.

232. Tung, C.H., Stein, S. (2000) Preparation and applications of peptide-oligonucleotide conjugates. Bioconjugate Chem., V. 11, N 5, P. 605-618.

233. Mahato, R.I., Takakura, Y., Hashida, M. (1997) Development of targeted delivery systems for nucleic acid drugs. J. Drug Target., V. 4, N 6, P. 337-357.

234. Juliano, R.L., Akhtar, S. (1992) Liposomes as a drug delivery system for antisense oligonucleotides. Antisense Res. Dev., V. 2, N 2, P. 165-176.

235. Thierry, A.R., Dritschilo, A. (1992) Intracellular availability of unmodified, phosphorothioated and liposomally encapsulated oligodeoxynucleotides for antisense activity. Nucleic Acids Res., V. 20, N 21, P. 5691-5698.

236. Dass, C.R. (2002) Vehicles for oligonucleotide delivery to tumours. J. Pharm. Pharmacol., V. 54, N 1, P. 3-27.

237. Venugopalan, P., Jain, S., Sankar, S., Singh, P., Rawat, A., Vyas, S.P. (2002) pH-sensitive liposomes: mechanism of triggered release to drug and gene delivery prospects. Pharmazie, V. 57, N 10, P. 659-671.

238. Fresta, M., Chillemi, R., Spampinato, S., Scuito, S., Puglisi, G. (1998) Liposomal delivery of a 30-mer antisense oligodeoxynucleotide to inhibit proopiomelanocortin expression. J. Pharm. Sci., V. 87, N 5, P. 616-625.

239. Selvam, M.P., Buck, S.M., Blay, R.A., Mayner, R.E., Mied, P.A., Epstein, J.S. (1996) Inhibition of HIV replication by immunoliposomal antisense oligonucleotide. Antiviral Res., V. 33, N 1,P. 11-20.

240. Monsigny, M., Midoux, P., Mayer, R., Roche, A.C. (1999) Glycotargeting: influence of the sugar moiety on both the uptake and the intracellular trafficking of nucleic acid carried by glycosylated polymers. Biosci Rep., V. 19, N 2, P. 125-132.

241. Lambert, G., Fattal, E., Couvreur, P. (2001) Nanoparticulate systems for the delivery of antisense oligonucleotides. Adv. Drug Deliv. Rev., V. 47, N 1, P. 99-112.

242. Esfand, R., Tomalia, D.A. (2001) Poly(amidoamine) (РАМАМ) dendrimers: from biomimicry to drug delivery and biomedical applications. Drug Discov. Today, V. 6, N 8, P. 427-436.

243. Lebedeva, I., Benimetskaya, L., Stein, C.A., Vilenchik, M. (2000) Cellular delivery of antisense oligonucleotides. Eur. J. Pharm. Biopharm., V. 50, N 1, P. 101-119.

244. Шефлян, Г.Я., Кубарева, E.A., Громова, E.C. (1996) Методы ковалентного присоединения нуклеиновых кислот и их производных к белкам. Успехи химии, Т. 65, N 8, С. 765-781.

245. Teplova, М., Wallace, S.T., Tereshko, V., Minasov, G., Symons, A.M., Cook, P.D., Manoharan, M., Egli, M. (1999) Structural origins of the exonuclease resistance of a zwitterionic RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 96, N 25, P. 14240-14245.

246. Arzumanov, A., Walsh, A.P., Rajwanshi, V.K., Kumar, R., Wengel, J., Gait, M.J. (2001) Inhibition of HIV-1 Tat-dependent trans activation by steric block chimeric T-O-methyl/LNA oligoribonucleotides. Biochemistry, V. 40, N 48, P. 14645-14654.

247. Schmitz, J.C., Yu, D., Agrawal, S., Chu, E. (2001) Effect of 2'-0-methyl antisense ORNs on expression of thymidylate synthase in human colon cancer RKO cells. Nucleic Acids Res., V. 29, N 2, P. 415-422.

248. Sazani, P., Kang, S.H., Maier, M.A., Wei, C., Dillman, J., Summerton, J., Manoharan, M., Kole, R. (2001) Nuclear antisense effects of neutral, anionic and cationic oligonucleotide analogs. Nucleic Acids Res., V. 29, N 19, P. 3965-3974.

249. Dapic, V., Bates, P.J., Trent, J.O., Rodger, A., Thomas, S.D., Miller, D.M. (2002) Antiproliferative activity of G-quartet-forming oligonucleotides with backbone and sugar modifications. Biochemistry, V. 41, N 11, P. 3676-3685.

250. Мои, T.C., Gray, D.M. (2002) The high binding affinity of phosphorothioate-modified oligomers for Ff gene 5 protein is moderated by the addition of C-5 propyne or T-O-methyl modifications. Nucleic Acids Res., V. 30, N 3, P. 749-758.

251. Ma, M., Benimetskaya, L., Lebedeva, I., Dignam, J., Takle, G., Stein, C.A. (2000) Intracellular mRNA cleavage induced through activation of RNase P by nuclease-resistant external guide sequences. Nat. Biotechnol., V. 18, N 1, P. 58-61.

252. Krupp, G. (1993) Antisense oligoribonucleotides and RNase P. A great potential. Biochimie, V. 75, N 1-2, P. 135-9.

253. Teplova, M., Minasov, G., Tereshko, V., Inamati, G.B., Cook, P.D., Manoharan, M., Egli, M. (1999) Crystal structure and improved antisense properties of 2'-0-(2-methoxyethyl)-RNA. Nat. Struct. Biol., V. 6, N 6, P. 535-539.

254. Khatsenko, O., Morgan, R., Truong, L, York-Defalco, C., Sasmor, H., Conklin, В., Geary, R.S. (2000) Absorption of antisense oligonucleotides in rat intestine: effect of chemistry and length. Antisense Nucleic Acid Drug Dev., V. 10, N 1, P. 35-44.

255. Sazani, P., Gemignani, F., Kang, S.H., Maier, M.A., Manoharan, M., Persmark, M., Bortner, D., Kole, R. (2002) Systemically delivered antisense oligomers upregulate gene expression in mouse tissues. Nat. Biotechnol., V. 20, N 12, P. 1228-1233.

256. Yu, R.Z., Geary, R.S., Monteith, D.K., Matson, J., Truong, L., Fitchett, J., Levin, A.A. (2004) Tissue disposition of 2'-0-(2-methoxy)ethyl modified antisense oligonucleotides in monkeys. J. Pharm. Sci., V. 93, N 1, P. 48-49.

257. Corey, DR. (2002) Telomerase inhibition, oligonucleotides, and clinical trials. Oncogene, V. 21, N4, P. 631-637.

258. Vickers, T.A., Wyatt, J.R., Burckin, Т., Bennett, C.F., Freier, S.M. (2001) Fully modified 2'-MOE oligonucleotides redirect polyadenylation. Nucleic Acids Res., V. 29, N 6, P. 1293-1299.

259. Torigoe, H., Shimizume, R., Sarai, A., Shindo, H. (1999) Triplex formation of chemically modified homopyrimidine oligonucleotides: thermodynamic and kinetic studies. Biochemistry, V. 38, N 44, P. 14653-14659.

260. Asensio, J.L., Carr, R., Brown, Т., Lane, A.N. (1999) Conformational and thermodynamic properties of parallel intramolecular triple helices containing a DNA, RNA, or 2'-OMeDNA third strand. J. Am. Chem. Soc., V. 121, N 48, P. 11063-11070.

261. Puri, N., Majumdar, A., Cuenoud, В., Natt, F., Martin, P., Boyd, A., Miller, P.S., Seidman, M.M. (2001) Targeted gene knockout by 2'-C>-aminoethyl modified triplex forming oligonucleotides. J. Biol. Chem., V. 276, N 31, P. 28991-28998.

262. Wiberg, K.B. (1996) Bent bonds in organic compounds. Acc. Chem. Res., V. 29, N 5, P. 229-234.

263. Sollogoub, M„ Darby, R., Cuenoud, В., Brown, Т., Fox, K.R. (2002) Stable DNA triple helix formation using oligonucleotides containing 2'-aminoethoxy,5-propargylamino-U. Biochemistry, V. 41, N 23, P. 7224-7231.

264. Pingoud, V., Kubareva, E., Stengel, G., Friedhoff P., Bujnicki, J.M., Urbanke, C., Sudina, A., Pingoud, A. (2002) Evolutionary relationship between different subgroups of restriction endonucleases. J. Biol. Chem., V. 277, N 16, P. 14306-14314.

265. Meisenheimer, K.M., Koch, Т.Н. (1997) Photocross-linking of nucleic acids to associated proteins. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., V. 32, N 2, P. 101-140.

266. Ghosh, M., Kumar, N.V., Varshney, U., Chary, K.V. (2000) Structural basis for uracil DNA glycosylase interaction with uracil: NMR study. Nucleic Acids Res., V. 28, N 9, P. 1906-1912.

267. Pingoud, A., Jeltsch, A. (1997) Recognition and cleavage of DNA by type-Il restriction endonucleases. Eur. J. Biochem., V. 246, N 1, 1-22.

268. Lin, Y., Qiu, Q„ Gill, SC., Jayasena, S.D. (1994) Modified RNA sequence pools for in vitro selection. Nucleic Acids Res., V. 22, N 24, P. 5229-5234.

269. Nelson, J.S., Giver, L., Ellington, A.D., Letsinger, R.L. (1996) Incorporation of a non-nucleotide bridge into hairpin oligonucleotides capable of high-affinity binding to the Rev protein of H1V-1. Biochemistry, V. 35, N 16, P. 5339-5344.

270. Teramoto, N., Ichinary, H., Kawazoe, N., Imanishi, Y., Ito, Y. (2001) Peroxidase activity of in v/Yro-selected 2'-amino RNAs. Biotechnol. Bioeng., V. 75, N 4, P. 463-468.

271. Kawazoe, N., Teramoto, N., Ichinari, H., Imanishi, Y., Ito, Y. (2001) In vitro selection of nonnatural ribozyme-catalyzing porphyrin metalation. Biomacromolecules, V. 2, N 3, P. 681-686.

272. Iwai, S., Kataoka, S., Wakasa, M., Ohtsuka, E., Nakamura, H. (1995) Recognition of 2'-hydroxyl groups by Escherichia coli ribonuclease HI. FEBS Lett., V. 368, N 2, 315-320.

273. Baidya, N., Uhlenbeck, O.C. (1995) The role of 2'-hydroxyl groups in an RNA-protein interaction. Biochemistry, V. 34, N 38, P. 12363-12368.

274. Dertinger, D., Dale, Т., Uhlenbeck, O.C. (2001) Modifying the specificity of an RNA backbone contact. J. Mol. Biol., V. 314, N 4, P. 649-654.

275. Sudina, A.E., Volkov, E.M., Kubareva, E.A. (2000) The repair enzyme uracil-DNA-glycosylase: study of the mechanism of functioning using modified analogues of DNA. Moscow University Chemistry Bulletin, Suppl., V. 41, P. 121-124.

276. Aurup, H„ Siebert, A., Benseler, F., Williams, D., Eckstein, F. (1994) Translation of 2'-modified mRNA in vitro and in vivo. Nucleic Acids Res., V. 22, N 23, P. 4963-4968.

277. Yamana, K, Iwase, R., Furutani, S., Tsuchida, H., Zako, H., Yamaoka, Т., Murakami, A. (1999) 2'-Pyrene modified oligonucleotide provides a highly sensitive fluorescent probe of RNA. Nucleic Acids Res., V. 27, N 11, 2387-2392.

278. Yamana, K., Zako, H., Asazuma, K., Iwase, R., Nakano, H., Murakami, A. (2001) Fluorescence detection of specific RNA sequences using 2'-pyrene-modified oligoribonucleotides. Angew. Chem. Int. Ed., V. 40, N 6, P.1104-1106.

279. Iwase, R., Tsuchida, H., Yamaoka, Т., Yamana, K., Murakami, A. (1997) Study of RNA structure by pyrene-labeled oligonucleotides. Nucleic Acids Symp. Ser., N 37, P. 205206.

280. Iwase, R., Mahara, K., Yamana, K., Yamaoka, A., Murakami, A. (1999) Study on RNA structure by pyrene-labeled 2'-0-methyloligoribonucleotides. Nucleic Acids Symp. Ser., N42, P. 115-116.

281. Palecek, E., Fojta, M. (2001) Detecting DNA hybridization and damage. Anal. Chem., V. 73, N3, P. 74A-83A.

282. Beilstein, A.E., Tierney, M.T., Grinstaff, M.W. (2000) Site-specifically labeled metallo-oligodeoxynucleotides. Comments Inorg. Chem., V. 22, N 2, P. 105-122.

283. Зацепин, T.C., Андреев, С.Ю., Гианик, Т., Орецкая, Т.С. (2003) Нуклеиновые кислоты, содержащие остаток ферроцена: синтез и электрохимические свойства. Успехи химии, Т. 72, N 6, С. 602-626.388. Пат. 6,063,573 США (2000)389. Пат. 6,071,699 США (2000)

284. Wilson, Е.К. (1998) Instant DNA detection. Systems based on electrical signals move from science fiction to reality. Chem., Eng. News, 76, N 12, P. 47-49.

285. Desmukh, H.M., Joglekar, S.P., Broom, A.D. (1995) Self-complementary oligodeoxyribonucleotides containing 2'-0-(anthraquinone-2-methyl)adenosine. Bioconjugate Chem., V. 6, N 5, P. 578-586.

286. Yamana, K, Kumamoto, S., Nakano, H., Matsuo, Y, Sigue, Y. (2001) Cyclic voltammetric responses in hybrid formation of 2'-anthraquinone-modified oligonucleotide with DNA. Chem. Lett., N 11, P. 1132-1133.

287. Sigurdsson, S.T. Thiol-containing RNA for the study of structure and function of ribozymes. Methods, V. 18, N 1, P. 71-77.

288. Glick, G. (1998) Design, synthesis, and analysis of conformationally constrained nucleic acids. Biopolymers (Nucleic Acids Sciences), V. 48, N 1, P. 83-96.

289. Sigurdsson, S.T. (2000) Site-specific sulfhydryl groups for study of RNA conformation via disulfide cross-linking. Methods Enzymol., V. 318, P. 165-175.

290. Earnshaw, D.J., Masquida, В., Muller, S., Sigurdsson, S.T., Eckstein, F., Westhof, E., Gait, M.J. (1997) Inter-domain cross-linking and molecular modelling of the hairpin ribozyme. J. Mol. Biol., V. 274, N 2, P. 197-212.

291. Stage-Zimmermann, Т.К., Uhlenbeck, O.C. (2001) A covalent crosslink converts the hammerhead ribozyme from a ribonuclease to an RNA ligase. Nat. Struct. Biol., V. 8, N 10, P. 863-867.

292. Blount, K.F., Uhlenbeck, ОС. (2002) Internal equilibrium of the hammerhead ribozyme is altered by the length of certain covalent cross-links. Biochemistry, V. 41, N 21, P. 6834-6841.

293. Maglott, E.J., Goodwin, J.T., Glick, G.D. (1999) Probing the structure of an RNA tertiary unfolding transition state. J. Am. Chem. Soc., V. 121, N 32, P. 7461-7462.

294. Коршунова, Г.А., Сумбатян, H.B., Топин, A.H., Мчедлидзе, М.Т. (2000) Фотоактивируемые реагенты на основе арил(трнфторметнл)диазиринов: синтез и использование для изучения нуклеиново-белковых взаимодействий. Молекуляр. биология, Т. 34, N 6, С. 966-983.

295. Анцыпович, С И., Орецкая, Т.С. (1998) Двуспиральные нуклеиновые кислоты с ковалентно связанными цепями синтез и применение в молекулярной биологии. Успехи химии, Т. 67, N 3, С. 274-293.

296. Chamberlin, S.I., Merino, E.J., Weeks KM. (2002) Catalysis of amide synthesis by RNA phosphodiester and hydroxyl groups. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 99, N 23, P. 14688-14693.

297. Edwards, Т.Е., Okonogi, T.M., Sigurdsson, S.T. (2002) Investigation of RNA-protein and RNA-metal ion interactions by electron paramagnetic resonance spectroscopy. The HIV TAR-Tat motif. Chem. Biol., V. 9, N 6, P. 699-706.

298. Edwards, Т.Е., Sigurdsson, S.T. (2003) EPR spectroscopic analysis of TAR RNA-metal ion interactions. Biochem. Biophys. Res. Commun., V. 303, N 2, P. 721-725.

299. Edwards, Т.Е., Sigurdsson, S.T (2002) Electron paramagnetic resonance dynamic signatures of TAR RNA-small molecule complexes provide insight into RNA structure and recognition. Biochemistry, V. 41, N 50, P. 14843-14847.

300. Schiemann, O., Weber, A., Edwards, Т.Е., Prisner, T.F., Sigurdsson, S.T. (2003) Nanometer distance measurements on RNA using PELDOR. J. Am. Chem. Soc., V. 125, N 12, P. 3434-3435.

301. Burlina, F., Favre, A., Fourrey, J.-L. (1997) Chemical engineering of RNase resistant and catalytically active hammerhead ribozymes. Bioorg. Med. Chem., V. 5, N 11, P. 1999-2010.

302. Earnshaw, D.J., Gait, M.J. (1998) Modified oligoribonucleotides as site-specific probes of RNA structure and function. Biopolymers (Nucleic Acids Sciences), V. 48, N 1, P. 3955.

303. Fedor, M.J. (2000) Structure and function of the hairpin ribozyme. J. Mol. Biol-, V. 297, N2, P. 269-291.

304. Pieken, W.A., Olsen, D.B., Benseler, F„ Aurup, H., Eckstein, F. (1991) Kinetic characterization of ribonuclease-resistant 2'-modified hammerhead ribozymes. Science, V. 253, N 5017, P. 314-317.

305. Heidenreich, O., Benseler, F., Fahrenholz, A., Eckstein, F. (1994) High activity and stability of hammerhead ribozymes containing 2'-modified pyrimidine nucleosides and phosphorothioates. J. Biol. Chem., V. 269, N 3, P. 2131-2138.

306. Zinnen, S.P., Domenico, K, Wilson, M., Dickinson, B.A., Beaudry, A., Mokler, V., Daniher, A.T., Burgin, A., Beigelman, L. (2002) Selection, design, and characterization of a new potentially therapeutic ribozyme. RNA, V. 8, N 2, P. 214-228.

307. Paolella, G., Sproat, B.S., Lamond, A.I. (1992) Nuclease resistant ribozymes with high catalytic activity. EMBOJ., V. 11. N5, P. 1913-1919.

308. Blount, K.F., Grover, N.L., Mokler, V., Beigelman, L„ Uhlenbeck, O.C. (2002) Steric interference modification of the hammerhead ribozyme. Chem. Biol., V. 9, N 9, P. 10091016.

309. Hamm, M.L., Schwans, J.P., Piccirilli, J.A. (2000) The hammerhead ribozyme catalyzes the deglycosylation of 2'-mercaptocytidine. J. Am. Chem. Soc., V. 122, N 17, P. 42234224.

310. Raines, K„ Gottlieb, P.A. (1998) Enzymatic incorporation of 2'-thio-CTP into the HDV ribozyme. RNA, V. 4, N 3, P.340-345.

311. Stromberg, R„ Hahne, S., Sjogren, A.S., Sjoberg, B.M. (1992) 2'-Amino-2'-deoxyguanosine is a cofactor for self-splicing in group I catalytic RNA. Biochem. Biophys. Res. Commun., V. 183, N 2, P. 842-848.

312. Sjogren, A.S., Pettersson, E., Sjoberg, B.M., Stromberg, R. (1997) Metal ion interaction with cosubstrate in self-splicing of group I introns. Nucleic Acids Res., V. 25, N 3, P. 648-653.

313. Sjogren, A.S., Stromberg, R., Sjoberg, B.M. (1997) pH dependence of self-splicing by the group IA2 intron in a pre-mRNA derived from the nrdB gene of bacteriophage T4. V. 25, N 17, P. 3543-3549.

314. Shan, S., Narlikar, G.J., Herschlag, D. (1999) Protonated 2'-aminoguanosine as a probe of the electrostatic environment of the active site of the Tetrahymena group I ribozyme. Biochemistry, V. 38, N 34, P. 10976-10988.

315. Morrissey, D.V., Lee, P.A., Johnson, D.A., Overly, S.L., McSwiggen, J.A., Beigelman, L., Mokler, V.R., Maloney, L., Vargeese, C., Bowman, K., O'Brien, J.T., Shaffer, C.S.,

316. Conrad, A., Schmid, P., Morrey, J.D., Macejak, D.G., Pavco, P.A., Blatt. L.M. (2002) Characterization of nuclease-resistant ribozymes directed against hepatitis В virus RNA. J. Viral Hepat., V. 9, N 6, P. 411-418.

317. Nyilas, A., Chattopadhyaya, J. (1986) Synthesis of 02'-methyluridine, 02'-methylcytidine, jV4,02'-di methyl cytidine and Ar4,A'4,02'-trimethylcytidine from a common intermediate. Acta Chem.Scand. Ser.B, V. 40, N 10, P. 826-830.

318. Scroder, M. (1980) Osmium tetraoxide in cis-hydroxylation of unsaturated substrates. Chem. Rev., V. 80, N2, P. 187-213.

319. Iwai, S. (2000) Synthesis of thymine glycol containing oligonucleotides from a building block with the oxidized base. Angew. Chem. Int. Ed., V. 39, N 21, P. 3874-3876.

320. Iwai, S. (2001) Synthesis and thermodynamic studies of oligonucleotides containing the two isomers of thymine glycol. Chem. Eur. J., V. 7, N 20, P. 4343-4351.

321. Beaucage, S.L. (2001) Strategies in the preparation of DNA oligonucleotide arrays for diagnostic applications. Curr. Med. Chem., V. 8, N 10, P. 1213-44.

322. Forget, D., Boturyn, D., Defrancq, E., Lhomme, J., Dumy, P. (2001) Highly efficient synthesis of peptide-oligonucleotide conjugates: chemoselective oxime and thiazolidine formation. Chem. Eur. J., V. 7, N 18, P. 3976-3984.

323. Tam, J. P., Spetzler, J. C. (1995) Chemoselective approaches to the preparation of peptide dendrimers and branched artificial proteins using unprotected peptides as building blocks. Biomedical Peptides, Proteins & Nucleic Acids, V. 1, N 3, P. 123-132.

324. Stetsenko, D. A,, Gait, M. J. (2000) Efficient conjugation of peptides to oligonucleotides by "native ligation". J. Org. Chem., V. 65, N 16, P. 4900-4908.

325. McPherson, M. C., Wright, M., Lohse, P. A. (1999) Synthesis of an RNA-peptide conjugate by orthogonal ligation. SynLett, N SI, P. 978-980.

326. Stetsenko, D. A., Gait, M. J. (2000) New phosphoramidite reagents for the synthesis of oligonucleotides containing a cysteine residue useful in peptide conjugation. Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, V. 19, N 10-12, P. 1751-1764.

327. Shao, J., Tam, J. P. (1995) Unprotected peptides as building blocks for the synthesis of peptide dendrimers with oxime, hydrazone, and thiazolidine linkages. J. Am. Chem. Soc., V. 117, N8, P. 3893-3899.

328. Rose, K. (1994) Facile synthesis of homogeneous artificial proteins. J. Am. Chem. Soc., V. 116, N 1,P. 30-33.

329. Canne, L. £., Ferre-D 'Amare, A. R., Burley, S. K, Kent, S. В. H. (1995) Total chemical synthesis of a unique transcription factor-related protein: cMyc-Max. J. Am. Chem. Soc., V. 117, N, P. 2998-3007.

330. Defrancq, E., Lhomme, J. (2001) Use of an aminooxy linker for the functionalization of oligodeoxyribonucleotides. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 11, P. 931-933.

331. Cebon, В., Lambert, J. N., Leung, D., Mackie, K, McCluskey, K.L., Nguyen, H., Tassone, C. (2000) New DNA Modification Strategies Involving Oxime Formation. Austr. J. Chem., V. 53, 333-340.

332. Hamma, Т., Miller, P. S. (2003) 4-(2-Aminooxyethoxy)-2-(ethylureido)quinoline-oligonucleotide conjugates: synthesis, binding interactions, and derivatization with peptides. Bioconjugate Chem., V. 14, N 2, P. 320-330.

333. Boncheva, M., Scheibler, L., Lincoln, P., Vogel, H., Akerman, B. (1999) Design of oligonucleotide arrays at interfaces. Langmuir, V. 15, N 13, P. 4317-5320.

334. Defrancq, E., Hoang, A, Vinet, F., Dumy, P. (2003) Oxime bond formation for covalent attachment of oligonucleotides on glass support. Bioorg. Med. Chem. Lett., V. 13, P. 2683-2686.

335. Bergbreiter, D.E., Momongan, M.R. (1991) Hydrazones. Comprehensive organic synthesis: selectivity, strategy, and efficiency in modern organic chemistry. Vol. 2. (B.M. Trost, J. Flemming, Eds.), pp 503-526, Pergamon press, New York, NY.

336. Ghosh, G., Duyne, G.V., Ghosh, S., Sigler, P.B. (1995) Structure of NF-kappa В p50 homodimer bound to a kappa В site. Nature, V. 373, P. 303-310.

337. Stetsenko, D.A., Gait, M.J. (2001) A convenient solid-phase method for synthesis of 3'-conjugates of oligonucleotides. Bioconjugate Chem., V. 12, N 4, P. 576-586.

338. Song, Q., Jones, R.A. (1999) Use of silyl esthers as fluorine scavengers in RNA synthesis. Tetrahedron Lett., V. 40, N 25, P. 4653-4654.

339. Arzumanov, A., Walsh, A.P., Rajwanshi, V.K., Kumar, R., Wengel, J., Gait, M.J. (2001) Inhibition of HIV-1 Tat-dependent trans activation by steric block chimeric T-O-methyl/LNA oligoribonucleotides. Biochemistry, V. 40, N 48, P. 14645-14654.

340. Lehn, J.M., Eliseev, A.V. (2002) Drug discovery by dynamic combinatorial libraries. Nat. Rev. Drug. Discov., V. 1, N 1, P. 26-36.

341. Ramstrom, O., Bunyapaiboonsri, Т., Lohmann, S., Lehn, J.-M. (2002) Chemical biology of dynamic combinatorial libraries. Biochim. Biophys. Acta, V. 1572, N 2-3, P. 178— 186.

342. Bergamin, M., Da Ros, Т., Spalluto, G., Boutorine, A., Prato, M. (2001) Synthesis of a hybrid fullerene trimethoxyindole oligonucleotide conjugate. Chem. Commun., N 1, P. 17-18.

343. Grotli, M., Eritja, R., Sproat, B. (1997) Solid-phase synthesis of branched RNA and branched DNA/RNA chimeras. Tetrahedron, V. 53, N 33, P. 11317-11346.

344. Sekine, M. (1989) General method for the preparation of N3- and 04-substituted uridine derivatives by phase-transfer reactions. J. Org. Chem., V. 54, N 10, P. 2321-2326.

345. Guibe, F. (1998) Allylic protecting groups and their use in complex enviroment. Part 2: Allylic protecting groups and their removal through catalytic palladium 7t-allyl methodology. Tetrahedron, V. 54, N 13, P. 2967-3042.

346. Hayakawa, Y., Kato, H., Uchiyama, M., Kajino, H, Noyori, R. (1986) Allyloxycarbonyl group: a versatile blocking group for nucleotide synthesis. J. Org. Chem., V. 51, N 12, P. 2400-2402.

347. Hayakawa, Y., Hirose, M., Noyori, R. (1993) O-Allyl protection of guanine and thymine residues in oligodeoxyribonucleotides. J. Org. Chem., V. 58, N 20, P. 5551-5555.

348. Colb, H.C., Finn, M.G., Sharpless, K.B. (2001) Click chemistry: diverse chemical function from a few good reactions. Angew. Chem. Int. Ed., V. 40, N 11, P. 2004-2021.

349. Jaschke, A., Seelig, B. (1997) Site-specific modification of enzymatically synthesized RNA: transcription initiation and Diels-Alder reaction. Tetrahedron Lett., V. 38, N 44, P. 7729-7732.

350. Hill, K. W., Taunton-Rigby, J., Carter, J. D„ Kropp, E„ Vagle, K„ Pieken, W., McGee, D. P. C., Husar, G. M., Leuck, M., Anziano, D. J., Sebesta, D. P. Diels-Alder bioconjugation of diene-modified oligonucleotides J. Org. Chem., V. 66, N 16, 53525358.

351. Graham, D„ Grondin, A., McHugh, C., Fruk, L„ Smith, W.E. (2002) Internal labeling of oligonucleotide probes by Diels-Alder cycloaddition. Tetrahedron Letters, V. 43, N 27, P. 4785-^788.

352. Seo, T.S., Li, Z., Ruparel, H., Ju, J. (2003) Click chemistry to construct fluorescent oligonucleotides for DNA sequencing. J. Org. Chem., V. 68, N 2, P. 609-612.

353. Basu, A.K., O'Hara, S.M., Valladier, P., Stone, K„ Mols, O., Marnett, L.J. (1988) Identification of adducts formed by reaction of guanine nucleosides with malondialdehyde and structurally related aldehydes. Chem. Res. Toxicol., V. 1, N 1, P. 53-59.

354. Otteneder, M„ Plastaras, J.P., Marnett, L.J. (2002) Reaction of malondialdehyde-DNA adducts with hydrazines-development of a facile assay for quantification of malondialdehyde equivalents in DNA. Chem. Res. Toxicol., V. 15, N 3, P. 312-318

355. Kimel, O., Budzikiewicz, H. (1999) Synthesis and biological evaluation of pyoverdin-p-lactam conjugate: a new type of arginine-specific cross-linking in aqueous solution. J. Peptide Res., V. 53, N 6, P. 618-625.

356. Dalcanale, E., Montanari, F. (1986) Selective oxidation of aldehydes to carboxylic acids with sodium chlorite-hydrogen peroxide. J. Org. Chem., V. 51, N 4, P. 567-569

357. Kremsky, J.N., Wooters, J.L., Dougherty, J.P., Meyers, R.E., Collins, M., Brown E.L. (1987) Immobilization of DNA via oligonucleotides containing an aldehyde or carboxylic acid group at the 5' terminus. Nucleic Acids Res., V. 15, N 7, P. 2891-2909.

358. Scriven, E. F. V., Turmbull, К (1988) Azides: their preparation and synthetic uses. Chem. Rev., V. 88, N 2, P. 297-368.

359. Staudinger H., Meyer J. (1919) Synthesis of phosphazo compounds by the reaction of tertiary phosphines with organic azides. Helv. Chim. Acta, V. 2, N 6, P. 635- 646.

360. Gololobov, Yu. G., Gusar, N. I., Chaus, M. P. (1981) Reactions of trivalent phosphorus compounds with azides containing a mobile H-atom. A conception of phosphazo-compound spirocyclization mechanism. Tetrahedron, V. 41, N 4, P. 793-800.

361. Dreyer, G.B., Dervan, P.B. (1985) Sequence-specific cleavage of single-stranded DNA: oligodeoxynucleotide-EDTA X Fe(II). Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 82, N 4, P. 968972.

362. Han, H., Dervan, P.B. (1993) Sequence-specific recognition of double helical RNA and RNA.DNA by triple helix formation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, V. 90, N 9, P. 38063810.

363. Kent, OA., MacMillan, A.M. (2002) Early organization of pre-mRNA during spliceosome assembly. Nat. Struct. Biol., V. 9, N 8, P. 576-581.

364. Jonklaas, M.D., Kane, R.R. (2000) The synthesis of 30- and 50-iminodiacetic acid derivatives of thymidine and their incorporation into synthetic oligonucleotides. Tetrahedron Letters, V. 41, N 21, P. 4035-4037.

365. Deoxyuridine derivatives for internal modification. (1993) Glen Reports, 6

366. Spetzler, J. C., Tam, J. P. (1995) Unprotected peptides as building blocks for branched peptides and peptide dendrimers. Int. J. Peptide Protein Res., V. 45, N 1, P. 78-85.

367. Bonnet, D., Ollivier, N., Gras-Masse, H., Melnyk, O. (2001) Chemoselective acylation of fully deprotected hydrazino acetyl peptides. Application to the synthesis of lipopetides. J. Org. Chem., V. 66, N 2, P. 443-449.

368. Bonnet, D., Grandjean, C., Rousselot-Pailley, P., Joly, P., Bourel-Bonnet, L., Santraine, V., Gras-Masse, H., Melnyk, O. (2003) Solid-phase functionalization of peptides by an alpha-hydrazinoacetyl group. J. Org. Chem., V. 68, N 18, P. 7033-7040.

369. Leng, N., Grasso, P., Deziel, M. R., Reichert, L. E. (1995) A synthetic peptide corresponding to glycoprotein hormone alpha subunit residues 32-46 inhibits gonadotropin binding to receptor. Peptide Res., V. 8, N 5, P. 272-277.

370. Kalderon, D., Roberts, B. L., Richardson, W. D., Smith, A. E. (1984) A short amino acid sequence able to specify nuclear location. Cell, V. 39, N 3 Pt 2, P. 499-509.

371. Sakamoto, N., Iwahana, M., Tanaka, N. G., Osada, Y. (1991) Inhibition of angiogenesis and tumor growth by a synthetic laminin peptide, CDPGYIGSR-NH2. Cancer Res., V. 51, N 3, P. 903-906.

372. Vives, E., Brodin, P., Lebleu, B. (1997) A truncated HIV-1 Tat protein basic domain rapidly translocates through the plasma membrane and accumulates in the cell nucleus. J. Biol. Chem., V. 272, N 25, P. 16010-16017.

373. Perez, F., Joliot, A., Bloch-Gallego, E., Zahraoui, A., Triller, A., Prochiantz, A. (1992) Antennapedia homeobox as a signal for the cellular internalization and nuclear addressing of a small exogenous peptide. J. Cell Sci., V. 102, N 4, P. 717-722.

374. Pooga, M., Hallbrink, M., Zorko, M, Langel, U. (1998) Cell penetration by transportan. FASEB J., V. 12, N 1, P. 67-77.

375. Gait, M.J. (2003) Peptide-mediated cellular delivery of antisense oligonucleotides and their analogues. Cell Mol. Life Sci., V. 60, N 5, P. 844-853.

376. Moulton, H.M., Moulton, J.D. (2003) Peptide-assisted delivery of steric-blocking antisense oligomers. Curr. Opin. Mol. Ther., V. 5, N 2, P. 123-132.

377. Wei, Z., Tung, С. H., Zhu, Т., Stein, S. (1994) Synthesis of oligoarginine-oligonucleotide conjugates and oligoarginine-bridged oligonucleotide pairs. Bioconjugate Chem., V. 5, N 5, P. 468-474.

378. Astriab-Fisher, A., Sergueev, D.S., Fisher, M., Shaw, B.R., Juliano, R.L. (2000) Antisense inhibition of P-g.ycoprotein expression using peptide-oligonucleotide conjugates. Biochem. Pharmacol., V.60, N 1, P. 83-90.

379. Reed, M. W., Fraga, D„ Schwartz, D. E„ Scholler, J., Hinrichsen, R. D. (1995) Synthesis and evaluation of nuclear targeting peptide-antisense oligodeoxynucleotide conjugates. Bioconjugate Chem., V. 6, N 1, P. 101-108.

380. Esposilo, D., Craigie, R. (1998) Sequence specificity of viral end DNA binding by HIV-1 integrase reveals critical regions for protein-DNA interaction. EMBO J., V. 17, N 19, P. 5832-5843.

381. Arzumanov, A., Walsh, A. P., Liu, X., Rajwanshi, V. K, Wengel, J., Gait, M. J. (2001) Oligonucleotide analogue interference with the HIV-1 Tat protein-TAR RNA interaction. Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, V. 20, N 4-7, P. 471-480.

382. Arzumanov, A., Walsh, A. P., Rajwanshi, V. K, Kumar, R., Wengel, J., Gait, M. J. (2001) Inhibition of HIV-1 Tat-dependent trans activation by steric block chimeric 2'-0-methyl/LNA oligoribonucleotides. Biochemistry, V. 40, N 48, P. 14645-14654.

383. Chico, D.E., Given, R.L., Miller, B.T. (2003) Binding of cationic cell-permeable peptides to plastic and glass. Peptides, V. 24, N 1, P. 3-9.

384. Sproat B.S., Iribarren A.I., Garcia R.G., Beijer B. (1991) New synthetic routes to synthons suitable for 2'-0-allyloligoribonucleotide assembly. Nucleic Acids Res., V. 19, N4, P. 733-738.

385. Lawrence, A.J., Pavey, J.B.J., O'Neil, I.A., Cosstick, R. (1996) Synthesis and properties of 2'-deoxy-2'-a-C-branched nucleosides and nucleotides. J. Org. Chem.,V. 61, N 8, P. 9213-9222.

386. Holy, A., Soucek, M. (1971) Benzoyl cyanide a new benzoylating agent in nucleoside and nucleotide chemistry. Tetrahedron Lett., V. 12, N 1, P. 185-188.

387. Jones, R.A. Preparation of protected deoxyribonucleotides. // Oligonucleotide synthesis: a practical approach. (Ed. M.J. Gait). Oxford, Washington DC: IRL Press, P. 23-34 (1984)

388. Beaucage S.L. Protocols for oligonucleotides and analogs; synthesis and properties. (Ed. S. Agrawal) Humana Press Inc. New Jersey 07512. P. 33-63 (1993).

389. Meldgaard, M., Nielsen, N.K., Bremner, M, Pedersen, OS., Olsen, C.E., Wengel, J. (1997) Automated synthesis of branched oligodeoxynucleotide analogues using arabino-uridine as branching nucleotide. J. Chem. Soc., Perkin Trans. I, P. 1951-1955.

390. Sproat, B.S., Iribarren, A., Beijer, В., Pieles, U„ Lamond, A.I. (1991) 2'-0-Alkyloligoribonucleotides: synthesis and applications in studying RNA splicing. V. 10, N 1,P. 25-36.

391. Walcher, G., Pfleiderer, W. (1996) 93. Synthesis of 2'-amino-2'-deoxyarabinonucleoside phosphoramidite building blocks. Helv. Chim. Acta, V. 79, N 4, P. 1067-1074.

392. Carpino, L.A., El-Faham, A., Minor, C.A., Albericio, F. (1994) Advantageous applications of azabenzotriazole (triazolopyridine)-based coupling reagents to solid-phase peptide synthesis. J. Chem. Soc. Chem. Commun., N 1, P. 201-202.